{
"MLE":{
"content":{
"0":{
"by-branch":{
"AVERAGED": [
[522.6134926270565, 1219.758644363603, 0, 1, 0.2999436696282858, 0, 0.0008198343210117116, 0.01187691000792038, 0.7000563303717142, 1, 0.0005764154659945042],
[522.4972139720541, 1220.083237102147, 0, 1, 0.2998410854718154, 0, 0.0008196162110833745, 0.01187375025731675, 0.7001589145281846, 1, 0.0005763338616949628],
[522.4238200053953, 1220.073507395625, 0, 0, 0.2998132690307216, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002132280612590629],
[522.6134926270565, 1219.721990982246, 0, 1, 0.2999499795208477, 0, 0.0008198589575274419, 0.01187726691622824, 0.7000500204791523, 1, 0.0004557237059907907],
[522.8871666240389, 1219.610160776981, 1, 0, 0.3000791785453918, 0.001912458487853862, 0, -0.02770571659660895, 1, 0.3000791785453918, 0.0004669703722810026],
[522.4238200053953, 1220.073507395625, 1, 0, 0.2998132690307216, 0.001914154679986974, 0, -0.02773028927038559, 1, 0.2998132690307216, 0.0004557237059907907],
[522.4238200053953, 1220.073507395625, 1, 0, 0.2998132690307216, 0.001914154679986974, 0, -0.02773028927038559, 1, 0.2998132690307216, 0.0004557237059907907],
[522.4238200053953, 1220.073507395625, 1, 0, 0.2998132690307216, 0.001914154679986974, 0, -0.02773028927038559, 1, 0.2998132690307216, 0.0002898072731443158],
[522.4238200053953, 1220.073507395625, 0, 0, 0.2998132690307216, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000286507536992984],
[522.4238200053953, 1220.073507395625, 1, 0, 0.2998132690307216, 0.001914154679986974, 0, -0.02773028927038559, 1, 0.2998132690307216, 0.0005761038704591663],
[522.4238200053953, 1219.911663603907, 0, 1, 0.2998411183839166, 0, 0.000819731485348508, 0.01187542023140557, 0.7001588816160834, 1, 0.0005762289071134239],
[522.2001270421106, 1220.29720035891, 1, 0, 0.29968489410597, 0.001914974639443853, 0, -0.02774216799323227, 1, 0.29968489410597, 0.0004669703722810026],
[522.4238200053953, 1220.073507395625, 0, 1, 0.2998132690307216, 0, 0.000819622747267585, 0.01187384494677982, 0.7001867309692784, 1, 0.000340389150509043],
[522.4972139720541, 1220.235351187342, 0, 1, 0.2998149138988888, 0, 0.0008195140380312341, 0.01187227008002433, 0.7001850861011112, 1, 0.0005762782447828254],
[522.2619762136777, 1220.235351187342, 0, 1, 0.2997203886634621, 0, 0.0008195140380312341, 0.01187227008002433, 0.7002796113365379, 1, 0.0004557237059907907],
[522.4238200053953, 1220.073507395625, 0, 1, 0.2998132690307216, 0, 0.000819622747267585, 0.01187384494677982, 0.7001867309692784, 1, 0.0005765117944022269],
[522.4238200053953, 1220.073507395625, 1, 0, 0.2998132690307216, 0.001914154679986974, 0, -0.02773028927038559, 1, 0.2998132690307216, 0.0004557237059907907],
[522.2619762136777, 1220.235351187342, 0, 1, 0.2997203886634621, 0, 0.0008195140380312341, 0.01187227008002433, 0.7002796113365379, 1, 0.0004557237059907907],
[522.5267384553014, 1219.936568604095, 0, 1, 0.2998781875855534, 0, 0.0008197147505335003, 0.01187517779474886, 0.7001218124144466, 1, 0.0002906548466282587],
[522.4238200053953, 1220.073507395625, 0, 0, 0.2998132690307216, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002855990022825408],
[522.4972139720541, 1220.235351187342, 0, 1, 0.2998149138988888, 0, 0.0008195140380312341, 0.01187227008002433, 0.7001850861011112, 1, 0.0005761969236873843],
[522.7959965553014, 1219.701330845719, 0, 1, 0.3000268570483635, 0, 0.0008198728448599938, 0.01187746810151012, 0.6999731429516365, 1, 0.000447351632815207],
[522.4238200053953, 1220.073507395625, 0, 1, 0.2998132690307216, 0, 0.000819622747267585, 0.01187384494677982, 0.7001867309692784, 1, 0.0004463201113525578],
[522.4238200053953, 1220.073507395625, 0, 0, 0.2998132690307216, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001930458618498859],
[522.4238200053953, 1220.073507395625, 0, 1, 0.2998132690307216, 0, 0.000819622747267585, 0.01187384494677982, 0.7001867309692784, 1, 0.000383220386544916],
[522.1681731052074, 1220.329154295812, 0, 0, 0.2996665560939682, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002034757863298949],
[522.2959965553014, 1220.201330845719, 0, 1, 0.2997399125623448, 0, 0.000819536886840553, 0.01187260108989439, 0.7002600874376552, 1, 0.0003728032082332511],
[522.173439184673, 1220.323888216347, 0, 0, 0.2996695782388994, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002191905622867597],
[522.2986295950342, 1220.198697805986, 1, 0, 0.2997414236348105, 0.001914613486111103, 0, -0.02773693597802846, 1, 0.2997414236348105, 0.0003571204406352741],
[522.4238200053953, 1220.073507395625, 0, 1, 0.2998132690307216, 0, 0.000819622747267585, 0.01187384494677982, 0.7001867309692784, 1, 0.0005765240259985086],
[522.4238200053953, 1220.073507395625, 0, 1, 0.2998132690307216, 0, 0.000819622747267585, 0.01187384494677982, 0.7001867309692784, 1, 0.0005762209906525557],
[522.2986295950342, 1220.198697805986, 1, 0, 0.2997414236348104, 0.001914613486111103, 0, -0.02773693597802846, 1, 0.2997414236348104, 0.0005765360279060446],
[522.0723035920166, 1220.425023809004, 0, 1, 0.2996115376375934, 0, 0.0008193866730780014, 0.0118704249485765, 0.7003884623624066, 1, 0.0005764333938032365],
[522.4238200053953, 1220.073507395625, 1, 0, 0.2998132690307216, 0.001914154679986974, 0, -0.02773028927038559, 1, 0.2998132690307216, 0.0005761004419739237],
[522.4238200053953, 1220.073507395625, 1, 0, 0.2998132690307216, 0.001914154679986974, 0, -0.02773028927038559, 1, 0.2998132690307216, 0.0005763991342949045],
[522.2619762136777, 1220.235351187342, 0, 1, 0.2997203886634621, 0, 0.0008195140380312341, 0.01187227008002433, 0.7002796113365379, 1, 0.0005763980400221848],
[522.2959965553014, 1220.201330845719, 0, 1, 0.2997399125623448, 0, 0.000819536886840553, 0.01187260108989439, 0.7002600874376552, 1, 0.0005764493355307837],
[522.2959965553014, 1220.201330845719, 0, 1, 0.2997399125623448, 0, 0.000819536886840553, 0.01187260108989439, 0.7002600874376552, 1, 0.0005763720650495406],
[522.2986295950342, 1220.198697805986, 1, 0, 0.2997414236348105, 0.001914613486111103, 0, -0.02773693597802846, 1, 0.2997414236348105, 0.0004500554624616891],
[522.4238200053953, 1220.073507395625, 0, 1, 0.2998132690307216, 0, 0.000819622747267585, 0.01187384494677982, 0.7001867309692784, 1, 0.0004326387905938163],
[522.4238200053953, 1220.073507395625, 1, 0, 0.2998132690307216, 0.001914154679986974, 0, -0.02773028927038559, 1, 0.2998132690307216, 0.0005764010201996513],
[522.4972139720541, 1220.463460047609, 0, 1, 0.2997756758143353, 0, 0.0008193608680107397, 0.01187005111150508, 0.7002243241856647, 1, 0.000576401338063202],
[522.4238200053953, 1220.036854014268, 0, 1, 0.2998195757269067, 0, 0.0008196473710689276, 0.01187420167089481, 0.7001804242730933, 1, 0.0004476906798737341],
[522.4238200053953, 1220.073507395625, 1, 0, 0.2998132690307216, 0.001914154679986974, 0, -0.02773028927038559, 1, 0.2998132690307216, 0.0004386074779741239],
[522.5490104157566, 1219.945683945531, 1, 0, 0.2998855675754566, 0.001913696093701083, 0, -0.02772364574753127, 1, 0.2998855675754566, 0.0004385045528542714],
[522.2959965553014, 1220.201330845719, 0, 1, 0.2997399125623449, 0, 0.0008195368868405532, 0.01187260108989439, 0.7002600874376551, 1, 0.0004476906798737341],
[522.5856637971131, 1219.911663603907, 0, 1, 0.2999061493979811, 0, 0.000819731485348508, 0.01187542023140557, 0.7000938506020189, 1, 0.0004386074779741239],
[522.9238200053953, 1219.573507395625, 0, 1, 0.3001002135167403, 0, 0.0008199587756997776, 0.01187871297846252, 0.6998997864832597, 1, 0.0004386074779741239],
[522.2986295950342, 1220.198697805986, 1, 0, 0.2997414236348105, 0.001914613486111103, 0, -0.02773693597802846, 1, 0.2997414236348105, 0.0004476906798737341],
[522.2986295950342, 1220.201330845719, 1, 0, 0.2997409707044828, 0.001914613486111103, 0, -0.02773693597802846, 1, 0.2997409707044828, 0.0004476906798737341],
[522.4238200053953, 1220.073507395625, 1, 0, 0.2998132690307216, 0.001914154679986974, 0, -0.02773028927038559, 1, 0.2998132690307216, 0.0004386074779741239],
[522.4238200053953, 1220.073507395625, 1, 0, 0.2998132690307216, 0.001914154679986974, 0, -0.02773028927038559, 1, 0.2998132690307216, 0.0004476906798737341],
[522.2959965553014, 1220.201330845719, 0, 1, 0.2997399125623448, 0, 0.000819536886840553, 0.01187260108989439, 0.7002600874376552, 1, 0.0004476906798737341],
[522.3871666240389, 1220.110160776981, 0, 1, 0.2997922340593732, 0, 0.0008195981249456914, 0.01187348824409755, 0.7002077659406268, 1, 0.0004500554624616891],
[522.2986295950342, 1220.198697805986, 1, 0, 0.2997414236348104, 0.001914613486111103, 0, -0.02773693597802846, 1, 0.2997414236348104, 0.0005764938970395447],
[522.4238200053953, 1220.073507395625, 1, 0, 0.2998132690307216, 0.001914154679986974, 0, -0.02773028927038559, 1, 0.2998132690307216, 0.0004476906798737341],
[522.4238200053953, 1220.073507395625, 0, 1, 0.2998132690307216, 0, 0.000819622747267585, 0.01187384494677982, 0.7001867309692784, 1, 0.0004476906798737341],
[522.4238200053953, 1220.073507395625, 1, 0, 0.2998132690307216, 0.001914154679986974, 0, -0.02773028927038559, 1, 0.2998132690307216, 0.0004476906798737341],
[522.4238200053953, 1220.073507395625, 1, 0, 0.2998132690307216, 0.001914154679986974, 0, -0.02773028927038559, 1, 0.2998132690307216, 0.0005764250185002919],
[522.4238200053953, 1219.911663603907, 0, 1, 0.2998411183839166, 0, 0.000819731485348508, 0.01187542023140557, 0.7001588816160834, 1, 0.0004476906798737341],
[522.4238200053953, 1220.036854014268, 0, 1, 0.2998195757269067, 0, 0.0008196473710689276, 0.01187420167089481, 0.7001804242730933, 1, 0.0004476906798737341],
[522.0723035920166, 1220.425023809004, 0, 1, 0.2996115376375934, 0, 0.0008193866730780014, 0.0118704249485765, 0.7003884623624066, 1, 0.0004476906798737341],
[522.0723035920166, 1220.425023809004, 0, 1, 0.2996115376375934, 0, 0.0008193866730780014, 0.0118704249485765, 0.7003884623624066, 1, 0.0004476745536323197],
[522.9238200053953, 1219.573507395625, 0, 1, 0.3001002135167403, 0, 0.0008199587756997776, 0.01187871297846252, 0.6998997864832597, 1, 0.0005762483825148633],
[522.4238200053953, 1220.073507395625, 0, 0, 0.2998132690307216, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001354005294165274],
[522.4238200053953, 1220.073507395625, 1, 0, 0.2998132690307216, 0.001914154679986974, 0, -0.02773028927038559, 1, 0.2998132690307216, 0.0004408513952691452],
[521.7207871786378, 1220.776540222382, 0, 0, 0.2994098062444652, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001354005048833686],
[522.0723035920166, 1220.425023809003, 0, 1, 0.2996115376375934, 0, 0.0008193866730780015, 0.0118704249485765, 0.7003884623624066, 1, 0.0004408513952691452],
[522.2986295950342, 1220.198697805986, 1, 0, 0.2997414236348105, 0.001914613486111103, 0, -0.02773693597802846, 1, 0.2997414236348105, 0.000576394773377104],
[522.0723035920166, 1220.425023809004, 0, 1, 0.2996115376375934, 0, 0.0008193866730780014, 0.0118704249485765, 0.7003884623624066, 1, 0.0005764031863253457],
[522.4238200053953, 1220.073507395625, 1, 0, 0.2998132690307216, 0.001914154679986974, 0, -0.02773028927038559, 1, 0.2998132690307216, 0.0003420925551524245],
[522.4238200053953, 1219.911663603907, 0, 1, 0.2998411183839166, 0, 0.000819731485348508, 0.01187542023140557, 0.7001588816160834, 1, 0.0005765255848477788],
[522.4238200053953, 1220.073507395625, 0, 0, 0.2998132690307216, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002348837507829741],
[522.4238200053953, 1220.073507395625, 1, 0, 0.2998132690307216, 0.001914154679986974, 0, -0.02773028927038559, 1, 0.2998132690307216, 0.0003414809730412617],
[522.0723035920166, 1220.425023809004, 0, 1, 0.2996115376375934, 0, 0.0008193866730780014, 0.0118704249485765, 0.7003884623624066, 1, 0.0004476906798737341],
[522.5490104157566, 1219.948316985264, 1, 0, 0.2998851144266327, 0.001913696093701083, 0, -0.02772364574753127, 1, 0.2998851144266327, 0.0004385045528542714],
[522.4238200053953, 1220.073507395625, 0, 1, 0.2998132690307216, 0, 0.000819622747267585, 0.01187384494677982, 0.7001867309692784, 1, 0.0004465383805843979],
[522.2986295950342, 1220.073507395625, 1, 0, 0.2997629602233672, 0.001914613486111103, 0, -0.02773693597802846, 1, 0.2997629602233671, 0.0005764546367666524],
[522.2986295950342, 1220.073507395625, 1, 0, 0.2997629602233672, 0.001914613486111103, 0, -0.02773693597802846, 1, 0.2997629602233671, 0.0005765403435298823],
[522.4238200053953, 1220.073507395625, 0, 1, 0.2998132690307216, 0, 0.000819622747267585, 0.01187384494677982, 0.7001867309692784, 1, 0.0005761784842127012],
[522.4238200053953, 1219.911663603907, 0, 1, 0.2998411183839166, 0, 0.000819731485348508, 0.01187542023140557, 0.7001588816160834, 1, 0.0005768599824713692],
[522.4238200053953, 1220.073507395625, 0, 1, 0.2998132690307216, 0, 0.000819622747267585, 0.01187384494677982, 0.7001867309692784, 1, 0.0005763935466298634],
[522.4238200053953, 1220.073507395625, 0, 1, 0.2998132690307216, 0, 0.000819622747267585, 0.01187384494677982, 0.7001867309692784, 1, 0.0005764015235296935],
[522.150146008413, 1220.185337600889, 1, 0, 0.2996840453061099, 0.001915157943829987, 0, -0.02774482351721117, 1, 0.2996840453061098, 0.0005764594569516583],
[522.4238200053953, 1220.073507395625, 1, 0, 0.2998132690307216, 0.001914154679986974, 0, -0.02773028927038559, 1, 0.2998132690307216, 0.0005764183331763737],
[522.8871666240389, 1219.610160776981, 0, 1, 0.3000791785453918, 0, 0.00081993413318476, 0.01187835598324321, 0.6999208214546082, 1, 0.0005767434482788476],
[521.4238200053953, 1221.073507395625, 1, 0, 0.2992393800586842, 0.001917825695016489, 0, -0.02778347113167857, 1, 0.2992393800586842, 0.0005764103175913445],
[521.4238200053953, 1221.073507395625, 0, 0, 0.2992393800586842, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001981861276579744],
[521.9238200053953, 1220.573507395625, 0, 1, 0.2995263245447029, 0, 0.0008192869941391165, 0.01186898090341216, 0.7004736754552972, 1, 0.0003780973710644398],
[522.6134926270565, 1219.758644363603, 0, 1, 0.2999436696282858, 0, 0.0008198343210117116, 0.01187691000792038, 0.7000563303717142, 1, 0.0005764892939359726],
[522.363111806334, 1219.977637882434, 0, 1, 0.2998053692422927, 0, 0.0008196871556889697, 0.0118747780292392, 0.7001946307577074, 1, 0.0005763650905642188],
[522.2986295950342, 1220.201330845719, 1, 0, 0.2997409707044828, 0.001914613486111103, 0, -0.02773693597802846, 1, 0.2997409707044828, 0.0005765623285762168],
[522.6134926270565, 1219.721990982246, 0, 1, 0.2999499795208477, 0, 0.0008198589575274419, 0.01187726691622824, 0.7000500204791523, 1, 0.0005763251643189415],
[522.7959965553014, 1219.701330845719, 0, 1, 0.3000268570483636, 0, 0.0008198728448599939, 0.01187746810151012, 0.6999731429516365, 1, 0.0005762113964373422],
[522.4238200053953, 1220.000200632912, 0, 0, 0.2998258826884253, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002745723254283645],
[522.4238200053953, 1220.036854014268, 0, 1, 0.2998195757269067, 0, 0.0008196473710689276, 0.01187420167089481, 0.7001804242730933, 1, 0.0003017103322899163],
[522.3370658336403, 1220.16026156738, 1, 1, 0.2997634817682731, 0.001914472599037211, 0.0008195644715682112, -0.01586189424326889, 0.9101418549981624, 0.5096688185347082, 0.001153112379281558],
[522.10013242196, 1220.329154295812, 0, 0, 0.2996392085474207, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001785125465861646],
[522.2619762136777, 1220.201330845719, 0, 1, 0.2997262404882739, 0, 0.000819536886840553, 0.01187260108989439, 0.7002737595117261, 1, 0.0003977426158105421],
[522.3871666240389, 1220.110160776981, 0, 1, 0.2997922340593732, 0, 0.0008195981249456914, 0.01187348824409755, 0.7002077659406268, 1, 0.0005765215200622789],
[522.4238200053953, 1220.073507395625, 0, 0, 0.2998132690307216, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001842739603199826],
[522.4238200053953, 1220.073507395625, 0, 1, 0.2998132690307216, 0, 0.000819622747267585, 0.01187384494677982, 0.7001867309692784, 1, 0.0003919803892909214],
[522.4238200053953, 1220.073507395625, 0, 1, 0.2998132690307216, 0, 0.000819622747267585, 0.01187384494677982, 0.7001867309692784, 1, 0.0005762368664560039],
[522.2959965553014, 1220.201330845719, 1, 0, 0.2997399125623448, 0.001914623138211473, 0, -0.02773707580765568, 1, 0.2997399125623448, 0.0005763712362672042],
[522.4238200053953, 1220.073507395625, 0, 0, 0.2998132690307216, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002497272678054527],
[522.4238200053953, 1220.073507395625, 0, 1, 0.2998132690307216, 0, 0.000819622747267585, 0.01187384494677982, 0.7001867309692784, 1, 0.000326639168300426],
[522.6134926270565, 1219.758644363603, 0, 1, 0.2999436696282858, 0, 0.0008198343210117116, 0.01187691000792038, 0.7000563303717142, 1, 0.0005764224804938452],
[522.2959965553014, 1220.456977745907, 1, 0, 0.2996959432903716, 0.001914623138211473, 0, -0.02773707580765568, 1, 0.2996959432903716, 0.0005763744443572896],
[522.4238200053953, 1220.329154295812, 0, 1, 0.2997692889979842, 0, 0.0008194510444004325, 0.01187135749358469, 0.7002307110020158, 1, 0.0005764107001414348],
[522.4238200053953, 1220.329154295812, 1, 0, 0.2997692889979842, 0.001914154679986974, 0, -0.02773028927038559, 1, 0.2997692889979842, 0.000576283040256657],
[522.8871666240389, 1219.865807677169, 0, 1, 0.3000351595060115, 0, 0.0008197622998419549, 0.01187586663985205, 0.6999648404939885, 1, 0.0004408970728436324],
[522.7753364187741, 1219.977637882434, 0, 1, 0.2999709907988489, 0, 0.0008196871556889697, 0.0118747780292392, 0.7000290092011512, 1, 0.0005761740814287432],
[522.4238200053953, 1220.329154295812, 1, 0, 0.2997692889979842, 0.001914154679986974, 0, -0.02773028927038559, 1, 0.2997692889979842, 0.0005762786414276981],
[522.2619762136776, 1220.49099808753, 0, 1, 0.2996764222554772, 0, 0.0008193423807033133, 0.0118697832865544, 0.7003235777445227, 1, 0.000576226389483788],
[522.4238200053953, 1220.329154295812, 0, 2, 0.2997692889979842, 0, 0.001638902088800865, 0.02374271498716939, 0.4903230486303886, 1, 0.001152585081626056],
[522.4238200053953, 1220.329154295812, 0, 1, 0.2997692889979842, 0, 0.0008194510444004325, 0.01187135749358469, 0.7002307110020158, 1, 0.0005765582540711664],
[522.4238200053953, 1220.329154295812, 0, 1, 0.2997692889979842, 0, 0.0008194510444004325, 0.01187135749358469, 0.7002307110020158, 1, 0.0005761565109998962],
[522.4238200053953, 1220.329154295812, 1, 0, 0.2997692889979842, 0.001914154679986974, 0, -0.02773028927038559, 1, 0.2997692889979842, 0.0005759806838260657],
[522.4238200053953, 1220.201330845719, 0, 1, 0.2997912774013613, 0, 0.0008195368868405532, 0.01187260108989439, 0.7002087225986386, 1, 0.0005763494591690259],
[522.5516434554893, 1219.945683945531, 0, 1, 0.2998866254990982, 0, 0.0008197086256871817, 0.01187508906432288, 0.7001133745009018, 1, 0.0005763566573587016],
[522.2753364187741, 1220.221990982246, 0, 1, 0.2997280559378311, 0, 0.0008195230108867543, 0.01187240006945609, 0.7002719440621689, 1, 0.0005764539314616639],
[522.6134926270565, 1219.758644363603, 0, 1, 0.2999436696282858, 0, 0.0008198343210117116, 0.01187691000792038, 0.7000563303717142, 1, 0.0005764385831998638],
[522.4238200053953, 1220.073507395625, 0, 1, 0.2998132690307216, 0, 0.000819622747267585, 0.01187384494677982, 0.7001867309692784, 1, 0.0005763053649200356],
[522.4238200053953, 1220.073507395625, 1, 0, 0.2998132690307216, 0.001914154679986974, 0, -0.02773028927038559, 1, 0.2998132690307216, 0.0005763590506198604],
[522.5490104157566, 1220.073507395625, 1, 0, 0.2998635706096829, 0.001913696093701083, 0, -0.02772364574753127, 1, 0.2998635706096829, 0.0005761147492282594],
[522.4238200053953, 1220.073507395625, 1, 0, 0.2998132690307216, 0.001914154679986974, 0, -0.02773028927038559, 1, 0.2998132690307216, 0.0005766550158369045],
[522.4238200053953, 1220.073507395625, 1, 0, 0.2998132690307216, 0.001914154679986974, 0, -0.02773028927038559, 1, 0.2998132690307216, 0.0005765408092467208],
[522.4238200053953, 1220.073507395625, 0, 1, 0.2998132690307216, 0, 0.000819622747267585, 0.01187384494677982, 0.7001867309692784, 1, 0.000576564858258674],
[522.2986295950342, 1220.198697805986, 1, 0, 0.2997414236348105, 0.001914613486111103, 0, -0.02773693597802846, 1, 0.2997414236348105, 0.000576498670768992],
[522.5856637971131, 1219.911663603907, 0, 1, 0.2999061493979811, 0, 0.000819731485348508, 0.01187542023140557, 0.7000938506020189, 1, 0.0005763355329895644],
[522.1681731052074, 1220.329154295812, 1, 0, 0.2996665560939682, 0.001915091825787165, 0, -0.02774386566752816, 1, 0.2996665560939682, 0.0005768278427477758],
[522.2959965553014, 1220.201330845719, 0, 1, 0.2997399125623448, 0, 0.000819536886840553, 0.01187260108989439, 0.7002600874376552, 1, 0.0005765439471670401],
[522.4238200053953, 1220.073507395625, 0, 1, 0.2998132690307216, 0, 0.000819622747267585, 0.01187384494677982, 0.7001867309692784, 1, 0.0005765579105117387],
[522.4238200053953, 1220.073507395625, 0, 1, 0.2998132690307216, 0, 0.000819622747267585, 0.01187384494677982, 0.7001867309692784, 1, 0.0005761925587875308],
[522.7959965553014, 1219.701330845719, 0, 1, 0.3000268570483635, 0, 0.0008198728448599938, 0.01187746810151012, 0.6999731429516365, 1, 0.0005763741389683579],
[522.4238200053953, 1220.073507395625, 1, 0, 0.2998132690307216, 0.001914154679986974, 0, -0.02773028927038559, 1, 0.2998132690307216, 0.0005766857685633069],
[522.7753364187741, 1219.721990982246, 0, 1, 0.3000150004238498, 0, 0.0008198589575274419, 0.01187726691622824, 0.6999849995761502, 1, 0.0005761538127934822],
[522.2619762136776, 1220.235351187342, 0, 1, 0.2997203886634621, 0, 0.0008195140380312341, 0.01187227008002433, 0.7002796113365379, 1, 0.0005766857926109319],
[522.4238200053953, 1220.073507395625, 1, 0, 0.2998132690307216, 0.001914154679986974, 0, -0.02773028927038559, 1, 0.2998132690307216, 0.000576153812390775],
[522.4238200053953, 1220.073507395625, 0, 1, 0.2998132690307216, 0, 0.000819622747267585, 0.01187384494677982, 0.7001867309692784, 1, 0.000576449800021088]
],
"NAMES": [
["Node1425"],
["Node1418"],
["Node423"],
["Node1411"],
["Node1404"],
["Node1397"],
["Node437"],
["Node455"],
["Node454"],
["Node446"],
["Node463"],
["Node471"],
["Node1378"],
["Node1381"],
["Node1355"],
["Node1362"],
["Node1347"],
["Node1329"],
["Node1319"],
["Node1318"],
["Node1310"],
["Node1293"],
["Node1290"],
["Node1266"],
["Node1265"],
["Node1261"],
["Node1260"],
["Node1256"],
["Node1255"],
["Node1238"],
["Node1216"],
["Node1243"],
["Node1252"],
["Node1248"],
["Node1286"],
["Node1275"],
["Node1282"],
["Node1299"],
["Node1200"],
["Node1188"],
["Node1180"],
["Node1163"],
["Node1152"],
["Node1155"],
["Node1145"],
["Node1148"],
["Node1138"],
["Node1141"],
["Node1131"],
["Node1134"],
["Node1124"],
["Node1120"],
["Node1117"],
["Node1114"],
["Node1110"],
["Node515"],
["Node512"],
["Node506"],
["Node500"],
["Node734"],
["Node731"],
["Node728"],
["Node725"],
["Node595"],
["Node619"],
["Node618"],
["Node626"],
["Node625"],
["Node636"],
["Node639"],
["Node648"],
["Node651"],
["Node659"],
["Node658"],
["Node1103"],
["Node1100"],
["Node1094"],
["Node746"],
["Node755"],
["Node760"],
["Node763"],
["Node779"],
["Node769"],
["Node776"],
["Node1091"],
["Node1085"],
["Node1078"],
["Node1077"],
["Node1076"],
["Node1070"],
["Node797"],
["Node796"],
["Node790"],
["Node802"],
["Node808"],
["Node807"],
["Node813"],
["Node1064"],
["Node1063"],
["Node1059"],
["Node1054"],
["Node1053"],
["Node1047"],
["Node1043"],
["Node1035"],
["Node1034"],
["Node1029"],
["Node1018"],
["Node1011"],
["Node1010"],
["Node1000"],
["Node984"],
["Node976"],
["Node971"],
["Node939"],
["Node898"],
["Node1022"],
["Node1021"],
["Node894"],
["Node891"],
["Node885"],
["Node882"],
["Node879"],
["Node876"],
["Node850"],
["Node832"],
["Node872"],
["Node871"],
["Node328"],
["Node51"],
["Node294"],
["Node293"],
["Node268"],
["Node242"],
["Node192"],
["Node165"],
["Node173"],
["Node140"],
["Node146"],
["Node115"]
],
"RESOLVED": [
[522.6134926270565, 1219.758644363603, 0, 1, 0.2999436696282858, 0, 0.0008198343210117116, 0.01187691000792038, 0.7000563303717142, 1, 0.0005764154659945042],
[522.4972139720541, 1220.083237102147, 0, 1, 0.2998410854718154, 0, 0.0008196162110833745, 0.01187375025731675, 0.7001589145281846, 1, 0.0005763338616949628],
[522.4238200053953, 1220.073507395625, 0, 0, 0.2998132690307216, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002132280612590629],
[522.6134926270565, 1219.721990982246, 0, 1, 0.2999499795208477, 0, 0.0008198589575274419, 0.01187726691622824, 0.7000500204791523, 1, 0.0004557237059907907],
[522.8871666240389, 1219.610160776981, 1, 0, 0.3000791785453918, 0.001912458487853862, 0, -0.02770571659660895, 1, 0.3000791785453918, 0.0004669703722810026],
[522.4238200053953, 1220.073507395625, 1, 0, 0.2998132690307216, 0.001914154679986974, 0, -0.02773028927038559, 1, 0.2998132690307216, 0.0004557237059907907],
[522.4238200053953, 1220.073507395625, 1, 0, 0.2998132690307216, 0.001914154679986974, 0, -0.02773028927038559, 1, 0.2998132690307216, 0.0004557237059907907],
[522.4238200053953, 1220.073507395625, 1, 0, 0.2998132690307216, 0.001914154679986974, 0, -0.02773028927038559, 1, 0.2998132690307216, 0.0002898072731443158],
[522.4238200053953, 1220.073507395625, 0, 0, 0.2998132690307216, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000286507536992984],
[522.4238200053953, 1220.073507395625, 1, 0, 0.2998132690307216, 0.001914154679986974, 0, -0.02773028927038559, 1, 0.2998132690307216, 0.0005761038704591663],
[522.4238200053953, 1219.911663603907, 0, 1, 0.2998411183839166, 0, 0.000819731485348508, 0.01187542023140557, 0.7001588816160834, 1, 0.0005762289071134239],
[522.2001270421106, 1220.29720035891, 1, 0, 0.29968489410597, 0.001914974639443853, 0, -0.02774216799323227, 1, 0.29968489410597, 0.0004669703722810026],
[522.4238200053953, 1220.073507395625, 0, 1, 0.2998132690307216, 0, 0.000819622747267585, 0.01187384494677982, 0.7001867309692784, 1, 0.000340389150509043],
[522.4972139720541, 1220.235351187342, 0, 1, 0.2998149138988888, 0, 0.0008195140380312341, 0.01187227008002433, 0.7001850861011112, 1, 0.0005762782447828254],
[522.2619762136777, 1220.235351187342, 0, 1, 0.2997203886634621, 0, 0.0008195140380312341, 0.01187227008002433, 0.7002796113365379, 1, 0.0004557237059907907],
[522.4238200053953, 1220.073507395625, 0, 1, 0.2998132690307216, 0, 0.000819622747267585, 0.01187384494677982, 0.7001867309692784, 1, 0.0005765117944022269],
[522.4238200053953, 1220.073507395625, 1, 0, 0.2998132690307216, 0.001914154679986974, 0, -0.02773028927038559, 1, 0.2998132690307216, 0.0004557237059907907],
[522.2619762136777, 1220.235351187342, 0, 1, 0.2997203886634621, 0, 0.0008195140380312341, 0.01187227008002433, 0.7002796113365379, 1, 0.0004557237059907907],
[522.5267384553014, 1219.936568604095, 0, 1, 0.2998781875855534, 0, 0.0008197147505335003, 0.01187517779474886, 0.7001218124144466, 1, 0.0002906548466282587],
[522.4238200053953, 1220.073507395625, 0, 0, 0.2998132690307216, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002855990022825408],
[522.4972139720541, 1220.235351187342, 0, 1, 0.2998149138988888, 0, 0.0008195140380312341, 0.01187227008002433, 0.7001850861011112, 1, 0.0005761969236873843],
[522.7959965553014, 1219.701330845719, 0, 1, 0.3000268570483635, 0, 0.0008198728448599938, 0.01187746810151012, 0.6999731429516365, 1, 0.000447351632815207],
[522.4238200053953, 1220.073507395625, 0, 1, 0.2998132690307216, 0, 0.000819622747267585, 0.01187384494677982, 0.7001867309692784, 1, 0.0004463201113525578],
[522.4238200053953, 1220.073507395625, 0, 0, 0.2998132690307216, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001930458618498859],
[522.4238200053953, 1220.073507395625, 0, 1, 0.2998132690307216, 0, 0.000819622747267585, 0.01187384494677982, 0.7001867309692784, 1, 0.000383220386544916],
[522.1681731052074, 1220.329154295812, 0, 0, 0.2996665560939682, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002034757863298949],
[522.2959965553014, 1220.201330845719, 0, 1, 0.2997399125623448, 0, 0.000819536886840553, 0.01187260108989439, 0.7002600874376552, 1, 0.0003728032082332511],
[522.173439184673, 1220.323888216347, 0, 0, 0.2996695782388994, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002191905622867597],
[522.2986295950342, 1220.198697805986, 1, 0, 0.2997414236348105, 0.001914613486111103, 0, -0.02773693597802846, 1, 0.2997414236348105, 0.0003571204406352741],
[522.4238200053953, 1220.073507395625, 0, 1, 0.2998132690307216, 0, 0.000819622747267585, 0.01187384494677982, 0.7001867309692784, 1, 0.0005765240259985086],
[522.4238200053953, 1220.073507395625, 0, 1, 0.2998132690307216, 0, 0.000819622747267585, 0.01187384494677982, 0.7001867309692784, 1, 0.0005762209906525557],
[522.2986295950342, 1220.198697805986, 1, 0, 0.2997414236348104, 0.001914613486111103, 0, -0.02773693597802846, 1, 0.2997414236348104, 0.0005765360279060446],
[522.0723035920166, 1220.425023809004, 0, 1, 0.2996115376375934, 0, 0.0008193866730780014, 0.0118704249485765, 0.7003884623624066, 1, 0.0005764333938032365],
[522.4238200053953, 1220.073507395625, 1, 0, 0.2998132690307216, 0.001914154679986974, 0, -0.02773028927038559, 1, 0.2998132690307216, 0.0005761004419739237],
[522.4238200053953, 1220.073507395625, 1, 0, 0.2998132690307216, 0.001914154679986974, 0, -0.02773028927038559, 1, 0.2998132690307216, 0.0005763991342949045],
[522.2619762136777, 1220.235351187342, 0, 1, 0.2997203886634621, 0, 0.0008195140380312341, 0.01187227008002433, 0.7002796113365379, 1, 0.0005763980400221848],
[522.2959965553014, 1220.201330845719, 0, 1, 0.2997399125623448, 0, 0.000819536886840553, 0.01187260108989439, 0.7002600874376552, 1, 0.0005764493355307837],
[522.2959965553014, 1220.201330845719, 0, 1, 0.2997399125623448, 0, 0.000819536886840553, 0.01187260108989439, 0.7002600874376552, 1, 0.0005763720650495406],
[522.2986295950342, 1220.198697805986, 1, 0, 0.2997414236348105, 0.001914613486111103, 0, -0.02773693597802846, 1, 0.2997414236348105, 0.0004500554624616891],
[522.4238200053953, 1220.073507395625, 0, 1, 0.2998132690307216, 0, 0.000819622747267585, 0.01187384494677982, 0.7001867309692784, 1, 0.0004326387905938163],
[522.4238200053953, 1220.073507395625, 1, 0, 0.2998132690307216, 0.001914154679986974, 0, -0.02773028927038559, 1, 0.2998132690307216, 0.0005764010201996513],
[522.4972139720541, 1220.463460047609, 0, 1, 0.2997756758143353, 0, 0.0008193608680107397, 0.01187005111150508, 0.7002243241856647, 1, 0.000576401338063202],
[522.4238200053953, 1220.036854014268, 0, 1, 0.2998195757269067, 0, 0.0008196473710689276, 0.01187420167089481, 0.7001804242730933, 1, 0.0004476906798737341],
[522.4238200053953, 1220.073507395625, 1, 0, 0.2998132690307216, 0.001914154679986974, 0, -0.02773028927038559, 1, 0.2998132690307216, 0.0004386074779741239],
[522.5490104157566, 1219.945683945531, 1, 0, 0.2998855675754566, 0.001913696093701083, 0, -0.02772364574753127, 1, 0.2998855675754566, 0.0004385045528542714],
[522.2959965553014, 1220.201330845719, 0, 1, 0.2997399125623449, 0, 0.0008195368868405532, 0.01187260108989439, 0.7002600874376551, 1, 0.0004476906798737341],
[522.5856637971131, 1219.911663603907, 0, 1, 0.2999061493979811, 0, 0.000819731485348508, 0.01187542023140557, 0.7000938506020189, 1, 0.0004386074779741239],
[522.9238200053953, 1219.573507395625, 0, 1, 0.3001002135167403, 0, 0.0008199587756997776, 0.01187871297846252, 0.6998997864832597, 1, 0.0004386074779741239],
[522.2986295950342, 1220.198697805986, 1, 0, 0.2997414236348105, 0.001914613486111103, 0, -0.02773693597802846, 1, 0.2997414236348105, 0.0004476906798737341],
[522.2986295950342, 1220.201330845719, 1, 0, 0.2997409707044828, 0.001914613486111103, 0, -0.02773693597802846, 1, 0.2997409707044828, 0.0004476906798737341],
[522.4238200053953, 1220.073507395625, 1, 0, 0.2998132690307216, 0.001914154679986974, 0, -0.02773028927038559, 1, 0.2998132690307216, 0.0004386074779741239],
[522.4238200053953, 1220.073507395625, 1, 0, 0.2998132690307216, 0.001914154679986974, 0, -0.02773028927038559, 1, 0.2998132690307216, 0.0004476906798737341],
[522.2959965553014, 1220.201330845719, 0, 1, 0.2997399125623448, 0, 0.000819536886840553, 0.01187260108989439, 0.7002600874376552, 1, 0.0004476906798737341],
[522.3871666240389, 1220.110160776981, 0, 1, 0.2997922340593732, 0, 0.0008195981249456914, 0.01187348824409755, 0.7002077659406268, 1, 0.0004500554624616891],
[522.2986295950342, 1220.198697805986, 1, 0, 0.2997414236348104, 0.001914613486111103, 0, -0.02773693597802846, 1, 0.2997414236348104, 0.0005764938970395447],
[522.4238200053953, 1220.073507395625, 1, 0, 0.2998132690307216, 0.001914154679986974, 0, -0.02773028927038559, 1, 0.2998132690307216, 0.0004476906798737341],
[522.4238200053953, 1220.073507395625, 0, 1, 0.2998132690307216, 0, 0.000819622747267585, 0.01187384494677982, 0.7001867309692784, 1, 0.0004476906798737341],
[522.4238200053953, 1220.073507395625, 1, 0, 0.2998132690307216, 0.001914154679986974, 0, -0.02773028927038559, 1, 0.2998132690307216, 0.0004476906798737341],
[522.4238200053953, 1220.073507395625, 1, 0, 0.2998132690307216, 0.001914154679986974, 0, -0.02773028927038559, 1, 0.2998132690307216, 0.0005764250185002919],
[522.4238200053953, 1219.911663603907, 0, 1, 0.2998411183839166, 0, 0.000819731485348508, 0.01187542023140557, 0.7001588816160834, 1, 0.0004476906798737341],
[522.4238200053953, 1220.036854014268, 0, 1, 0.2998195757269067, 0, 0.0008196473710689276, 0.01187420167089481, 0.7001804242730933, 1, 0.0004476906798737341],
[522.0723035920166, 1220.425023809004, 0, 1, 0.2996115376375934, 0, 0.0008193866730780014, 0.0118704249485765, 0.7003884623624066, 1, 0.0004476906798737341],
[522.0723035920166, 1220.425023809004, 0, 1, 0.2996115376375934, 0, 0.0008193866730780014, 0.0118704249485765, 0.7003884623624066, 1, 0.0004476745536323197],
[522.9238200053953, 1219.573507395625, 0, 1, 0.3001002135167403, 0, 0.0008199587756997776, 0.01187871297846252, 0.6998997864832597, 1, 0.0005762483825148633],
[522.4238200053953, 1220.073507395625, 0, 0, 0.2998132690307216, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001354005294165274],
[522.4238200053953, 1220.073507395625, 1, 0, 0.2998132690307216, 0.001914154679986974, 0, -0.02773028927038559, 1, 0.2998132690307216, 0.0004408513952691452],
[521.7207871786378, 1220.776540222382, 0, 0, 0.2994098062444652, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001354005048833686],
[522.0723035920166, 1220.425023809003, 0, 1, 0.2996115376375934, 0, 0.0008193866730780015, 0.0118704249485765, 0.7003884623624066, 1, 0.0004408513952691452],
[522.2986295950342, 1220.198697805986, 1, 0, 0.2997414236348105, 0.001914613486111103, 0, -0.02773693597802846, 1, 0.2997414236348105, 0.000576394773377104],
[522.0723035920166, 1220.425023809004, 0, 1, 0.2996115376375934, 0, 0.0008193866730780014, 0.0118704249485765, 0.7003884623624066, 1, 0.0005764031863253457],
[522.4238200053953, 1220.073507395625, 1, 0, 0.2998132690307216, 0.001914154679986974, 0, -0.02773028927038559, 1, 0.2998132690307216, 0.0003420925551524245],
[522.4238200053953, 1219.911663603907, 0, 1, 0.2998411183839166, 0, 0.000819731485348508, 0.01187542023140557, 0.7001588816160834, 1, 0.0005765255848477788],
[522.4238200053953, 1220.073507395625, 0, 0, 0.2998132690307216, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002348837507829741],
[522.4238200053953, 1220.073507395625, 1, 0, 0.2998132690307216, 0.001914154679986974, 0, -0.02773028927038559, 1, 0.2998132690307216, 0.0003414809730412617],
[522.0723035920166, 1220.425023809004, 0, 1, 0.2996115376375934, 0, 0.0008193866730780014, 0.0118704249485765, 0.7003884623624066, 1, 0.0004476906798737341],
[522.5490104157566, 1219.948316985264, 1, 0, 0.2998851144266327, 0.001913696093701083, 0, -0.02772364574753127, 1, 0.2998851144266327, 0.0004385045528542714],
[522.4238200053953, 1220.073507395625, 0, 1, 0.2998132690307216, 0, 0.000819622747267585, 0.01187384494677982, 0.7001867309692784, 1, 0.0004465383805843979],
[522.2986295950342, 1220.073507395625, 1, 0, 0.2997629602233672, 0.001914613486111103, 0, -0.02773693597802846, 1, 0.2997629602233671, 0.0005764546367666524],
[522.2986295950342, 1220.073507395625, 1, 0, 0.2997629602233672, 0.001914613486111103, 0, -0.02773693597802846, 1, 0.2997629602233671, 0.0005765403435298823],
[522.4238200053953, 1220.073507395625, 0, 1, 0.2998132690307216, 0, 0.000819622747267585, 0.01187384494677982, 0.7001867309692784, 1, 0.0005761784842127012],
[522.4238200053953, 1219.911663603907, 0, 1, 0.2998411183839166, 0, 0.000819731485348508, 0.01187542023140557, 0.7001588816160834, 1, 0.0005768599824713692],
[522.4238200053953, 1220.073507395625, 0, 1, 0.2998132690307216, 0, 0.000819622747267585, 0.01187384494677982, 0.7001867309692784, 1, 0.0005763935466298634],
[522.4238200053953, 1220.073507395625, 0, 1, 0.2998132690307216, 0, 0.000819622747267585, 0.01187384494677982, 0.7001867309692784, 1, 0.0005764015235296935],
[522.150146008413, 1220.185337600889, 1, 0, 0.2996840453061099, 0.001915157943829987, 0, -0.02774482351721117, 1, 0.2996840453061098, 0.0005764594569516583],
[522.4238200053953, 1220.073507395625, 1, 0, 0.2998132690307216, 0.001914154679986974, 0, -0.02773028927038559, 1, 0.2998132690307216, 0.0005764183331763737],
[522.8871666240389, 1219.610160776981, 0, 1, 0.3000791785453918, 0, 0.00081993413318476, 0.01187835598324321, 0.6999208214546082, 1, 0.0005767434482788476],
[521.4238200053953, 1221.073507395625, 1, 0, 0.2992393800586842, 0.001917825695016489, 0, -0.02778347113167857, 1, 0.2992393800586842, 0.0005764103175913445],
[521.4238200053953, 1221.073507395625, 0, 0, 0.2992393800586842, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001981861276579744],
[521.9238200053953, 1220.573507395625, 0, 1, 0.2995263245447029, 0, 0.0008192869941391165, 0.01186898090341216, 0.7004736754552972, 1, 0.0003780973710644398],
[522.6134926270565, 1219.758644363603, 0, 1, 0.2999436696282858, 0, 0.0008198343210117116, 0.01187691000792038, 0.7000563303717142, 1, 0.0005764892939359726],
[522.363111806334, 1219.977637882434, 0, 1, 0.2998053692422927, 0, 0.0008196871556889697, 0.0118747780292392, 0.7001946307577074, 1, 0.0005763650905642188],
[522.2986295950342, 1220.201330845719, 1, 0, 0.2997409707044828, 0.001914613486111103, 0, -0.02773693597802846, 1, 0.2997409707044828, 0.0005765623285762168],
[522.6134926270565, 1219.721990982246, 0, 1, 0.2999499795208477, 0, 0.0008198589575274419, 0.01187726691622824, 0.7000500204791523, 1, 0.0005763251643189415],
[522.7959965553014, 1219.701330845719, 0, 1, 0.3000268570483636, 0, 0.0008198728448599939, 0.01187746810151012, 0.6999731429516365, 1, 0.0005762113964373422],
[522.4238200053953, 1220.000200632912, 0, 0, 0.2998258826884253, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002745723254283645],
[522.4238200053953, 1220.036854014268, 0, 1, 0.2998195757269067, 0, 0.0008196473710689276, 0.01187420167089481, 0.7001804242730933, 1, 0.0003017103322899163],
[522.3370658336403, 1220.16026156738, 1, 1, 0.2997634817682731, 0.001914472599037211, 0.0008195644715682112, -0.01586189424326889, 0.9101418549981624, 0.5096688185347082, 0.001153112379281558],
[522.10013242196, 1220.329154295812, 0, 0, 0.2996392085474207, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001785125465861646],
[522.2619762136777, 1220.201330845719, 0, 1, 0.2997262404882739, 0, 0.000819536886840553, 0.01187260108989439, 0.7002737595117261, 1, 0.0003977426158105421],
[522.3871666240389, 1220.110160776981, 0, 1, 0.2997922340593732, 0, 0.0008195981249456914, 0.01187348824409755, 0.7002077659406268, 1, 0.0005765215200622789],
[522.4238200053953, 1220.073507395625, 0, 0, 0.2998132690307216, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001842739603199826],
[522.4238200053953, 1220.073507395625, 0, 1, 0.2998132690307216, 0, 0.000819622747267585, 0.01187384494677982, 0.7001867309692784, 1, 0.0003919803892909214],
[522.4238200053953, 1220.073507395625, 0, 1, 0.2998132690307216, 0, 0.000819622747267585, 0.01187384494677982, 0.7001867309692784, 1, 0.0005762368664560039],
[522.2959965553014, 1220.201330845719, 1, 0, 0.2997399125623448, 0.001914623138211473, 0, -0.02773707580765568, 1, 0.2997399125623448, 0.0005763712362672042],
[522.4238200053953, 1220.073507395625, 0, 0, 0.2998132690307216, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002497272678054527],
[522.4238200053953, 1220.073507395625, 0, 1, 0.2998132690307216, 0, 0.000819622747267585, 0.01187384494677982, 0.7001867309692784, 1, 0.000326639168300426],
[522.6134926270565, 1219.758644363603, 0, 1, 0.2999436696282858, 0, 0.0008198343210117116, 0.01187691000792038, 0.7000563303717142, 1, 0.0005764224804938452],
[522.2959965553014, 1220.456977745907, 1, 0, 0.2996959432903716, 0.001914623138211473, 0, -0.02773707580765568, 1, 0.2996959432903716, 0.0005763744443572896],
[522.4238200053953, 1220.329154295812, 0, 1, 0.2997692889979842, 0, 0.0008194510444004325, 0.01187135749358469, 0.7002307110020158, 1, 0.0005764107001414348],
[522.4238200053953, 1220.329154295812, 1, 0, 0.2997692889979842, 0.001914154679986974, 0, -0.02773028927038559, 1, 0.2997692889979842, 0.000576283040256657],
[522.8871666240389, 1219.865807677169, 0, 1, 0.3000351595060115, 0, 0.0008197622998419549, 0.01187586663985205, 0.6999648404939885, 1, 0.0004408970728436324],
[522.7753364187741, 1219.977637882434, 0, 1, 0.2999709907988489, 0, 0.0008196871556889697, 0.0118747780292392, 0.7000290092011512, 1, 0.0005761740814287432],
[522.4238200053953, 1220.329154295812, 1, 0, 0.2997692889979842, 0.001914154679986974, 0, -0.02773028927038559, 1, 0.2997692889979842, 0.0005762786414276981],
[522.2619762136776, 1220.49099808753, 0, 1, 0.2996764222554772, 0, 0.0008193423807033133, 0.0118697832865544, 0.7003235777445227, 1, 0.000576226389483788],
[522.4238200053953, 1220.329154295812, 0, 2, 0.2997692889979842, 0, 0.001638902088800865, 0.02374271498716939, 0.4903230486303886, 1, 0.001152585081626056],
[522.4238200053953, 1220.329154295812, 0, 1, 0.2997692889979842, 0, 0.0008194510444004325, 0.01187135749358469, 0.7002307110020158, 1, 0.0005765582540711664],
[522.4238200053953, 1220.329154295812, 0, 1, 0.2997692889979842, 0, 0.0008194510444004325, 0.01187135749358469, 0.7002307110020158, 1, 0.0005761565109998962],
[522.4238200053953, 1220.329154295812, 1, 0, 0.2997692889979842, 0.001914154679986974, 0, -0.02773028927038559, 1, 0.2997692889979842, 0.0005759806838260657],
[522.4238200053953, 1220.201330845719, 0, 1, 0.2997912774013613, 0, 0.0008195368868405532, 0.01187260108989439, 0.7002087225986386, 1, 0.0005763494591690259],
[522.5516434554893, 1219.945683945531, 0, 1, 0.2998866254990982, 0, 0.0008197086256871817, 0.01187508906432288, 0.7001133745009018, 1, 0.0005763566573587016],
[522.2753364187741, 1220.221990982246, 0, 1, 0.2997280559378311, 0, 0.0008195230108867543, 0.01187240006945609, 0.7002719440621689, 1, 0.0005764539314616639],
[522.6134926270565, 1219.758644363603, 0, 1, 0.2999436696282858, 0, 0.0008198343210117116, 0.01187691000792038, 0.7000563303717142, 1, 0.0005764385831998638],
[522.4238200053953, 1220.073507395625, 0, 1, 0.2998132690307216, 0, 0.000819622747267585, 0.01187384494677982, 0.7001867309692784, 1, 0.0005763053649200356],
[522.4238200053953, 1220.073507395625, 1, 0, 0.2998132690307216, 0.001914154679986974, 0, -0.02773028927038559, 1, 0.2998132690307216, 0.0005763590506198604],
[522.5490104157566, 1220.073507395625, 1, 0, 0.2998635706096829, 0.001913696093701083, 0, -0.02772364574753127, 1, 0.2998635706096829, 0.0005761147492282594],
[522.4238200053953, 1220.073507395625, 1, 0, 0.2998132690307216, 0.001914154679986974, 0, -0.02773028927038559, 1, 0.2998132690307216, 0.0005766550158369045],
[522.4238200053953, 1220.073507395625, 1, 0, 0.2998132690307216, 0.001914154679986974, 0, -0.02773028927038559, 1, 0.2998132690307216, 0.0005765408092467208],
[522.4238200053953, 1220.073507395625, 0, 1, 0.2998132690307216, 0, 0.000819622747267585, 0.01187384494677982, 0.7001867309692784, 1, 0.000576564858258674],
[522.2986295950342, 1220.198697805986, 1, 0, 0.2997414236348105, 0.001914613486111103, 0, -0.02773693597802846, 1, 0.2997414236348105, 0.000576498670768992],
[522.5856637971131, 1219.911663603907, 0, 1, 0.2999061493979811, 0, 0.000819731485348508, 0.01187542023140557, 0.7000938506020189, 1, 0.0005763355329895644],
[522.1681731052074, 1220.329154295812, 1, 0, 0.2996665560939682, 0.001915091825787165, 0, -0.02774386566752816, 1, 0.2996665560939682, 0.0005768278427477758],
[522.2959965553014, 1220.201330845719, 0, 1, 0.2997399125623448, 0, 0.000819536886840553, 0.01187260108989439, 0.7002600874376552, 1, 0.0005765439471670401],
[522.4238200053953, 1220.073507395625, 0, 1, 0.2998132690307216, 0, 0.000819622747267585, 0.01187384494677982, 0.7001867309692784, 1, 0.0005765579105117387],
[522.4238200053953, 1220.073507395625, 0, 1, 0.2998132690307216, 0, 0.000819622747267585, 0.01187384494677982, 0.7001867309692784, 1, 0.0005761925587875308],
[522.7959965553014, 1219.701330845719, 0, 1, 0.3000268570483635, 0, 0.0008198728448599938, 0.01187746810151012, 0.6999731429516365, 1, 0.0005763741389683579],
[522.4238200053953, 1220.073507395625, 1, 0, 0.2998132690307216, 0.001914154679986974, 0, -0.02773028927038559, 1, 0.2998132690307216, 0.0005766857685633069],
[522.7753364187741, 1219.721990982246, 0, 1, 0.3000150004238498, 0, 0.0008198589575274419, 0.01187726691622824, 0.6999849995761502, 1, 0.0005761538127934822],
[522.2619762136776, 1220.235351187342, 0, 1, 0.2997203886634621, 0, 0.0008195140380312341, 0.01187227008002433, 0.7002796113365379, 1, 0.0005766857926109319],
[522.4238200053953, 1220.073507395625, 1, 0, 0.2998132690307216, 0.001914154679986974, 0, -0.02773028927038559, 1, 0.2998132690307216, 0.000576153812390775],
[522.4238200053953, 1220.073507395625, 0, 1, 0.2998132690307216, 0, 0.000819622747267585, 0.01187384494677982, 0.7001867309692784, 1, 0.000576449800021088]
]
},
"by-site":{
"AVERAGED": [
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 7.243481825244729, 0.6666666666666667, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.255646900187936, 0, 0, 0.230669099908822, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.9235569423728135, 2.003202258346178, 1, 0, 0.3155561763147208, 1.08277027015875, 0, -15.68605354562046, 1, 0.3155561763147208, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 1.926693237286978, 0, 0, 0.341682547135344, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.5295244832473264, 1.543782279465698, 0, 0, 0.2554009337983432, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 1.926693237286978, 0, 0, 0.341682547135344, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1.379345243322185, 1.296967173242407, 0, 0, 0.5153902193125722, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.8337526536385079, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2942220989428905, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.255646900187936, 0, 0, 0.230669099908822, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 7.243481825244729, 0.6666666666666667, 1, 0.06902757707728585],
[0.9266932372869763, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3166349057293118, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.296967173242406, 2.703032826757595, 0, 0, 0.09898905774746865, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.8337526536385079, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2942220989428905, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.9266932372869763, 2.073306762713026, 0, 0, 0.3088977457623253, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1.379345243322185, 1.296967173242407, 0, 0, 0.5153902193125722, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.255646900187936, 0, 0, 0.230669099908822, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.255646900187936, 0, 0, 0.230669099908822, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7030328267575942, 2.130719826880915, 0, 0, 0.2480925164216105, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.9258812925208212, 2.00082902181562, 1, 0, 0.3163556324605846, 1.080052062913359, 0, -15.64667497606199, 1, 0.3163556324605846, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.255646900187936, 0, 0, 0.230669099908822, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.9266932372869763, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3166349057293118, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.9266932372869763, 2.073306762713026, 0, 0, 0.3088977457623253, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -14.48696365048946, 1, 0.3333333333333333, 0.06902757707728585],
[0.296967173242406, 2.703032826757595, 0, 0, 0.09898905774746865, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 1.926693237286978, 0, 0, 0.341682547135344, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 1.926693237286978, 0, 0, 0.341682547135344, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7030328267575942, 2.130719826880915, 0, 0, 0.2480925164216105, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1.379345243322185, 1.296967173242407, 0, 0, 0.5153902193125722, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -14.48696365048946, 1, 0.3333333333333333, 0.06902757707728585],
[1.205836899811916, 1.726122416940609, 0, 0, 0.4112734078273351, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 1.999548199234324, 0, 1, 0.333383540979693, 0, 0.5001129757126759, 7.245118500287656, 0.666616459020307, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2527030896612319, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.9967960618674099, 2.003203938132591, 0, 1, 0.3322653539558032, 0, 0.499200296567014, 7.231896550679894, 0.6677346460441969, 1, 0.06902757707728585],
[0.9266932372869763, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3166349057293118, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.322335063025361, 0, 1, 0.2255391542913448, 0, 0.4306010859162056, 6.238102279529361, 0.7744608457086553, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.255646900187936, 0, 0, 0.230669099908822, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -14.48696365048946, 1, 0.3333333333333333, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7030328267575942, 1.370273935955431, 0, 0, 0.3390877025055572, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1.003134531909774, 1.996865468090227, 1, 0, 0.3343781773032578, 0.9968752626790683, 0, -14.4416956945038, 1, 0.3343781773032578, 0.06902757707728585],
[0.9266932372869763, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3166349057293118, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1.379345243322185, 1.296967173242407, 0, 0, 0.5153902193125722, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 1.529524483247326, 0, 0, 0.3953312200071023, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.003177045295121996, 2.99682295470488, 0, 1, 0.001059015098373998, 0, 0.3336867126001034, 4.834107276089023, 0.998940984901626, 1, 0.06902757707728585],
[0.9266932372869763, 2.073306762713026, 0, 0, 0.3088977457623253, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2527030896612319, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2527030896612319, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.255646900187936, 0, 0, 0.230669099908822, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7030328267575942, 2.130719826880915, 0, 0, 0.2480925164216105, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 1.926693237286978, 0, 0, 0.341682547135344, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7030328267575942, 2.130719826880915, 0, 0, 0.2480925164216105, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1.006830897366263, 1.993169102633738, 1, 2, 0.3356102991220875, 0.9932154472174707, 1.003427153951582, 0.1479366242665227, 0.7376996253927237, 0.7067293007473987, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 0.9999999999999996, 14.48696365048946, 0.4444444444444445, 1, 0.06902757707728585],
[0.7443530998120652, 2.255646900187936, 0, 0, 0.248117699937355, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.677340786678633, 2.322659213321369, 0, 1, 0.2257802622262109, 0, 0.430540991233068, 6.23723169003916, 0.7742197377737892, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1.205836899811916, 1.726122416940609, 0, 0, 0.4112734078273351, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.255646900187936, 0, 0, 0.230669099908822, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 1.529524483247326, 0, 0, 0.3953312200071023, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7030328267575942, 1.370273935955431, 0, 0, 0.3390877025055572, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1.379345243322185, 1.296967173242407, 0, 0, 0.5153902193125722, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2527030896612319, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7030328267575942, 2.130719826880915, 0, 0, 0.2480925164216105, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.255646900187936, 0, 0, 0.230669099908822, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.9989314987476585, 2.001068501252342, 0, 1, 0.3329771662492194, 0, 0.499733017322577, 7.239614056901596, 0.6670228337507806, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.9256476148708691, 2.074352385129133, 1, 0, 0.3085492049569562, 1.080324719617522, 0, -15.65062494382427, 1, 0.3085492049569563, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 1, 0.2254374721881966, 0, 0.4303504512089225, 6.2344713436354, 0.7745625278118035, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.9266932372869763, 2.073306762713026, 0, 0, 0.3088977457623253, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7443530998120652, 2.255646900187936, 0, 0, 0.248117699937355, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.255646900187936, 0, 0, 0.230669099908822, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.9256476912806273, 2.074352308719375, 1, 0, 0.3085492304268756, 1.080324630439586, 0, -15.65062365190675, 1, 0.3085492304268755, 0.06902757707728585],
[0, 1.940951033505349, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 7.243481825244729, 0.6666666666666667, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.9266932372869763, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3166349057293118, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7454203818976834, 2.254579618102318, 0, 1, 0.248473460632561, 0, 0.4435416660253945, 6.425571993187429, 0.751526539367439, 1, 0.06902757707728585],
[1.379345243322185, 1.296967173242407, 0, 0, 0.5153902193125722, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.9266932372869763, 2.073306762713026, 0, 0, 0.3088977457623253, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.255646900187936, 0, 0, 0.230669099908822, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.9989326893828259, 2.001067310617175, 0, 1, 0.3329775631276085, 0, 0.4997333146637516, 7.239618364472385, 0.6670224368723915, 1, 0.06902757707728585],
[0.7030328267575942, 1.826491656489734, 0, 0, 0.2779308251071212, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.8337526536385079, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2942220989428905, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.5295244832473264, 2.304228170391182, 0, 0, 0.1868633391723242, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -14.48696365048946, 1, 0.3333333333333333, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7030328267575942, 1.826491656489734, 0, 0, 0.2779308251071212, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -14.48696365048946, 1, 0.3333333333333333, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7030328267575942, 2.130719826880915, 0, 0, 0.2480925164216105, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 7.243481825244729, 0.6666666666666667, 1, 0.06902757707728585],
[0.9991709781843816, 2.00082902181562, 0, 1, 0.3330569927281271, 0, 0.4997928304201457, 7.240480567071897, 0.6669430072718729, 1, 0.06902757707728585],
[0.5295244832473264, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2093375599857957, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.5295244832473264, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2093375599857957, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7030328267575942, 2.130719826880915, 0, 0, 0.2480925164216105, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1.926693237286978, 1.073306762713024, 0, 0, 0.6422310790956589, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2527030896612319, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7428398207609289, 2.257160179239073, 1, 0, 0.2476132735869762, 1.346185236779106, 0, -19.50213659204447, 1, 0.2476132735869762, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7030328267575942, 1.826491656489734, 0, 0, 0.2779308251071212, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1.926693237286978, 1.073306762713024, 0, 0, 0.6422310790956589, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.9266932372869763, 2.073306762713026, 0, 0, 0.3088977457623253, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.8337526536385079, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2942220989428905, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7030328267575942, 1.826491656489734, 0, 0, 0.2779308251071212, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1.379345243322185, 1.296967173242407, 0, 0, 0.5153902193125722, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.322637916617955, 0, 1, 0.2255163778744125, 0, 0.4305449389443027, 6.23728888038832, 0.7744836221255875, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1.001584065968562, 1.924063633660389, 0, 1, 0.3423460952238334, 0, 0.5197333302836631, 7.529357863767263, 0.6576539047761667, 1, 0.06902757707728585],
[0, 1.940951033505349, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7030328267575942, 1.826491656489734, 0, 0, 0.2779308251071212, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7030328267575942, 2.130719826880915, 0, 0, 0.2480925164216105, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 7.243481825244729, 0.6666666666666667, 1, 0.06902757707728585],
[0.8337526536385079, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2942220989428905, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.9986485626718236, 2.001351437328177, 0, 1, 0.3328828542239411, 0, 0.4996623688116512, 7.238590574491853, 0.667117145776059, 1, 0.06902757707728585],
[0.9266932372869763, 2.073306762713026, 0, 0, 0.3088977457623253, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1.073306762713024, 1, 0, 0, 0.5176787063138447, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2527030896612319, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 7.243481825244729, 0.6666666666666667, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2527030896612319, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1.001252228655971, 1.997679270091688, 0, 1, 0.3338696562672704, 0, 0.5005808564825837, 7.251896671994073, 0.6661303437327296, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7030328267575942, 2.130719826880915, 0, 0, 0.2480925164216105, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.9266932372869763, 2.073306762713026, 0, 0, 0.3088977457623253, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7030328267575942, 2.130719826880915, 0, 0, 0.2480925164216105, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7030328267575942, 1.370273935955431, 0, 0, 0.3390877025055572, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.296967173242406, 2.703032826757595, 0, 0, 0.09898905774746865, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 1.529524483247326, 0, 0, 0.3953312200071023, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.5295244832473264, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2093375599857957, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.9256476070439289, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3163906701597606, 1.080324728752356, 0, -15.65062507616027, 1, 0.3163906701597605, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7030328267575942, 1.826491656489734, 0, 0, 0.2779308251071212, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7030328267575942, 2.130719826880915, 0, 0, 0.2480925164216105, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.9266932372869763, 2.073306762713026, 0, 0, 0.3088977457623253, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2527030896612319, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.998230352663964, 2.00139765897438, 0, 2, 0.3327847149016148, 0, 0.9993016585344183, 14.47684680306195, 0.4451762366689195, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 7.243481825244729, 0.6666666666666667, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.9266932372869763, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3166349057293118, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1.073306762713024, 1, 0, 0, 0.5176787063138447, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.9977201775180937, 2.002279822481907, 0, 1, 0.3325733925060311, 0, 0.4994306933385861, 7.235234300334848, 0.6674266074939689, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.9256477624841938, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3163907064800643, 1.080324547337817, 0, -15.65062244801444, 1, 0.3163907064800644, 0.06902757707728585],
[0.7030328267575942, 2.130719826880915, 0, 0, 0.2480925164216105, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1.379345243322185, 1.296967173242407, 0, 0, 0.5153902193125722, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2527030896612319, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1.926693237286978, 1.073306762713024, 0, 0, 0.6422310790956589, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 1.926693237286978, 0, 0, 0.341682547135344, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0, 3.000000000000001, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1.379345243322185, 1.296967173242407, 0, 0, 0.5153902193125722, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -14.48696365048946, 1, 0.3333333333333333, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 7.243481825244729, 0.6666666666666667, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1.926693237286978, 1.073306762713024, 0, 0, 0.6422310790956589, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7030328267575942, 1.370273935955431, 0, 0, 0.3390877025055572, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.5295244832473264, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2093375599857957, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.9266932372869763, 2.073306762713026, 0, 0, 0.3088977457623253, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2527030896612319, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.9989314987476585, 2.001068501252342, 0, 1, 0.3329771662492194, 0, 0.499733017322577, 7.239614056901596, 0.6670228337507806, 1, 0.06902757707728585],
[0.8337526536385079, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2942220989428905, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7443530998120652, 2.255646900187936, 0, 0, 0.248117699937355, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.9989325462953829, 2.001067453704618, 0, 1, 0.3329775154317942, 0, 0.4997332789300425, 7.239617846799439, 0.6670224845682058, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1.379345243322185, 1.296967173242407, 0, 0, 0.5153902193125722, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.9266932372869763, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3166349057293118, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.9977201775180937, 2.002279822481907, 0, 1, 0.3325733925060311, 0, 0.4994306933385861, 7.235234300334848, 0.6674266074939689, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -14.48696365048946, 1, 0.3333333333333333, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.9978653758944294, 2.002134624105572, 2, 0, 0.3326217919648096, 2.004278380946242, 0, -29.03590805023008, 1, 0.110637256489881, 0.06902757707728585],
[1.001583882379897, 1.924063938423846, 0, 1, 0.342346018293049, 0, 0.5197332479601379, 7.529356671149346, 0.657653981706951, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.322336542660503, 0, 1, 0.2255390430026734, 0, 0.4306008115664345, 6.2380983050342, 0.7744609569973266, 1, 0.06902757707728585],
[0.5295244832473264, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2093375599857957, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.9266932372869763, 2.073306762713026, 0, 0, 0.3088977457623253, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6771077011050805, 2.322892298894921, 1, 0, 0.2257025670350267, 1.476869925372197, 0, -21.39536092536811, 1, 0.2257025670350267, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2527030896612319, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7030328267575942, 1.370273935955431, 0, 0, 0.3390877025055572, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.5295244832473264, 2.304228170391182, 0, 0, 0.1868633391723242, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.002411989444589392, 2.997588010555412, 0, 1, 0.0008039964815297967, 0, 0.3336015478040004, 4.832873496783578, 0.9991960035184702, 1, 0.06902757707728585],
[0.7030328267575942, 1.370273935955431, 0, 0, 0.3390877025055572, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.5295244832473264, 2.304228170391182, 0, 0, 0.1868633391723242, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2527030896612319, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.9977202596394543, 2.002279740360547, 0, 1, 0.332573419879818, 0, 0.4994307138222014, 7.235234597080239, 0.667426580120182, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.5295244832473264, 1.543782279465698, 0, 0, 0.2554009337983432, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 1.529524483247326, 0, 0, 0.3953312200071023, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 7.243481825244729, 0.6666666666666667, 1, 0.06902757707728585],
[0.5295244832473264, 2.304228170391182, 0, 0, 0.1868633391723242, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.322335847062432, 0, 1, 0.2255390953210881, 0, 0.4306009405422216, 6.23810017350174, 0.7744609046789119, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7443530998120652, 2.255646900187936, 0, 0, 0.248117699937355, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -14.48696365048946, 1, 0.3333333333333333, 0.06902757707728585],
[1.926693237286978, 1.073306762713024, 0, 0, 0.6422310790956589, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.9996938692616808, 2.00030613073832, 0, 1, 0.3332312897538935, 0, 0.4999234790281307, 7.242373268706762, 0.6667687102461065, 1, 0.06902757707728585],
[0.9266932372869763, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3166349057293118, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.9266932372869763, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3166349057293118, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.999761022258123, 2.000238977741878, 0, 1, 0.3332536740860409, 0, 0.4999402627024727, 7.242616413186877, 0.6667463259139591, 1, 0.06902757707728585],
[0.296967173242406, 2.703032826757595, 0, 0, 0.09898905774746865, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2527030896612319, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.9266932372869763, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3166349057293118, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -14.48696365048946, 1, 0.3333333333333333, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1.926693237286978, 1.073306762713024, 0, 0, 0.6422310790956589, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.255646900187936, 0, 0, 0.230669099908822, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.5301372143915229, 2.001351156453249, 0, 1, 0.2094172031351711, 0, 0.499662438935593, 7.238591590374848, 0.7905827968648289, 1, 0.06902757707728585],
[0.5295244832473264, 2.304228170391182, 0, 0, 0.1868633391723242, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1.379345243322185, 1.296967173242407, 0, 0, 0.5153902193125722, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7030328267575942, 2.130719826880915, 0, 0, 0.2480925164216105, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2527030896612319, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1.205836899811916, 1.726122416940609, 0, 0, 0.4112734078273351, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.2999011820893474, 2.700098817910654, 0, 1, 0.09996706069644909, 0, 0.3703568155975135, 5.365345725272208, 0.9000329393035509, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7030328267575942, 2.130719826880915, 0, 0, 0.2480925164216105, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.255646900187936, 0, 0, 0.230669099908822, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.8337526536385079, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2942220989428905, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7443530998120652, 2.255646900187936, 0, 0, 0.248117699937355, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.296967173242406, 2.703032826757595, 0, 0, 0.09898905774746865, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 3, 0, 0.3333333333333333, 2.999999999999999, 0, -43.46089095146838, 1, 0.03703703703703698, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 0.9999999999999996, 14.48696365048946, 0.4444444444444445, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.5301371279264026, 2.001350965785766, 0, 1, 0.2094171919051022, 0, 0.4996624865381282, 7.238592279991046, 0.7905828080948978, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.255646900187936, 0, 0, 0.230669099908822, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7030328267575942, 2.130719826880915, 0, 0, 0.2480925164216105, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.9266932372869763, 2.073306762713026, 0, 0, 0.3088977457623253, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7030328267575942, 2.130719826880915, 0, 0, 0.2480925164216105, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1.000433359354902, 1.999423390981768, 0, 1, 0.333493710738896, 0, 0.5001441938262883, 7.245570755964796, 0.666506289261104, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1.001583863105593, 1.924063970419848, 0, 1, 0.3423460102163671, 0, 0.5197332393172931, 7.529356545940767, 0.6576539897836329, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1.379345243322185, 1.296967173242407, 0, 0, 0.5153902193125722, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7030328267575942, 1.826491656489734, 0, 0, 0.2779308251071212, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.5295244832473264, 1.543782279465698, 0, 0, 0.2554009337983432, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2527030896612319, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -14.48696365048946, 1, 0.3333333333333333, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.255646900187936, 0, 0, 0.230669099908822, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1.205836899811916, 1.726122416940609, 0, 0, 0.4112734078273351, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 7.243481825244729, 0.6666666666666667, 1, 0.06902757707728585],
[0.5295244832473264, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2093375599857957, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.296967173242406, 2.703032826757595, 0, 0, 0.09898905774746865, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7030328267575942, 1.826491656489734, 0, 0, 0.2779308251071212, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7443530998120652, 2.255646900187936, 0, 0, 0.248117699937355, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 1.926693237286978, 0, 0, 0.341682547135344, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0, 3.000000000000001, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.9970645674131862, 2.002935432586815, 0, 1, 0.3323548558043953, 0, 0.4992672173703014, 7.23286602992458, 0.6676451441956047, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2527030896612319, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1.205836899811916, 1.726122416940609, 0, 0, 0.4112734078273351, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -14.48696365048946, 1, 0.3333333333333333, 0.06902757707728585],
[0.8337526536385079, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2942220989428905, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1.379345243322185, 1.296967173242407, 0, 0, 0.5153902193125722, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.5295244832473264, 2.304228170391182, 0, 0, 0.1868633391723242, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.9266932372869763, 2.073306762713026, 0, 0, 0.3088977457623253, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2527030896612319, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -14.48696365048946, 1, 0.3333333333333333, 0.06902757707728585],
[0.9266932372869763, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3166349057293118, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7443530998120652, 2.255646900187936, 0, 0, 0.248117699937355, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.9266932372869763, 2.073306762713026, 0, 0, 0.3088977457623253, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 7.243481825244729, 0.6666666666666667, 1, 0.06902757707728585],
[0.7030328267575942, 1.370273935955431, 0, 0, 0.3390877025055572, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1.379345243322185, 1.296967173242407, 0, 0, 0.5153902193125722, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1.205836899811916, 1.726122416940609, 0, 0, 0.4112734078273351, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1.924407745453684, 1.074240673218466, 1, 0, 0.6417583780314742, 0.5196403944862774, 0, -7.528011506248707, 1, 0.6417583780314742, 0.06902757707728585],
[0.9985560706236378, 2.001443929376363, 0, 1, 0.3328520235412125, 0, 0.4996392780843946, 7.238256059965422, 0.6671479764587875, 1, 0.06902757707728585],
[0.5295244832473264, 2.304228170391182, 0, 0, 0.1868633391723242, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1.926693237286978, 1.073306762713024, 0, 0, 0.6422310790956589, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7030328267575942, 1.826491656489734, 0, 0, 0.2779308251071212, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 1.9997622779487, 0, 1, 0.3333597489877835, 0, 0.5000594375776365, 7.244342895271425, 0.6666402510122165, 1, 0.06902757707728585],
[0.7030328267575942, 1.826491656489734, 0, 0, 0.2779308251071212, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2527030896612319, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.9252504926389936, 2.074749507361008, 1, 0, 0.3084168308796644, 1.080788400498773, 0, -15.65734227189638, 1, 0.3084168308796644, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 1.926693237286978, 0, 0, 0.341682547135344, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.255646900187936, 0, 0, 0.230669099908822, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.8337526536385079, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2942220989428905, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.9986478879998736, 2.001352112000128, 0, 1, 0.332882629333291, 0, 0.4996622003714338, 7.238588134304546, 0.667117370666709, 1, 0.06902757707728585],
[0, 3.000000000000001, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7030328267575942, 2.130719826880915, 0, 0, 0.2480925164216105, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.2999012853054571, 2.700098714694544, 0, 1, 0.09996709510181902, 0, 0.3703568297550661, 5.365345930372158, 0.900032904898181, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 1.9997622779487, 0, 1, 0.3333597489877835, 0, 0.5000594375776365, 7.244342895271425, 0.6666402510122165, 1, 0.06902757707728585],
[0.9266932372869763, 2.073306762713026, 0, 0, 0.3088977457623253, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0, 3.000000000000001, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.9266932372869763, 2.073306762713026, 0, 0, 0.3088977457623253, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -14.48696365048946, 1, 0.3333333333333333, 0.06902757707728585],
[1, 1.529524483247326, 0, 0, 0.3953312200071023, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.255646900187936, 0, 0, 0.230669099908822, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1.073306762713024, 1.926693237286978, 0, 0, 0.3577689209043411, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -14.48696365048946, 1, 0.3333333333333333, 0.06902757707728585],
[0.6771077011050806, 2.254834889000509, 1, 0, 0.2309416642024684, 1.476869925372197, 0, -21.3953609253681, 1, 0.2309416642024684, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7030328267575942, 1.826491656489734, 0, 0, 0.2779308251071212, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7443530998120652, 2.255646900187936, 0, 0, 0.248117699937355, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.9266932372869763, 2.073306762713026, 0, 0, 0.3088977457623253, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -14.48696365048946, 1, 0.3333333333333333, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1.205836899811916, 1.726122416940609, 0, 0, 0.4112734078273351, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2527030896612319, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.5295244832473264, 2.304228170391182, 0, 0, 0.1868633391723242, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7030328267575942, 2.130719826880915, 0, 0, 0.2480925164216105, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7030328267575942, 2.130719826880915, 0, 0, 0.2480925164216105, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.9266932372869763, 2.073306762713026, 0, 1, 0.3088977457623253, 0, 0.4823212936861547, 6.987371049488377, 0.6911022542376748, 1, 0.06902757707728585],
[0.7030328267575942, 2.130719826880915, 0, 0, 0.2480925164216105, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1.001583926626596, 1.924063864972813, 0, 1, 0.3423460368341348, 0, 0.5197332678009262, 7.529356958582125, 0.6576539631658652, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7030328267575942, 1.370273935955431, 0, 0, 0.3390877025055572, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.9266932372869763, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3166349057293118, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7030328267575942, 2.130719826880915, 0, 0, 0.2480925164216105, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.007281685828128721, 2.992718314171873, 0, 2, 0.002427228609376239, 0, 0.6682887562551733, 9.681474919899509, 0.9951514342199697, 1, 0.06902757707728585],
[0.6776637073372075, 2.322336292662794, 0, 1, 0.2258879024457357, 0, 0.4306008579202794, 6.238098976560666, 0.7741120975542642, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2527030896612319, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.5295244832473264, 2.304228170391182, 0, 0, 0.1868633391723242, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.9986489651279893, 2.001351034872012, 1, 1, 0.3328829883759963, 1.00135286263661, 0.4996624692898768, -7.267970492213882, 0.8891889160498663, 0.5549548928018588, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.9860397080183969, 2.013960291981604, 0, 1, 0.3286799026727989, 0, 0.4965341193574706, 7.193271738359474, 0.6713200973272011, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 1.926693237286978, 0, 0, 0.341682547135344, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7443530998120652, 2.255646900187936, 0, 0, 0.248117699937355, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.9266932372869763, 2.073306762713026, 0, 0, 0.3088977457623253, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6602443101282395, 2.339755689871762, 0, 0, 0.220081436709413, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7030328267575942, 1.370273935955431, 0, 0, 0.3390877025055572, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.296967173242406, 2.703032826757595, 0, 0, 0.09898905774746865, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -14.48696365048946, 1, 0.3333333333333333, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.8337526536385079, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2942220989428905, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7015835898925488, 1.827940893354779, 1, 0, 0.2773578965291835, 1.425346907206247, 0, -20.64894883403447, 1, 0.2773578965291835, 0.06902757707728585],
[0.92587700368272, 2.074122996317282, 1, 0, 0.3086256678942398, 1.080057065919612, 0, -15.64674745443172, 1, 0.3086256678942398, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.997064721241913, 2.002935278758088, 0, 1, 0.3323549070806376, 0, 0.4992672557148456, 7.232866585420598, 0.6676450929193625, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.9258812925208212, 2.07411870747918, 1, 0, 0.3086270975069402, 1.080052062913359, 0, -15.64667497606199, 1, 0.3086270975069403, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 4, 0.3333333333333333, 0, 1.999999999999999, 28.97392730097892, 0.1975308641975309, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 7.243481825244729, 0.6666666666666667, 1, 0.06902757707728585],
[0, 1.940951033505349, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.8337526536385079, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2942220989428905, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7030328267575942, 2.130719826880915, 0, 0, 0.2480925164216105, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -14.48696365048946, 1, 0.3333333333333333, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7443530998120652, 2.255646900187936, 0, 0, 0.248117699937355, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 1.926693237286978, 0, 0, 0.341682547135344, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2527030896612319, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 1.926693237286978, 0, 0, 0.341682547135344, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.5301373452711583, 1.547038503136039, 0, 1, 0.2552202528628829, 0, 0.6463963230216156, 9.364320035424193, 0.7447797471371171, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -14.48696365048946, 1, 0.3333333333333333, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 1.926693237286978, 0, 0, 0.341682547135344, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.5301372735265233, 2.304309406899408, 0, 1, 0.1870337788279932, 0, 0.4339694994977096, 6.286900364644425, 0.8129662211720068, 1, 0.06902757707728585],
[0.7443530998120652, 2.255646900187936, 0, 0, 0.248117699937355, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1.205836899811916, 1.726122416940609, 0, 0, 0.4112734078273351, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 1.529524483247326, 0, 0, 0.3953312200071023, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1.926693237286978, 1.073306762713024, 0, 0, 0.6422310790956589, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7030328267575942, 1.370273935955431, 0, 0, 0.3390877025055572, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -14.48696365048946, 1, 0.3333333333333333, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 1.926693237286978, 1, 0, 0.341682547135344, 0.9999999999999996, 0, -14.48696365048946, 1, 0.341682547135344, 0.06902757707728585],
[1, 1.926693237286978, 0, 0, 0.341682547135344, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.5295244832473264, 1.543782279465698, 0, 0, 0.2554009337983432, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -14.48696365048946, 1, 0.3333333333333333, 0.06902757707728585],
[1, 1.926693237286978, 0, 0, 0.341682547135344, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7030328267575942, 1.826491656489734, 0, 0, 0.2779308251071212, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.677357274937502, 2.026177041657104, 1, 1, 0.250545099716251, 1.47632576928072, 0.4935402876651649, -14.23757754839333, 0.9372271530081737, 0.4383173524406759, 0.06902757707728585],
[0.9266932372869763, 2.073306762713026, 0, 0, 0.3088977457623253, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2527030896612319, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.296967173242406, 2.703032826757595, 0, 0, 0.09898905774746865, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.9266932372869763, 2.073306762713026, 0, 0, 0.3088977457623253, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -14.48696365048946, 1, 0.3333333333333333, 0.06902757707728585],
[0.7030328267575942, 1.370273935955431, 0, 0, 0.3390877025055572, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 7.243481825244729, 0.6666666666666667, 1, 0.06902757707728585],
[0.7030328267575942, 1.826491656489734, 0, 0, 0.2779308251071212, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.9256478710541686, 2.074352128945833, 1, 0, 0.3085492903513893, 1.080324420625692, 0, -15.65062061234049, 1, 0.3085492903513893, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.255646900187936, 0, 0, 0.230669099908822, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.9266932372869763, 2.073306762713026, 0, 0, 0.3088977457623253, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.8337526536385079, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2942220989428905, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7443530998120652, 2.255646900187936, 0, 0, 0.248117699937355, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.8337526536385079, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2942220989428905, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 7.243481825244729, 0.6666666666666667, 1, 0.06902757707728585],
[0.7030328267575942, 2.130719826880915, 0, 0, 0.2480925164216105, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1.003167339661395, 1.994130033802584, 0, 2, 0.3346906278111583, 0, 1.002943622581233, 14.52960780382455, 0.4426365607223107, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.296967173242406, 2.703032826757595, 0, 0, 0.09898905774746865, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.9266932372869763, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3166349057293118, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.2957271768396714, 2.704272823160329, 0, 1, 0.09857572561322378, 0, 0.3697851753105876, 5.357064393214356, 0.9014242743867762, 1, 0.06902757707728585],
[0.003106763682324797, 2.996893236317677, 0, 1, 0.001035587894108265, 0, 0.3336788871493845, 4.83399390906891, 0.9989644121058917, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.8337526536385079, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2942220989428905, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.9256476826228536, 2.074352317377148, 1, 0, 0.308549227540951, 1.080324640544085, 0, -15.65062379829026, 1, 0.3085492275409509, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2527030896612319, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.9266932372869763, 2.073306762713026, 0, 0, 0.3088977457623253, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.5295244832473264, 2.304228170391182, 0, 0, 0.1868633391723242, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1.205836899811916, 1.726122416940609, 0, 0, 0.4112734078273351, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7030328267575942, 1.370273935955431, 0, 0, 0.3390877025055572, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.9963759773762522, 2.003624022623749, 0, 1, 0.332125325792084, 0, 0.4990956330671751, 7.230380294362194, 0.667874674207916, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7030328267575942, 1.826491656489734, 0, 0, 0.2779308251071212, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7443530998120652, 2.255646900187936, 0, 0, 0.248117699937355, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6602443101282395, 2.339755689871762, 0, 0, 0.220081436709413, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -14.48696365048946, 1, 0.3333333333333333, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 7.243481825244729, 0.6666666666666667, 1, 0.06902757707728585],
[0.9991709781843816, 2.00082902181562, 0, 1, 0.3330569927281271, 0, 0.4997928304201457, 7.240480567071897, 0.6669430072718729, 1, 0.06902757707728585],
[1.379345243322185, 1.296967173242407, 0, 0, 0.5153902193125722, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7030328267575942, 1.370273935955431, 0, 0, 0.3390877025055572, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585]
],
"RESOLVED": [
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 7.243481825244729, 0.6666666666666667, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.255646900187936, 0, 0, 0.230669099908822, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.9235569423728135, 2.003202258346178, 1, 0, 0.3155561763147208, 1.08277027015875, 0, -15.68605354562046, 1, 0.3155561763147208, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 1.926693237286978, 0, 0, 0.341682547135344, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.5295244832473264, 1.543782279465698, 0, 0, 0.2554009337983432, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 1.926693237286978, 0, 0, 0.341682547135344, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1.379345243322185, 1.296967173242407, 0, 0, 0.5153902193125722, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.8337526536385079, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2942220989428905, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.255646900187936, 0, 0, 0.230669099908822, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 7.243481825244729, 0.6666666666666667, 1, 0.06902757707728585],
[0.9266932372869763, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3166349057293118, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.296967173242406, 2.703032826757595, 0, 0, 0.09898905774746865, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.8337526536385079, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2942220989428905, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.9266932372869763, 2.073306762713026, 0, 0, 0.3088977457623253, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1.379345243322185, 1.296967173242407, 0, 0, 0.5153902193125722, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.255646900187936, 0, 0, 0.230669099908822, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.255646900187936, 0, 0, 0.230669099908822, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7030328267575942, 2.130719826880915, 0, 0, 0.2480925164216105, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.9258812925208212, 2.00082902181562, 1, 0, 0.3163556324605846, 1.080052062913359, 0, -15.64667497606199, 1, 0.3163556324605846, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.255646900187936, 0, 0, 0.230669099908822, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.9266932372869763, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3166349057293118, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.9266932372869763, 2.073306762713026, 0, 0, 0.3088977457623253, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -14.48696365048946, 1, 0.3333333333333333, 0.06902757707728585],
[0.296967173242406, 2.703032826757595, 0, 0, 0.09898905774746865, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 1.926693237286978, 0, 0, 0.341682547135344, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 1.926693237286978, 0, 0, 0.341682547135344, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7030328267575942, 2.130719826880915, 0, 0, 0.2480925164216105, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1.379345243322185, 1.296967173242407, 0, 0, 0.5153902193125722, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -14.48696365048946, 1, 0.3333333333333333, 0.06902757707728585],
[1.205836899811916, 1.726122416940609, 0, 0, 0.4112734078273351, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 1.999548199234324, 0, 1, 0.333383540979693, 0, 0.5001129757126759, 7.245118500287656, 0.666616459020307, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2527030896612319, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.9967960618674099, 2.003203938132591, 0, 1, 0.3322653539558032, 0, 0.499200296567014, 7.231896550679894, 0.6677346460441969, 1, 0.06902757707728585],
[0.9266932372869763, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3166349057293118, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.322335063025361, 0, 1, 0.2255391542913448, 0, 0.4306010859162056, 6.238102279529361, 0.7744608457086553, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.255646900187936, 0, 0, 0.230669099908822, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -14.48696365048946, 1, 0.3333333333333333, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7030328267575942, 1.370273935955431, 0, 0, 0.3390877025055572, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1.003134531909774, 1.996865468090227, 1, 0, 0.3343781773032578, 0.9968752626790683, 0, -14.4416956945038, 1, 0.3343781773032578, 0.06902757707728585],
[0.9266932372869763, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3166349057293118, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1.379345243322185, 1.296967173242407, 0, 0, 0.5153902193125722, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 1.529524483247326, 0, 0, 0.3953312200071023, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.003177045295121996, 2.99682295470488, 0, 1, 0.001059015098373998, 0, 0.3336867126001034, 4.834107276089023, 0.998940984901626, 1, 0.06902757707728585],
[0.9266932372869763, 2.073306762713026, 0, 0, 0.3088977457623253, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2527030896612319, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2527030896612319, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.255646900187936, 0, 0, 0.230669099908822, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7030328267575942, 2.130719826880915, 0, 0, 0.2480925164216105, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 1.926693237286978, 0, 0, 0.341682547135344, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7030328267575942, 2.130719826880915, 0, 0, 0.2480925164216105, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1.006830897366263, 1.993169102633738, 1, 2, 0.3356102991220875, 0.9932154472174707, 1.003427153951582, 0.1479366242665227, 0.7376996253927237, 0.7067293007473987, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 0.9999999999999996, 14.48696365048946, 0.4444444444444445, 1, 0.06902757707728585],
[0.7443530998120652, 2.255646900187936, 0, 0, 0.248117699937355, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.677340786678633, 2.322659213321369, 0, 1, 0.2257802622262109, 0, 0.430540991233068, 6.23723169003916, 0.7742197377737892, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1.205836899811916, 1.726122416940609, 0, 0, 0.4112734078273351, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.255646900187936, 0, 0, 0.230669099908822, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 1.529524483247326, 0, 0, 0.3953312200071023, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7030328267575942, 1.370273935955431, 0, 0, 0.3390877025055572, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1.379345243322185, 1.296967173242407, 0, 0, 0.5153902193125722, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2527030896612319, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7030328267575942, 2.130719826880915, 0, 0, 0.2480925164216105, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.255646900187936, 0, 0, 0.230669099908822, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.9989314987476585, 2.001068501252342, 0, 1, 0.3329771662492194, 0, 0.499733017322577, 7.239614056901596, 0.6670228337507806, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.9256476148708691, 2.074352385129133, 1, 0, 0.3085492049569562, 1.080324719617522, 0, -15.65062494382427, 1, 0.3085492049569563, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 1, 0.2254374721881966, 0, 0.4303504512089225, 6.2344713436354, 0.7745625278118035, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.9266932372869763, 2.073306762713026, 0, 0, 0.3088977457623253, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7443530998120652, 2.255646900187936, 0, 0, 0.248117699937355, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.255646900187936, 0, 0, 0.230669099908822, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.9256476912806273, 2.074352308719375, 1, 0, 0.3085492304268756, 1.080324630439586, 0, -15.65062365190675, 1, 0.3085492304268755, 0.06902757707728585],
[0, 1.940951033505349, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 7.243481825244729, 0.6666666666666667, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.9266932372869763, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3166349057293118, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7454203818976834, 2.254579618102318, 0, 1, 0.248473460632561, 0, 0.4435416660253945, 6.425571993187429, 0.751526539367439, 1, 0.06902757707728585],
[1.379345243322185, 1.296967173242407, 0, 0, 0.5153902193125722, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.9266932372869763, 2.073306762713026, 0, 0, 0.3088977457623253, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.255646900187936, 0, 0, 0.230669099908822, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.9989326893828259, 2.001067310617175, 0, 1, 0.3329775631276085, 0, 0.4997333146637516, 7.239618364472385, 0.6670224368723915, 1, 0.06902757707728585],
[0.7030328267575942, 1.826491656489734, 0, 0, 0.2779308251071212, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.8337526536385079, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2942220989428905, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.5295244832473264, 2.304228170391182, 0, 0, 0.1868633391723242, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -14.48696365048946, 1, 0.3333333333333333, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7030328267575942, 1.826491656489734, 0, 0, 0.2779308251071212, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -14.48696365048946, 1, 0.3333333333333333, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7030328267575942, 2.130719826880915, 0, 0, 0.2480925164216105, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 7.243481825244729, 0.6666666666666667, 1, 0.06902757707728585],
[0.9991709781843816, 2.00082902181562, 0, 1, 0.3330569927281271, 0, 0.4997928304201457, 7.240480567071897, 0.6669430072718729, 1, 0.06902757707728585],
[0.5295244832473264, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2093375599857957, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.5295244832473264, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2093375599857957, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7030328267575942, 2.130719826880915, 0, 0, 0.2480925164216105, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1.926693237286978, 1.073306762713024, 0, 0, 0.6422310790956589, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2527030896612319, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7428398207609289, 2.257160179239073, 1, 0, 0.2476132735869762, 1.346185236779106, 0, -19.50213659204447, 1, 0.2476132735869762, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7030328267575942, 1.826491656489734, 0, 0, 0.2779308251071212, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1.926693237286978, 1.073306762713024, 0, 0, 0.6422310790956589, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.9266932372869763, 2.073306762713026, 0, 0, 0.3088977457623253, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.8337526536385079, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2942220989428905, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7030328267575942, 1.826491656489734, 0, 0, 0.2779308251071212, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1.379345243322185, 1.296967173242407, 0, 0, 0.5153902193125722, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.322637916617955, 0, 1, 0.2255163778744125, 0, 0.4305449389443027, 6.23728888038832, 0.7744836221255875, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1.001584065968562, 1.924063633660389, 0, 1, 0.3423460952238334, 0, 0.5197333302836631, 7.529357863767263, 0.6576539047761667, 1, 0.06902757707728585],
[0, 1.940951033505349, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7030328267575942, 1.826491656489734, 0, 0, 0.2779308251071212, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7030328267575942, 2.130719826880915, 0, 0, 0.2480925164216105, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 7.243481825244729, 0.6666666666666667, 1, 0.06902757707728585],
[0.8337526536385079, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2942220989428905, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.9986485626718236, 2.001351437328177, 0, 1, 0.3328828542239411, 0, 0.4996623688116512, 7.238590574491853, 0.667117145776059, 1, 0.06902757707728585],
[0.9266932372869763, 2.073306762713026, 0, 0, 0.3088977457623253, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1.073306762713024, 1, 0, 0, 0.5176787063138447, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2527030896612319, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 7.243481825244729, 0.6666666666666667, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2527030896612319, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1.001252228655971, 1.997679270091688, 0, 1, 0.3338696562672704, 0, 0.5005808564825837, 7.251896671994073, 0.6661303437327296, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7030328267575942, 2.130719826880915, 0, 0, 0.2480925164216105, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.9266932372869763, 2.073306762713026, 0, 0, 0.3088977457623253, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7030328267575942, 2.130719826880915, 0, 0, 0.2480925164216105, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7030328267575942, 1.370273935955431, 0, 0, 0.3390877025055572, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.296967173242406, 2.703032826757595, 0, 0, 0.09898905774746865, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 1.529524483247326, 0, 0, 0.3953312200071023, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.5295244832473264, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2093375599857957, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.9256476070439289, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3163906701597606, 1.080324728752356, 0, -15.65062507616027, 1, 0.3163906701597605, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7030328267575942, 1.826491656489734, 0, 0, 0.2779308251071212, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7030328267575942, 2.130719826880915, 0, 0, 0.2480925164216105, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.9266932372869763, 2.073306762713026, 0, 0, 0.3088977457623253, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2527030896612319, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.998230352663964, 2.00139765897438, 0, 2, 0.3327847149016148, 0, 0.9993016585344183, 14.47684680306195, 0.4451762366689195, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 7.243481825244729, 0.6666666666666667, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.9266932372869763, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3166349057293118, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1.073306762713024, 1, 0, 0, 0.5176787063138447, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.9977201775180937, 2.002279822481907, 0, 1, 0.3325733925060311, 0, 0.4994306933385861, 7.235234300334848, 0.6674266074939689, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.9256477624841938, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3163907064800643, 1.080324547337817, 0, -15.65062244801444, 1, 0.3163907064800644, 0.06902757707728585],
[0.7030328267575942, 2.130719826880915, 0, 0, 0.2480925164216105, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1.379345243322185, 1.296967173242407, 0, 0, 0.5153902193125722, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2527030896612319, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1.926693237286978, 1.073306762713024, 0, 0, 0.6422310790956589, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 1.926693237286978, 0, 0, 0.341682547135344, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0, 3.000000000000001, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1.379345243322185, 1.296967173242407, 0, 0, 0.5153902193125722, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -14.48696365048946, 1, 0.3333333333333333, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 7.243481825244729, 0.6666666666666667, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1.926693237286978, 1.073306762713024, 0, 0, 0.6422310790956589, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7030328267575942, 1.370273935955431, 0, 0, 0.3390877025055572, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.5295244832473264, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2093375599857957, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.9266932372869763, 2.073306762713026, 0, 0, 0.3088977457623253, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2527030896612319, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.9989314987476585, 2.001068501252342, 0, 1, 0.3329771662492194, 0, 0.499733017322577, 7.239614056901596, 0.6670228337507806, 1, 0.06902757707728585],
[0.8337526536385079, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2942220989428905, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7443530998120652, 2.255646900187936, 0, 0, 0.248117699937355, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.9989325462953829, 2.001067453704618, 0, 1, 0.3329775154317942, 0, 0.4997332789300425, 7.239617846799439, 0.6670224845682058, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1.379345243322185, 1.296967173242407, 0, 0, 0.5153902193125722, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.9266932372869763, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3166349057293118, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.9977201775180937, 2.002279822481907, 0, 1, 0.3325733925060311, 0, 0.4994306933385861, 7.235234300334848, 0.6674266074939689, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -14.48696365048946, 1, 0.3333333333333333, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.9978653758944294, 2.002134624105572, 2, 0, 0.3326217919648096, 2.004278380946242, 0, -29.03590805023008, 1, 0.110637256489881, 0.06902757707728585],
[1.001583882379897, 1.924063938423846, 0, 1, 0.342346018293049, 0, 0.5197332479601379, 7.529356671149346, 0.657653981706951, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.322336542660503, 0, 1, 0.2255390430026734, 0, 0.4306008115664345, 6.2380983050342, 0.7744609569973266, 1, 0.06902757707728585],
[0.5295244832473264, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2093375599857957, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.9266932372869763, 2.073306762713026, 0, 0, 0.3088977457623253, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6771077011050805, 2.322892298894921, 1, 0, 0.2257025670350267, 1.476869925372197, 0, -21.39536092536811, 1, 0.2257025670350267, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2527030896612319, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7030328267575942, 1.370273935955431, 0, 0, 0.3390877025055572, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.5295244832473264, 2.304228170391182, 0, 0, 0.1868633391723242, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.002411989444589392, 2.997588010555412, 0, 1, 0.0008039964815297967, 0, 0.3336015478040004, 4.832873496783578, 0.9991960035184702, 1, 0.06902757707728585],
[0.7030328267575942, 1.370273935955431, 0, 0, 0.3390877025055572, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.5295244832473264, 2.304228170391182, 0, 0, 0.1868633391723242, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2527030896612319, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.9977202596394543, 2.002279740360547, 0, 1, 0.332573419879818, 0, 0.4994307138222014, 7.235234597080239, 0.667426580120182, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.5295244832473264, 1.543782279465698, 0, 0, 0.2554009337983432, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 1.529524483247326, 0, 0, 0.3953312200071023, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 7.243481825244729, 0.6666666666666667, 1, 0.06902757707728585],
[0.5295244832473264, 2.304228170391182, 0, 0, 0.1868633391723242, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.322335847062432, 0, 1, 0.2255390953210881, 0, 0.4306009405422216, 6.23810017350174, 0.7744609046789119, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7443530998120652, 2.255646900187936, 0, 0, 0.248117699937355, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -14.48696365048946, 1, 0.3333333333333333, 0.06902757707728585],
[1.926693237286978, 1.073306762713024, 0, 0, 0.6422310790956589, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.9996938692616808, 2.00030613073832, 0, 1, 0.3332312897538935, 0, 0.4999234790281307, 7.242373268706762, 0.6667687102461065, 1, 0.06902757707728585],
[0.9266932372869763, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3166349057293118, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.9266932372869763, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3166349057293118, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.999761022258123, 2.000238977741878, 0, 1, 0.3332536740860409, 0, 0.4999402627024727, 7.242616413186877, 0.6667463259139591, 1, 0.06902757707728585],
[0.296967173242406, 2.703032826757595, 0, 0, 0.09898905774746865, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2527030896612319, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.9266932372869763, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3166349057293118, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -14.48696365048946, 1, 0.3333333333333333, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1.926693237286978, 1.073306762713024, 0, 0, 0.6422310790956589, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.255646900187936, 0, 0, 0.230669099908822, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.5301372143915229, 2.001351156453249, 0, 1, 0.2094172031351711, 0, 0.499662438935593, 7.238591590374848, 0.7905827968648289, 1, 0.06902757707728585],
[0.5295244832473264, 2.304228170391182, 0, 0, 0.1868633391723242, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1.379345243322185, 1.296967173242407, 0, 0, 0.5153902193125722, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7030328267575942, 2.130719826880915, 0, 0, 0.2480925164216105, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2527030896612319, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1.205836899811916, 1.726122416940609, 0, 0, 0.4112734078273351, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.2999011820893474, 2.700098817910654, 0, 1, 0.09996706069644909, 0, 0.3703568155975135, 5.365345725272208, 0.9000329393035509, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7030328267575942, 2.130719826880915, 0, 0, 0.2480925164216105, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.255646900187936, 0, 0, 0.230669099908822, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.8337526536385079, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2942220989428905, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7443530998120652, 2.255646900187936, 0, 0, 0.248117699937355, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.296967173242406, 2.703032826757595, 0, 0, 0.09898905774746865, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 3, 0, 0.3333333333333333, 2.999999999999999, 0, -43.46089095146838, 1, 0.03703703703703698, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 0.9999999999999996, 14.48696365048946, 0.4444444444444445, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.5301371279264026, 2.001350965785766, 0, 1, 0.2094171919051022, 0, 0.4996624865381282, 7.238592279991046, 0.7905828080948978, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.255646900187936, 0, 0, 0.230669099908822, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7030328267575942, 2.130719826880915, 0, 0, 0.2480925164216105, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.9266932372869763, 2.073306762713026, 0, 0, 0.3088977457623253, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7030328267575942, 2.130719826880915, 0, 0, 0.2480925164216105, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1.000433359354902, 1.999423390981768, 0, 1, 0.333493710738896, 0, 0.5001441938262883, 7.245570755964796, 0.666506289261104, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1.001583863105593, 1.924063970419848, 0, 1, 0.3423460102163671, 0, 0.5197332393172931, 7.529356545940767, 0.6576539897836329, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1.379345243322185, 1.296967173242407, 0, 0, 0.5153902193125722, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7030328267575942, 1.826491656489734, 0, 0, 0.2779308251071212, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.5295244832473264, 1.543782279465698, 0, 0, 0.2554009337983432, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2527030896612319, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -14.48696365048946, 1, 0.3333333333333333, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.255646900187936, 0, 0, 0.230669099908822, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1.205836899811916, 1.726122416940609, 0, 0, 0.4112734078273351, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 7.243481825244729, 0.6666666666666667, 1, 0.06902757707728585],
[0.5295244832473264, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2093375599857957, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.296967173242406, 2.703032826757595, 0, 0, 0.09898905774746865, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7030328267575942, 1.826491656489734, 0, 0, 0.2779308251071212, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7443530998120652, 2.255646900187936, 0, 0, 0.248117699937355, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 1.926693237286978, 0, 0, 0.341682547135344, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0, 3.000000000000001, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.9970645674131862, 2.002935432586815, 0, 1, 0.3323548558043953, 0, 0.4992672173703014, 7.23286602992458, 0.6676451441956047, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2527030896612319, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1.205836899811916, 1.726122416940609, 0, 0, 0.4112734078273351, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -14.48696365048946, 1, 0.3333333333333333, 0.06902757707728585],
[0.8337526536385079, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2942220989428905, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1.379345243322185, 1.296967173242407, 0, 0, 0.5153902193125722, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.5295244832473264, 2.304228170391182, 0, 0, 0.1868633391723242, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.9266932372869763, 2.073306762713026, 0, 0, 0.3088977457623253, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2527030896612319, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -14.48696365048946, 1, 0.3333333333333333, 0.06902757707728585],
[0.9266932372869763, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3166349057293118, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7443530998120652, 2.255646900187936, 0, 0, 0.248117699937355, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.9266932372869763, 2.073306762713026, 0, 0, 0.3088977457623253, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 7.243481825244729, 0.6666666666666667, 1, 0.06902757707728585],
[0.7030328267575942, 1.370273935955431, 0, 0, 0.3390877025055572, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1.379345243322185, 1.296967173242407, 0, 0, 0.5153902193125722, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1.205836899811916, 1.726122416940609, 0, 0, 0.4112734078273351, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1.924407745453684, 1.074240673218466, 1, 0, 0.6417583780314742, 0.5196403944862774, 0, -7.528011506248707, 1, 0.6417583780314742, 0.06902757707728585],
[0.9985560706236378, 2.001443929376363, 0, 1, 0.3328520235412125, 0, 0.4996392780843946, 7.238256059965422, 0.6671479764587875, 1, 0.06902757707728585],
[0.5295244832473264, 2.304228170391182, 0, 0, 0.1868633391723242, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1.926693237286978, 1.073306762713024, 0, 0, 0.6422310790956589, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7030328267575942, 1.826491656489734, 0, 0, 0.2779308251071212, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 1.9997622779487, 0, 1, 0.3333597489877835, 0, 0.5000594375776365, 7.244342895271425, 0.6666402510122165, 1, 0.06902757707728585],
[0.7030328267575942, 1.826491656489734, 0, 0, 0.2779308251071212, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2527030896612319, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.9252504926389936, 2.074749507361008, 1, 0, 0.3084168308796644, 1.080788400498773, 0, -15.65734227189638, 1, 0.3084168308796644, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 1.926693237286978, 0, 0, 0.341682547135344, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.255646900187936, 0, 0, 0.230669099908822, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.8337526536385079, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2942220989428905, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.9986478879998736, 2.001352112000128, 0, 1, 0.332882629333291, 0, 0.4996622003714338, 7.238588134304546, 0.667117370666709, 1, 0.06902757707728585],
[0, 3.000000000000001, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7030328267575942, 2.130719826880915, 0, 0, 0.2480925164216105, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.2999012853054571, 2.700098714694544, 0, 1, 0.09996709510181902, 0, 0.3703568297550661, 5.365345930372158, 0.900032904898181, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 1.9997622779487, 0, 1, 0.3333597489877835, 0, 0.5000594375776365, 7.244342895271425, 0.6666402510122165, 1, 0.06902757707728585],
[0.9266932372869763, 2.073306762713026, 0, 0, 0.3088977457623253, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0, 3.000000000000001, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.9266932372869763, 2.073306762713026, 0, 0, 0.3088977457623253, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -14.48696365048946, 1, 0.3333333333333333, 0.06902757707728585],
[1, 1.529524483247326, 0, 0, 0.3953312200071023, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.255646900187936, 0, 0, 0.230669099908822, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1.073306762713024, 1.926693237286978, 0, 0, 0.3577689209043411, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -14.48696365048946, 1, 0.3333333333333333, 0.06902757707728585],
[0.6771077011050806, 2.254834889000509, 1, 0, 0.2309416642024684, 1.476869925372197, 0, -21.3953609253681, 1, 0.2309416642024684, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7030328267575942, 1.826491656489734, 0, 0, 0.2779308251071212, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7443530998120652, 2.255646900187936, 0, 0, 0.248117699937355, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.9266932372869763, 2.073306762713026, 0, 0, 0.3088977457623253, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -14.48696365048946, 1, 0.3333333333333333, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1.205836899811916, 1.726122416940609, 0, 0, 0.4112734078273351, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2527030896612319, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.5295244832473264, 2.304228170391182, 0, 0, 0.1868633391723242, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7030328267575942, 2.130719826880915, 0, 0, 0.2480925164216105, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7030328267575942, 2.130719826880915, 0, 0, 0.2480925164216105, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.9266932372869763, 2.073306762713026, 0, 1, 0.3088977457623253, 0, 0.4823212936861547, 6.987371049488377, 0.6911022542376748, 1, 0.06902757707728585],
[0.7030328267575942, 2.130719826880915, 0, 0, 0.2480925164216105, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1.001583926626596, 1.924063864972813, 0, 1, 0.3423460368341348, 0, 0.5197332678009262, 7.529356958582125, 0.6576539631658652, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7030328267575942, 1.370273935955431, 0, 0, 0.3390877025055572, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.9266932372869763, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3166349057293118, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7030328267575942, 2.130719826880915, 0, 0, 0.2480925164216105, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.007281685828128721, 2.992718314171873, 0, 2, 0.002427228609376239, 0, 0.6682887562551733, 9.681474919899509, 0.9951514342199697, 1, 0.06902757707728585],
[0.6776637073372075, 2.322336292662794, 0, 1, 0.2258879024457357, 0, 0.4306008579202794, 6.238098976560666, 0.7741120975542642, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2527030896612319, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.5295244832473264, 2.304228170391182, 0, 0, 0.1868633391723242, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.9986489651279893, 2.001351034872012, 1, 1, 0.3328829883759963, 1.00135286263661, 0.4996624692898768, -7.267970492213882, 0.8891889160498663, 0.5549548928018588, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.9860397080183969, 2.013960291981604, 0, 1, 0.3286799026727989, 0, 0.4965341193574706, 7.193271738359474, 0.6713200973272011, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 1.926693237286978, 0, 0, 0.341682547135344, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7443530998120652, 2.255646900187936, 0, 0, 0.248117699937355, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.9266932372869763, 2.073306762713026, 0, 0, 0.3088977457623253, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6602443101282395, 2.339755689871762, 0, 0, 0.220081436709413, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7030328267575942, 1.370273935955431, 0, 0, 0.3390877025055572, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.296967173242406, 2.703032826757595, 0, 0, 0.09898905774746865, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -14.48696365048946, 1, 0.3333333333333333, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.8337526536385079, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2942220989428905, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7015835898925488, 1.827940893354779, 1, 0, 0.2773578965291835, 1.425346907206247, 0, -20.64894883403447, 1, 0.2773578965291835, 0.06902757707728585],
[0.92587700368272, 2.074122996317282, 1, 0, 0.3086256678942398, 1.080057065919612, 0, -15.64674745443172, 1, 0.3086256678942398, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.997064721241913, 2.002935278758088, 0, 1, 0.3323549070806376, 0, 0.4992672557148456, 7.232866585420598, 0.6676450929193625, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.9258812925208212, 2.07411870747918, 1, 0, 0.3086270975069402, 1.080052062913359, 0, -15.64667497606199, 1, 0.3086270975069403, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 4, 0.3333333333333333, 0, 1.999999999999999, 28.97392730097892, 0.1975308641975309, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 7.243481825244729, 0.6666666666666667, 1, 0.06902757707728585],
[0, 1.940951033505349, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.8337526536385079, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2942220989428905, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7030328267575942, 2.130719826880915, 0, 0, 0.2480925164216105, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -14.48696365048946, 1, 0.3333333333333333, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7443530998120652, 2.255646900187936, 0, 0, 0.248117699937355, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 1.926693237286978, 0, 0, 0.341682547135344, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2527030896612319, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 1.926693237286978, 0, 0, 0.341682547135344, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.5301373452711583, 1.547038503136039, 0, 1, 0.2552202528628829, 0, 0.6463963230216156, 9.364320035424193, 0.7447797471371171, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -14.48696365048946, 1, 0.3333333333333333, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 1.926693237286978, 0, 0, 0.341682547135344, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.5301372735265233, 2.304309406899408, 0, 1, 0.1870337788279932, 0, 0.4339694994977096, 6.286900364644425, 0.8129662211720068, 1, 0.06902757707728585],
[0.7443530998120652, 2.255646900187936, 0, 0, 0.248117699937355, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1.205836899811916, 1.726122416940609, 0, 0, 0.4112734078273351, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 1.529524483247326, 0, 0, 0.3953312200071023, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1.926693237286978, 1.073306762713024, 0, 0, 0.6422310790956589, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7030328267575942, 1.370273935955431, 0, 0, 0.3390877025055572, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -14.48696365048946, 1, 0.3333333333333333, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 1.926693237286978, 1, 0, 0.341682547135344, 0.9999999999999996, 0, -14.48696365048946, 1, 0.341682547135344, 0.06902757707728585],
[1, 1.926693237286978, 0, 0, 0.341682547135344, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.5295244832473264, 1.543782279465698, 0, 0, 0.2554009337983432, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -14.48696365048946, 1, 0.3333333333333333, 0.06902757707728585],
[1, 1.926693237286978, 0, 0, 0.341682547135344, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7030328267575942, 1.826491656489734, 0, 0, 0.2779308251071212, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.677357274937502, 2.026177041657104, 1, 1, 0.250545099716251, 1.47632576928072, 0.4935402876651649, -14.23757754839333, 0.9372271530081737, 0.4383173524406759, 0.06902757707728585],
[0.9266932372869763, 2.073306762713026, 0, 0, 0.3088977457623253, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2527030896612319, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.296967173242406, 2.703032826757595, 0, 0, 0.09898905774746865, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.9266932372869763, 2.073306762713026, 0, 0, 0.3088977457623253, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -14.48696365048946, 1, 0.3333333333333333, 0.06902757707728585],
[0.7030328267575942, 1.370273935955431, 0, 0, 0.3390877025055572, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 7.243481825244729, 0.6666666666666667, 1, 0.06902757707728585],
[0.7030328267575942, 1.826491656489734, 0, 0, 0.2779308251071212, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.9256478710541686, 2.074352128945833, 1, 0, 0.3085492903513893, 1.080324420625692, 0, -15.65062061234049, 1, 0.3085492903513893, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.255646900187936, 0, 0, 0.230669099908822, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.9266932372869763, 2.073306762713026, 0, 0, 0.3088977457623253, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.8337526536385079, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2942220989428905, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7443530998120652, 2.255646900187936, 0, 0, 0.248117699937355, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.8337526536385079, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2942220989428905, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 7.243481825244729, 0.6666666666666667, 1, 0.06902757707728585],
[0.7030328267575942, 2.130719826880915, 0, 0, 0.2480925164216105, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1.003167339661395, 1.994130033802584, 0, 2, 0.3346906278111583, 0, 1.002943622581233, 14.52960780382455, 0.4426365607223107, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.296967173242406, 2.703032826757595, 0, 0, 0.09898905774746865, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.9266932372869763, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3166349057293118, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.2957271768396714, 2.704272823160329, 0, 1, 0.09857572561322378, 0, 0.3697851753105876, 5.357064393214356, 0.9014242743867762, 1, 0.06902757707728585],
[0.003106763682324797, 2.996893236317677, 0, 1, 0.001035587894108265, 0, 0.3336788871493845, 4.83399390906891, 0.9989644121058917, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.8337526536385079, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2942220989428905, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.9256476826228536, 2.074352317377148, 1, 0, 0.308549227540951, 1.080324640544085, 0, -15.65062379829026, 1, 0.3085492275409509, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2527030896612319, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.9266932372869763, 2.073306762713026, 0, 0, 0.3088977457623253, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.5295244832473264, 2.304228170391182, 0, 0, 0.1868633391723242, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1.205836899811916, 1.726122416940609, 0, 0, 0.4112734078273351, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7030328267575942, 1.370273935955431, 0, 0, 0.3390877025055572, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.9963759773762522, 2.003624022623749, 0, 1, 0.332125325792084, 0, 0.4990956330671751, 7.230380294362194, 0.667874674207916, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7030328267575942, 1.826491656489734, 0, 0, 0.2779308251071212, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7443530998120652, 2.255646900187936, 0, 0, 0.248117699937355, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6602443101282395, 2.339755689871762, 0, 0, 0.220081436709413, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.6763124165645901, 2.323687583435412, 0, 0, 0.2254374721881966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -14.48696365048946, 1, 0.3333333333333333, 0.06902757707728585],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 7.243481825244729, 0.6666666666666667, 1, 0.06902757707728585],
[0.9991709781843816, 2.00082902181562, 0, 1, 0.3330569927281271, 0, 0.4997928304201457, 7.240480567071897, 0.6669430072718729, 1, 0.06902757707728585],
[1.379345243322185, 1.296967173242407, 0, 0, 0.5153902193125722, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585],
[0.7030328267575942, 1.370273935955431, 0, 0, 0.3390877025055572, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06902757707728585]
]
}
}
},
"headers": [
["ES", "Expected synonymous sites"],
["EN", "Expected non-synonymous sites"],
["S", "Inferred synonymous substitutions"],
["N", "Inferred non-synonymous substitutions"],
["P[S]", "Expected proportion of synonymous sites"],
["dS", "Inferred synonymous susbsitution rate"],
["dN", "Inferred non-synonymous susbsitution rate"],
["dN-dS", "Scaled by the length of the tested branches"],
["P [dN/dS > 1]", "Binomial probability that S is no greater than the observed value, with Ps probability of success"],
["P [dN/dS < 1]", "Binomial probability that S is no less than the observed value, with Ps probability of success"],
["Total branch length", "The total length of branches contributing to inference at this site, and used to scale dN-dS"]
]
},
"analysis":{
"authors":"Sergei L Kosakovsky Pond and Simon DW Frost",
"citation":"Not So Different After All: A Comparison of Methods for Detecting Amino Acid Sites Under Selection (2005). _Mol Biol Evol_ 22 (5): 1208-1222",
"contact":"spond@temple.edu",
"info":"SLAC (Single Likelihood Ancestor Counting)\n uses a maximum likelihood ancestral state reconstruction\n and minimum path substitution counting to estimate site - level\n dS and dN,\n and applies a simple binomial - based test to test\n if dS differs drom dN.\n The estimates aggregate information over all branches,\n so the signal is derived from\n pervasive diversification or conservation. A subset of branches can be selected\n for testing as well.\n Multiple partitions within a NEXUS file are also supported\n for recombination - aware analysis.\n ",
"requirements":"in-frame codon alignment and a phylogenetic tree",
"version":"2.00"
},
"branch attributes":{
"0":{
"Node1000":{
"Global MG94xREV":0.0004408970728436324,
"Nucleotide GTR":0.0004243993313027439,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "L", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CTA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1010":{
"Global MG94xREV":0.000576283040256657,
"Nucleotide GTR":0.0005547193483245871,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTC", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1011":{
"Global MG94xREV":0.0005764107001414348,
"Nucleotide GTR":0.0005548422313579993,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "S", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "TCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTC", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1018":{
"Global MG94xREV":0.0005763744443572896,
"Nucleotide GTR":0.0005548073322137442,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATT", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1021":{
"Global MG94xREV":0.0005759806838260657,
"Nucleotide GTR":0.0005544283056416987,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCG", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1022":{
"Global MG94xREV":0.0005761565109998962,
"Nucleotide GTR":0.000554597553612698,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCG", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1029":{
"Global MG94xREV":0.0005764224804938452,
"Nucleotide GTR":0.0005548535709063739,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "L", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TTA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1034":{
"Global MG94xREV":0.000326639168300426,
"Nucleotide GTR":0.0003144167950807648,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1035":{
"Global MG94xREV":0.0002497272678054527,
"Nucleotide GTR":0.000240382828538949,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1043":{
"Global MG94xREV":0.0005763712362672042,
"Nucleotide GTR":0.0005548042441658283,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATT", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1047":{
"Global MG94xREV":0.0005762368664560039,
"Nucleotide GTR":0.0005546749022818991,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "S", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "TCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1053":{
"Global MG94xREV":0.0003919803892909214,
"Nucleotide GTR":0.00037731304049246,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "S", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "TCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1054":{
"Global MG94xREV":0.0001842739603199826,
"Nucleotide GTR":0.0001773786907495423,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "S", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "TCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1059":{
"Global MG94xREV":0.0005765215200622789,
"Nucleotide GTR":0.0005549489045549843,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "F", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "TTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1063":{
"Global MG94xREV":0.0003977426158105421,
"Nucleotide GTR":0.000382859652689201,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "C", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "TGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1064":{
"Global MG94xREV":0.0001785125465861646,
"Nucleotide GTR":0.0001718328609253145,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "C", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "TGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1070":{
"Global MG94xREV":0.0005764892939359726,
"Nucleotide GTR":0.0005549178842845008,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "L", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TTA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1076":{
"Global MG94xREV":0.0003780973710644398,
"Nucleotide GTR":0.0003639495050673286,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "M", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ATG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1077":{
"Global MG94xREV":0.0001981861276579744,
"Nucleotide GTR":0.000190770284567879,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "M", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ATG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1078":{
"Global MG94xREV":0.0005764103175913445,
"Nucleotide GTR":0.0005548418631223905,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "M", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ATG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1085":{
"Global MG94xREV":0.0005767434482788476,
"Nucleotide GTR":0.0005551625285332556,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "L", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CTA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1091":{
"Global MG94xREV":0.0005764183331763737,
"Nucleotide GTR":0.0005548495787756249,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCG", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1094":{
"Global MG94xREV":0.0004465383805843979,
"Nucleotide GTR":0.0004298295493293971,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "V", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GTT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1100":{
"Global MG94xREV":0.0004385045528542714,
"Nucleotide GTR":0.0004220963360093885,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAC", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1103":{
"Global MG94xREV":0.0004476906798737341,
"Nucleotide GTR":0.0004309387312178153,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "I", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ATA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1110":{
"Global MG94xREV":0.0005764938970395447,
"Nucleotide GTR":0.000554922315146483,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAT", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1114":{
"Global MG94xREV":0.0004500554624616891,
"Nucleotide GTR":0.0004332150270038854,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "H", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CAC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1117":{
"Global MG94xREV":0.0004476906798737341,
"Nucleotide GTR":0.0004309387312178153,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "I", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ATT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1120":{
"Global MG94xREV":0.0004476906798737341,
"Nucleotide GTR":0.0004309387312178153,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTT", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1124":{
"Global MG94xREV":0.0004386074779741239,
"Nucleotide GTR":0.000422195409817608,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCG", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1131":{
"Global MG94xREV":0.0004476906798737341,
"Nucleotide GTR":0.0004309387312178153,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAT", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1134":{
"Global MG94xREV":0.0004476906798737341,
"Nucleotide GTR":0.0004309387312178153,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGT", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1138":{
"Global MG94xREV":0.0004386074779741239,
"Nucleotide GTR":0.000422195409817608,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "G", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "GGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1141":{
"Global MG94xREV":0.0004386074779741239,
"Nucleotide GTR":0.000422195409817608,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "V", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "GTG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1145":{
"Global MG94xREV":0.0004385045528542714,
"Nucleotide GTR":0.0004220963360093885,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGC", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1148":{
"Global MG94xREV":0.0004476906798737341,
"Nucleotide GTR":0.0004309387312178153,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "I", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ATT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node115":{
"Global MG94xREV":0.000576449800021088,
"Nucleotide GTR":0.0005548798681757537,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "A", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "GCA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1152":{
"Global MG94xREV":0.0004476906798737341,
"Nucleotide GTR":0.0004309387312178153,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "S", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "TCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1155":{
"Global MG94xREV":0.0004386074779741239,
"Nucleotide GTR":0.000422195409817608,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACG", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1163":{
"Global MG94xREV":0.000576401338063202,
"Nucleotide GTR":0.0005548332195954226,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "H", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAT", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1180":{
"Global MG94xREV":0.0005764010201996513,
"Nucleotide GTR":0.0005548329136258739,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTT", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1188":{
"Global MG94xREV":0.0004326387905938163,
"Nucleotide GTR":0.0004164500622320142,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "V", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GTT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1200":{
"Global MG94xREV":0.0004500554624616891,
"Nucleotide GTR":0.0004332150270038854,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTT", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1216":{
"Global MG94xREV":0.0005762209906525557,
"Nucleotide GTR":0.0005546596205284406,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "V", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GTT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1238":{
"Global MG94xREV":0.0005765240259985086,
"Nucleotide GTR":0.0005549513167226432,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "V", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "V", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GTT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GTT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1243":{
"Global MG94xREV":0.0005765360279060446,
"Nucleotide GTR":0.0005549628695358653,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGT", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1248":{
"Global MG94xREV":0.0005761004419739237,
"Nucleotide GTR":0.0005545435826099516,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGC", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1252":{
"Global MG94xREV":0.0005764333938032365,
"Nucleotide GTR":0.0005548640758552459,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "I", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ATA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1255":{
"Global MG94xREV":0.0003571204406352741,
"Nucleotide GTR":0.0003437575015470884,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTT", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1256":{
"Global MG94xREV":0.0002191905622867597,
"Nucleotide GTR":0.0002109887631196979,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTT", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1260":{
"Global MG94xREV":0.0003728032082332511,
"Nucleotide GTR":0.0003588534422813523,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "I", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ATT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1261":{
"Global MG94xREV":0.0002034757863298949,
"Nucleotide GTR":0.0001958620117338223,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "I", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ATT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1265":{
"Global MG94xREV":0.000383220386544916,
"Nucleotide GTR":0.0003688808245930966,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "V", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GTA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1266":{
"Global MG94xREV":0.0001930458618498859,
"Nucleotide GTR":0.0001858223601972294,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "V", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GTA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1275":{
"Global MG94xREV":0.0005763980400221848,
"Nucleotide GTR":0.0005548300449624101,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "F", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "TTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1282":{
"Global MG94xREV":0.0005764493355307837,
"Nucleotide GTR":0.0005548794210660161,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "I", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ATT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1286":{
"Global MG94xREV":0.0005763991342949045,
"Nucleotide GTR":0.0005548310982890008,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGT", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1290":{
"Global MG94xREV":0.0004463201113525578,
"Nucleotide GTR":0.0004296194474218488,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "V", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GTT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1293":{
"Global MG94xREV":0.000447351632815207,
"Nucleotide GTR":0.0004306123708181168,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "I", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATT", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1299":{
"Global MG94xREV":0.0005763720650495406,
"Nucleotide GTR":0.0005548050419363083,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "I", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ATT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1310":{
"Global MG94xREV":0.0005761969236873843,
"Nucleotide GTR":0.0005546364541148848,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "D", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAT", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1318":{
"Global MG94xREV":0.0002855990022825408,
"Nucleotide GTR":0.0002749122937190119,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1319":{
"Global MG94xREV":0.0002906548466282587,
"Nucleotide GTR":0.0002797789555583714,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "L", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "TTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1329":{
"Global MG94xREV":0.0004557237059907907,
"Nucleotide GTR":0.0004386711729199756,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "F", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "TTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1347":{
"Global MG94xREV":0.0004557237059907907,
"Nucleotide GTR":0.0004386711729199756,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTT", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1355":{
"Global MG94xREV":0.0004557237059907907,
"Nucleotide GTR":0.0004386711729199756,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "F", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "TTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1362":{
"Global MG94xREV":0.0005765117944022269,
"Nucleotide GTR":0.0005549395428153018,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "S", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "TCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1378":{
"Global MG94xREV":0.000340389150509043,
"Nucleotide GTR":0.000327652272506652,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "V", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GTT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1381":{
"Global MG94xREV":0.0005762782447828254,
"Nucleotide GTR":0.0005547147322905675,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "D", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAT", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1397":{
"Global MG94xREV":0.0004557237059907907,
"Nucleotide GTR":0.0004386711729199756,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTT", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node140":{
"Global MG94xREV":0.0005766857926109319,
"Nucleotide GTR":0.0005551070302584503,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "F", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "TTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1404":{
"Global MG94xREV":0.0004669703722810026,
"Nucleotide GTR":0.0004494970049495838,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTA", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1411":{
"Global MG94xREV":0.0004557237059907907,
"Nucleotide GTR":0.0004386711729199756,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "L", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "TTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1418":{
"Global MG94xREV":0.0005763338616949628,
"Nucleotide GTR":0.0005547682680969364,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "N", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAT", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1425":{
"Global MG94xREV":0.0005764154659945042,
"Nucleotide GTR":0.0005548468188796239,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "L", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TTA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node146":{
"Global MG94xREV":0.000576153812390775,
"Nucleotide GTR":0.0005545949559816932,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCG", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node165":{
"Global MG94xREV":0.0005766857685633069,
"Nucleotide GTR":0.0005551070071106536,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTT", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node173":{
"Global MG94xREV":0.0005761538127934822,
"Nucleotide GTR":0.0005545949563693319,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "V", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "GTA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node192":{
"Global MG94xREV":0.0005763741389683579,
"Nucleotide GTR":0.0005548070382520316,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "I", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATT", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node242":{
"Global MG94xREV":0.0005761925587875308,
"Nucleotide GTR":0.0005546322525433773,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "S", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "TCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node268":{
"Global MG94xREV":0.0005765579105117387,
"Nucleotide GTR":0.0005549839333255693,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "V", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GTA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node293":{
"Global MG94xREV":0.0005765439471670401,
"Nucleotide GTR":0.0005549704924693745,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "I", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "ATT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node294":{
"Global MG94xREV":0.0005768278427477758,
"Nucleotide GTR":0.0005552437650811591,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "I", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "ATT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACC", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node328":{
"Global MG94xREV":0.000576498670768992,
"Nucleotide GTR":0.0005549269102497616,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAT", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node423":{
"Global MG94xREV":0.0002132280612590629,
"Nucleotide GTR":0.0002052493704021966,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node437":{
"Global MG94xREV":0.0004557237059907907,
"Nucleotide GTR":0.0004386711729199756,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTT", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node446":{
"Global MG94xREV":0.0005761038704591663,
"Nucleotide GTR":0.0005545468828061517,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTC", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node454":{
"Global MG94xREV":0.000286507536992984,
"Nucleotide GTR":0.0002757868323524634,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node455":{
"Global MG94xREV":0.0002898072731443158,
"Nucleotide GTR":0.0002789630970690073,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTT", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node463":{
"Global MG94xREV":0.0005762289071134239,
"Nucleotide GTR":0.0005546672407665995,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "Y", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "TAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node471":{
"Global MG94xREV":0.0004669703722810026,
"Nucleotide GTR":0.0004494970049495838,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATA", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node500":{
"Global MG94xREV":0.0005764250185002919,
"Nucleotide GTR":0.0005548560139442282,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACT", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node506":{
"Global MG94xREV":0.0004476906798737341,
"Nucleotide GTR":0.0004309387312178153,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTT", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node51":{
"Global MG94xREV":0.0005763355329895644,
"Nucleotide GTR":0.0005547698768540697,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "V", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "GTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node512":{
"Global MG94xREV":0.0004476906798737341,
"Nucleotide GTR":0.0004309387312178153,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "S", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "TCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node515":{
"Global MG94xREV":0.0004476906798737341,
"Nucleotide GTR":0.0004309387312178153,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCT", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node595":{
"Global MG94xREV":0.0005762483825148633,
"Nucleotide GTR":0.0005546859874262103,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "V", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "GTG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node618":{
"Global MG94xREV":0.0004408513952691452,
"Nucleotide GTR":0.0004243553629181443,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCT", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node619":{
"Global MG94xREV":0.0001354005294165274,
"Nucleotide GTR":0.0001303340341358805,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCT", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node625":{
"Global MG94xREV":0.0004408513952691452,
"Nucleotide GTR":0.0004243553629181443,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "I", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ATA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node626":{
"Global MG94xREV":0.0001354005048833686,
"Nucleotide GTR":0.0001303340105207177,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "I", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ATA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node636":{
"Global MG94xREV":0.000576394773377104,
"Nucleotide GTR":0.0005548269005505432,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAT", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node639":{
"Global MG94xREV":0.0005764031863253457,
"Nucleotide GTR":0.0005548349986982246,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "I", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ATA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node648":{
"Global MG94xREV":0.0003420925551524245,
"Nucleotide GTR":0.000329291938170401,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGT", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node651":{
"Global MG94xREV":0.0005765255848477788,
"Nucleotide GTR":0.0005549528172419902,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "Y", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "TAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node658":{
"Global MG94xREV":0.0003414809730412617,
"Nucleotide GTR":0.0003287032405922102,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTT", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node659":{
"Global MG94xREV":0.0002348837507829741,
"Nucleotide GTR":0.0002260947348170047,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTT", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node725":{
"Global MG94xREV":0.0004476745536323197,
"Nucleotide GTR":0.0004309232083974241,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "I", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ATA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node728":{
"Global MG94xREV":0.0004476906798737341,
"Nucleotide GTR":0.0004309387312178153,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "I", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ATA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node731":{
"Global MG94xREV":0.0004476906798737341,
"Nucleotide GTR":0.0004309387312178153,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "S", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "TCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node734":{
"Global MG94xREV":0.0004476906798737341,
"Nucleotide GTR":0.0004309387312178153,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "Y", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "TAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node746":{
"Global MG94xREV":0.0005764546367666524,
"Nucleotide GTR":0.0005548845239371768,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAT", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node755":{
"Global MG94xREV":0.0005765403435298823,
"Nucleotide GTR":0.0005549670236751953,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAT", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node760":{
"Global MG94xREV":0.0005761784842127012,
"Nucleotide GTR":0.0005546187046191244,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "V", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GTT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node763":{
"Global MG94xREV":0.0005768599824713692,
"Nucleotide GTR":0.0005552747021819957,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "Y", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "TAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node769":{
"Global MG94xREV":0.0005764015235296935,
"Nucleotide GTR":0.0005548333981220217,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "L", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CTT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node776":{
"Global MG94xREV":0.0005764594569516583,
"Nucleotide GTR":0.0005548891637577134,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "TTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node779":{
"Global MG94xREV":0.0005763935466298634,
"Nucleotide GTR":0.0005548257197064403,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "N", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "AAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node790":{
"Global MG94xREV":0.0005763251643189415,
"Nucleotide GTR":0.000554759896164358,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "L", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "TTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node796":{
"Global MG94xREV":0.0005765623285762168,
"Nucleotide GTR":0.0005549881860723578,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGT", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node797":{
"Global MG94xREV":0.0005763650905642188,
"Nucleotide GTR":0.0005547983284263101,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "L", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGT", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "TTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node802":{
"Global MG94xREV":0.0005762113964373422,
"Nucleotide GTR":0.0005546503853151183,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "I", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATT", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node807":{
"Global MG94xREV":0.0003017103322899163,
"Nucleotide GTR":0.0002904207606667004,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "S", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "TCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node808":{
"Global MG94xREV":0.0002745723254283645,
"Nucleotide GTR":0.0002642982194335528,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "S", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "TCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node813":{
"Global MG94xREV":0.001153112379281558,
"Nucleotide GTR":0.00110996455369431,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "S", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AGT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAG", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node832":{
"Global MG94xREV":0.0005766550158369045,
"Nucleotide GTR":0.0005550774051075457,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node850":{
"Global MG94xREV":0.0005761147492282594,
"Nucleotide GTR":0.000554557354507174,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAC", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node855":{
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node871":{
"Global MG94xREV":0.000576564858258674,
"Nucleotide GTR":0.0005549906210976941,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "V", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GTT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node872":{
"Global MG94xREV":0.0005765408092467208,
"Nucleotide GTR":0.0005549674719655727,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "V", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GTT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node876":{
"Global MG94xREV":0.0005763590506198604,
"Nucleotide GTR":0.0005547925144880803,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTG", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node879":{
"Global MG94xREV":0.0005763053649200356,
"Nucleotide GTR":0.0005547408376308064,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "V", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GTT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node882":{
"Global MG94xREV":0.0005764385831998638,
"Nucleotide GTR":0.0005548690710720296,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "L", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TTA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node885":{
"Global MG94xREV":0.0005764539314616639,
"Nucleotide GTR":0.0005548838450236978,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "M", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATG", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node891":{
"Global MG94xREV":0.0005763566573587016,
"Nucleotide GTR":0.0005547902107793518,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "V", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "GTT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node894":{
"Global MG94xREV":0.0005763494591690259,
"Nucleotide GTR":0.0005547832819356979,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node898":{
"Global MG94xREV":0.0005765582540711664,
"Nucleotide GTR":0.0005549842640294925,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node939":{
"Global MG94xREV":0.001152585081626056,
"Nucleotide GTR":0.001109456986767296,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "S", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "A", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "TCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "GCT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node971":{
"Global MG94xREV":0.000576226389483788,
"Nucleotide GTR":0.0005546648173430856,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "F", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "TTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node976":{
"Global MG94xREV":0.0005762786414276981,
"Nucleotide GTR":0.000554715114093553,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTT", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node984":{
"Global MG94xREV":0.0005761740814287432,
"Nucleotide GTR":0.0005546144665810814,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "T", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ACA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_406036_California_20200122_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0001225658919535026,
"Nucleotide GTR":0.0001238227146751708,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "I", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ATA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_406036_California_20200122_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_411951_Sweden_20200207_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005488814794815784,
"Nucleotide GTR":0.0005545098537700549,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACG", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_411951_Sweden_20200207_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413485_Anhui_20200124_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005494476531704701,
"Nucleotide GTR":0.000555081833152075,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "T", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "ACT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413485_Anhui_20200124_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413523_Kerala_20200131_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0001225659087360603,
"Nucleotide GTR":0.0001238227316298212,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "I", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ATA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413523_Kerala_20200131_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413695_China_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00114929389116656,
"Nucleotide GTR":0.001161079051403802,
"amino-acid": [
["-", "-", "-", "-", "-", "-", "Y", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "ILVF", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["---", "---", "---", "---", "---", "---", "TAT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "-TT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413695_China_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413749_China_20200201_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005494511482045893,
"Nucleotide GTR":0.0005550853640251872,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCT", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413749_China_20200201_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413898_Guangdong_20200228_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005499120254682585,
"Nucleotide GTR":0.0005555509672448925,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "E", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "HPRL", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAA", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CNT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413898_Guangdong_20200228_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413931_California_20200305_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005489001034105671,
"Nucleotide GTR":0.0005545286686736835,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "F", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCG", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "TTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413931_California_20200305_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414379_Singapore_20200218_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005491746110789303,
"Nucleotide GTR":0.000554805991215495,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "A", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GCA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414379_Singapore_20200218_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414567_Hong_Kong_20200210_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005488821782223851,
"Nucleotide GTR":0.0005545105596759329,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCG", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414567_Hong_Kong_20200210_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415149_England_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "AS", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "KCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415149_England_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415519_Noord_Brabant_20200101_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005492381895141151,
"Nucleotide GTR":0.0005548702216005875,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "F", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "S", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "TTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "TCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415519_Noord_Brabant_20200101_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415592_Washington_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005490390229312026,
"Nucleotide GTR":0.0005546690127114275,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTC", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415592_Washington_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415593_Washington_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001098755910801148,
"Nucleotide GTR":0.001110022841366022,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "H", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "CAT", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415593_Washington_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416347_Shanghai_20200206_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005492757264675247,
"Nucleotide GTR":0.000554908143467737,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "T", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "ACA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416347_Shanghai_20200206_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416348_Shanghai_20200206_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0005491103006078686,
"Nucleotide GTR":0.0005547410212880378,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "I", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "ATC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416348_Shanghai_20200206_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416349_Shanghai_20200130_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005492757288446521,
"Nucleotide GTR":0.0005549081458692401,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "T", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "ACT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416349_Shanghai_20200130_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416386_Shanghai_20200131_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005494396121649981,
"Nucleotide GTR":0.000555073709692028,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "I", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "ATT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416386_Shanghai_20200131_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416396_Shanghai_20200210_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005492381895141151,
"Nucleotide GTR":0.0005548702216005875,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "L", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTT", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CTT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416396_Shanghai_20200210_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416414_Victoria_20200306_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "KGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416414_Victoria_20200306_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416670_Washington_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001099197876546481,
"Nucleotide GTR":0.001110469339143733,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "P", "I", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "CCA", "ATA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416670_Washington_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416679_Washington_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005493442936275843,
"Nucleotide GTR":0.0005549774137333947,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "K", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "AAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416679_Washington_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416682_USA_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005490529634032108,
"Nucleotide GTR":0.0005546830961326829,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCT", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416682_USA_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416689_Washington_20200314_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005494594871090408,
"Nucleotide GTR":0.0005550937884389466,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "T", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "ACT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416689_Washington_20200314_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417107_Washington_20200305_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0001289058430823316,
"Nucleotide GTR":0.000130227677321527,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "L", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CTA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417107_Washington_20200305_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417117_Washington_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005492013195641124,
"Nucleotide GTR":0.0005548329735764712,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGC", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417117_Washington_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417149_Washington_20200228_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTT", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417149_Washington_20200228_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417150_Washington_20200228_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "ILV", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "NTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTT", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417150_Washington_20200228_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417238_England_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "V", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "GTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417238_England_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417242_England_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATY", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417242_England_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417261_England_20200306_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "TI", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "AYA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417261_England_20200306_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417324_California_20200304_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005491224748743006,
"Nucleotide GTR":0.0005547533203925829,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "F", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TTT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417324_California_20200304_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417368_USA_20200313_null_2":{
"Global MG94xREV":0.000549279178187423,
"Nucleotide GTR":0.0005549116305824743,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "I", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ATT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417368_USA_20200313_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417518_Taoyuan_20200204_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005488821782223851,
"Nucleotide GTR":0.0005545105596759329,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "R", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AGA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417518_Taoyuan_20200204_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417530_Luxembourg_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "PL", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CYG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417530_Luxembourg_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417556_Reykjavik_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005488829867091546,
"Nucleotide GTR":0.0005545113764531368,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTG", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417556_Reykjavik_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417577_Reykjavik_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005490436007323384,
"Nucleotide GTR":0.0005546736374545339,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "T", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAT", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ACA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417577_Reykjavik_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417826_Reykjavik_20200316_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005492757264675247,
"Nucleotide GTR":0.000554908143467737,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "I", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "ATT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417826_Reykjavik_20200316_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417955_Kinshasa_20200321_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005488821782223851,
"Nucleotide GTR":0.0005545105596759329,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAG", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417955_Kinshasa_20200321_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418099_Wales_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTK", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418099_Wales_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418101_Wales_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005492866747559701,
"Nucleotide GTR":0.0005549192040227967,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "TTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418101_Wales_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418116_Wales_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005492278855690275,
"Nucleotide GTR":0.0005548598119961516,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "P", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "CCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418116_Wales_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418217_Mbour_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005492852618254778,
"Nucleotide GTR":0.0005549177766037453,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "I", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "ATA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418217_Mbour_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418333_Ontario_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005491760744993496,
"Nucleotide GTR":0.00055480746964221,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTT", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418333_Ontario_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418342_Ontario_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001098819912812729,
"Nucleotide GTR":0.001110087499670973,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "Q", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "L", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAG", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CTC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418342_Ontario_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418368_Ontario_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000549174694000612,
"Nucleotide GTR":0.0005548060749874771,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "H", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAC", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418368_Ontario_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418421_ARA_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005488829656078531,
"Nucleotide GTR":0.000554511355135457,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "V", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "GTC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418421_ARA_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418503_Hangzhou_20200122_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "AV", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GYT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418503_Hangzhou_20200122_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418697_England_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000120353292003083,
"Nucleotide GTR":0.0001215874261460011,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "H", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CAC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418697_England_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418731_England_20200313_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005492228465012338,
"Nucleotide GTR":0.0005548547212564376,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "Y", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "TAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTT", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418731_England_20200313_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418732_England_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "TI", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "AYA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418732_England_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418830_British_Columbia_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005491561543781168,
"Nucleotide GTR":0.0005547873452548422,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "S", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "TCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTC", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418830_British_Columbia_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418883_Washington_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005492800008227011,
"Nucleotide GTR":0.0005549124616532704,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "I", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ATA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418883_Washington_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418890_Washington_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005490519381193091,
"Nucleotide GTR":0.0005546820603352516,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAT", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418890_Washington_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418939_Washington_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005490948783675585,
"Nucleotide GTR":0.0005547254409040405,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGC", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418939_Washington_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418974_New_York_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005493280163492218,
"Nucleotide GTR":0.0005549609695435616,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "F", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCG", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "TTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418974_New_York_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419249_Hong_Kong_20200225_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005490019354683432,
"Nucleotide GTR":0.0005546315449440211,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "G", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GGG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419249_Hong_Kong_20200225_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419252_Hong_Kong_20200226_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005494511291457717,
"Nucleotide GTR":0.0005550853447709357,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "V", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GTT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419252_Hong_Kong_20200226_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419253_Hong_Kong_20200226_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "V", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "GTT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419253_Hong_Kong_20200226_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419416_Wales_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "IV", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "RTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419416_Wales_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419466_Wales_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATW", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419466_Wales_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419473_Wales_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000549176410491701,
"Nucleotide GTR":0.0005548078090799142,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "M", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "ATG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419473_Wales_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419578_Luxembourg_20200308_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "ED", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAM", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419578_Luxembourg_20200308_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419692_Belarus_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005491629588384994,
"Nucleotide GTR":0.0005547942194899422,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "V", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAC", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "GTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419692_Belarus_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419801_Victoria_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005490153647562467,
"Nucleotide GTR":0.000554645111939357,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "R", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CGA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419801_Victoria_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419820_Victoria_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "I", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ATA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419820_Victoria_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419848_Victoria_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005488578299085731,
"Nucleotide GTR":0.0005544859616881404,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419848_Victoria_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419887_Victoria_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005492866747559701,
"Nucleotide GTR":0.0005549192040227967,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGT", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419887_Victoria_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419923_Victoria_20200320_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005489150896725284,
"Nucleotide GTR":0.0005545438086086961,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTC", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419923_Victoria_20200320_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420006_Victoria_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005491957717929206,
"Nucleotide GTR":0.0005548273689169822,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAT", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420006_Victoria_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420026_Virginia_20200327_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005494385802876813,
"Nucleotide GTR":0.0005550726672335714,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "S", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "L", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "TTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420026_Virginia_20200327_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420090_New_York_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005492866747559701,
"Nucleotide GTR":0.0005549192040227967,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "I", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ATA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420090_New_York_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420103_Singapore_20200305_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "PS", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "YCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420103_Singapore_20200305_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420195_England_20200328_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005493050203015783,
"Nucleotide GTR":0.0005549377376884289,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGG", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420195_England_20200328_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420528_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACY", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420528_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420540_Estonia_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000549036954476535,
"Nucleotide GTR":0.0005546669230462843,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "R", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "I", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AGA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATT", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420540_Estonia_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420542_England_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "KE", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "-", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "RAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "---", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420542_England_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420634_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "AS", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "KCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420634_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420756_England_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005494651677674017,
"Nucleotide GTR":0.0005550995273482644,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "I", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "ATC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420756_England_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420784_Arizona_20200302_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "LF", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "YTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420784_Arizona_20200302_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420789_Illinois_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "AV", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GYT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420789_Illinois_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420916_Wales_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "AS", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "KCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420916_Wales_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420917_Wales_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "CF", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TKC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420917_Wales_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420932_Wales_20200321_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005490161776788851,
"Nucleotide GTR":0.0005546459331979163,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGG", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420932_Wales_20200321_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420980_Wales_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "HR", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CRT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420980_Wales_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421175_Madrid_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005492278855690275,
"Nucleotide GTR":0.0005548598119961516,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAC", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421175_Madrid_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421178_Madrid_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005491764104940832,
"Nucleotide GTR":0.0005548078090823213,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "S", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "AGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421178_Madrid_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421221_Hangzhou_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005492985960841583,
"Nucleotide GTR":0.0005549312475954031,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "S", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "TCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421221_Hangzhou_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421245_Jiangxi_20200125_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005496871133597886,
"Nucleotide GTR":0.0005553237488288213,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "I", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "ATT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421245_Jiangxi_20200125_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421317_Wisconsin_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005492712285922304,
"Nucleotide GTR":0.0005549035994700527,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "L", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TTA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421317_Wisconsin_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421510_Hauts_de_France_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005491706660058256,
"Nucleotide GTR":0.0005548020056885775,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "L", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CTT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421510_Hauts_de_France_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421665_India_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005491698709265187,
"Nucleotide GTR":0.0005548012024563209,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "V", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GTT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421665_India_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421827_England_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCW", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421827_England_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421860_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "LV", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "STC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421860_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421864_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005488829656103432,
"Nucleotide GTR":0.0005545113551379731,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "A", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "GCT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421864_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421866_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "V", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "SL", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GTT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TYA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421866_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421892_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCY", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421892_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421906_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "QP", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CMA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421906_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421915_England_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "IV", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "RTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421915_England_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421931_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "AV", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GYT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421931_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421939_England_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005490504028211417,
"Nucleotide GTR":0.0005546805092937348,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "H", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "YF", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "CAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TWT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421939_England_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421955_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005493678231816174,
"Nucleotide GTR":0.0005550011845656305,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "Y", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "L", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "TAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TTA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421955_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422003_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "IV", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "RTA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422003_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422043_Wales_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTR", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422043_Wales_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422080_Wales_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005492278832259287,
"Nucleotide GTR":0.0005548598096290255,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAC", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422080_Wales_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422114_Wales_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005490418887652776,
"Nucleotide GTR":0.0005546719079325152,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "S", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "TCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422114_Wales_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422119_Wales_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTW", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422119_Wales_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422148_Wales_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005498898193202201,
"Nucleotide GTR":0.000555528533389203,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "V", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "HY", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "T", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GTT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "YAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "ACT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422148_Wales_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422149_Wales_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACR", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422149_Wales_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422177_Wales_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCG", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422177_Wales_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422178_Wales_20200330_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005492158036088612,
"Nucleotide GTR":0.0005548476061444038,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "C", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "TGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422178_Wales_20200330_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422260_Wales_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000549166430578298,
"Nucleotide GTR":0.0005547977268298683,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAC", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422260_Wales_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422265_Wales_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "NS", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "ART", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422265_Wales_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422304_Wales_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "TA", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "RCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422304_Wales_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422312_Wales_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCY", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422312_Wales_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422369_Wales_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005494511482045893,
"Nucleotide GTR":0.0005550853640251872,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCT", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422369_Wales_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422372_Wales_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "HR", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CRT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422372_Wales_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422384_Greater_Accra_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAY", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422384_Greater_Accra_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422465_Wisconsin_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "AV", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GYT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422465_Wisconsin_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422571_Friesland_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0003459383075004674,
"Nucleotide GTR":0.0003494856494096417,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "F", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "TTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422571_Friesland_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422578_Netherlands_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005491260647255709,
"Nucleotide GTR":0.0005547569470551272,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "S", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "TCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422578_Netherlands_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422606_Netherlands_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0.000549111474763993,
"Nucleotide GTR":0.000554742207484267,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "F", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "TTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422606_Netherlands_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422675_Netherlands_20200310_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0005493551489210079,
"Nucleotide GTR":0.0005549883803398375,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "F", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "I", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "TTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ATT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422675_Netherlands_20200310_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422751_Netherlands_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005492881137567688,
"Nucleotide GTR":0.0005549206577794857,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "Y", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "TAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422751_Netherlands_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422884_Noord_Brabant_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005491495814519354,
"Nucleotide GTR":0.0005547807049281565,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "F", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "TTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGT", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422884_Noord_Brabant_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422908_Zuid_Holland_20200317_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0005494394886976676,
"Nucleotide GTR":0.0005550735849586312,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAC", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422908_Zuid_Holland_20200317_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423017_Washington_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005492791790426412,
"Nucleotide GTR":0.0005549116314464621,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423017_Washington_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423061_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "LF", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "YTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423061_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423062_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "VF", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "KTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423062_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423091_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTY", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423091_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423112_England_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTY", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423112_England_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423121_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005488808759453004,
"Nucleotide GTR":0.000554509244044958,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "V", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "GTT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423121_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423145_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "SG", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "RGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423145_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423147_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005489150896391151,
"Nucleotide GTR":0.0005545438085749394,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGC", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423147_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423247_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "VF", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "KTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423247_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423282_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "MV", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "RTG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423282_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423312_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "VL", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "KTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423312_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423339_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005491449057624646,
"Nucleotide GTR":0.000554775981292942,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "I", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "ATA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423339_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423385_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "F", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "TTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "YTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423385_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423399_England_20200329_null_3":{
"Global MG94xREV":0.000549371184251239,
"Nucleotide GTR":0.0005550045801005395,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "Y", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TAT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423399_England_20200329_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423426_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "PL", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CYA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCG", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423426_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423531_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTR", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423531_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423549_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "HY", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "YAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423549_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423569_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005502405198565384,
"Nucleotide GTR":0.00055588283010057,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "I", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "PS", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ATT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "YCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCA", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423569_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423570_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "VF", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "KTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423570_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423593_England_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "TS", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AST", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423593_England_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423598_England_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005492278833614377,
"Nucleotide GTR":0.0005548598097659236,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAC", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423598_England_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423656_England_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "Y", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "TAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGY", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423656_England_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423659_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "ED", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAK", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423659_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423687_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAY", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423687_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423709_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "TP", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "MCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423709_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423743_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGR", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423743_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423758_England_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005492264087827268,
"Nucleotide GTR":0.0005548583200664972,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCC", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423758_England_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423779_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005492276487044796,
"Nucleotide GTR":0.0005548595727027319,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAT", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423779_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423814_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCY", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423814_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423870_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005491979450858179,
"Nucleotide GTR":0.0005548295644953934,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "S", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "M", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "TCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ATG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423870_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423875_England_20200318_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTY", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423875_England_20200318_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423888_England_20200318_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "M", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ATG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423888_England_20200318_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423958_England_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000122581883524457,
"Nucleotide GTR":0.0001238388702278774,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "I", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ATA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423958_England_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423967_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "KE", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "RAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423967_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424026_England_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAY", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424026_England_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424088_England_20200313_null_6":{
"Global MG94xREV":0.0001312000829111602,
"Nucleotide GTR":0.0001325454428857773,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAC", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424088_England_20200313_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424131_England_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "PL", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CYA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424131_England_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424142_England_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "IL", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "MTA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424142_England_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424144_England_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005492390226653588,
"Nucleotide GTR":0.0005548710632951816,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "D", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAC", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424144_England_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424146_England_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "TI", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "AYA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424146_England_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424148_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005492278832259287,
"Nucleotide GTR":0.0005548598096290255,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAC", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424148_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424154_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "RW", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "YGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424154_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424199_Washington_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005489551602194567,
"Nucleotide GTR":0.0005545842900494947,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAG", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424199_Washington_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424213_Washington_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005490531229570882,
"Nucleotide GTR":0.0005546832573226674,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "A", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "GCA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424213_Washington_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424298_Washington_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005491817185121468,
"Nucleotide GTR":0.0005548131715301903,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "S", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "A", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTT", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "TCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "GCT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424298_Washington_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424343_Rome_20200323_null_7":{
"Global MG94xREV":0.0005492113640864997,
"Nucleotide GTR":0.0005548431210980187,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "A", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424343_Rome_20200323_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424375_Reykjavik_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005492158036088612,
"Nucleotide GTR":0.0005548476061444038,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "C", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "TGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424375_Reykjavik_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424408_Reykjavik_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000549227095266033,
"Nucleotide GTR":0.0005548590135891824,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCC", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424408_Reykjavik_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424462_Reykjavik_20200320_null_9":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "T", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ACA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424462_Reykjavik_20200320_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424480_Reykjavik_20200320_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAC", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424480_Reykjavik_20200320_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424548_Reykjavik_20200301_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005490948211299666,
"Nucleotide GTR":0.0005547253830795197,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAC", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAC", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424548_Reykjavik_20200301_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424594_Reykjavik_20200301_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005491017412562294,
"Nucleotide GTR":0.0005547323741665676,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACT", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424594_Reykjavik_20200301_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424606_Reykjavik_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005490711203271028,
"Nucleotide GTR":0.0005547014392424222,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "C", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "TGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424606_Reykjavik_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424661_Li_ge_20200405_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005491017412562294,
"Nucleotide GTR":0.0005547323741665676,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "N", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAT", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424661_Li_ge_20200405_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424848_Arizona_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005489551602194567,
"Nucleotide GTR":0.0005545842900494947,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "R", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AGG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424848_Arizona_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424852_District_of_Columbia_20200306_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "TI", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "AYA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424852_District_of_Columbia_20200306_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424863_Georgia_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "PL", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CYA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424863_Georgia_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424942_New_York_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005492278832259287,
"Nucleotide GTR":0.0005548598096290255,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTC", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424942_New_York_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425134_Duesseldorf_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "S", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "TCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425134_Duesseldorf_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425163_Wisconsin_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005493511343062908,
"Nucleotide GTR":0.00055498432455821,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAT", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAT", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425163_Wisconsin_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425173_Wisconsin_20200330_null_3":{
"Global MG94xREV":0.000549278069028933,
"Nucleotide GTR":0.0005549105100503829,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "I", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "ATT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAT", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACC", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425173_Wisconsin_20200330_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425190_Comunitat_Valenciana_20200316_null_2":{
"Global MG94xREV":0.000549518399951221,
"Nucleotide GTR":0.0005551533053888236,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "P", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "S", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CCC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "TCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425190_Comunitat_Valenciana_20200316_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425255_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005492085110263533,
"Nucleotide GTR":0.0005548402387818471,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACT", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425255_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425505_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005491103006078686,
"Nucleotide GTR":0.0005547410212880378,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "S", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "TCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425505_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425682_Scotland_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000549288136519901,
"Nucleotide GTR":0.0005549206807760378,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCT", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425682_Scotland_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425721_Scotland_20200317_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005492787212409085,
"Nucleotide GTR":0.0005549111689503109,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTT", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAT", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425721_Scotland_20200317_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425821_Scotland_20200311_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTG", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425821_Scotland_20200311_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425915_Scotland_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001650389293973527,
"Nucleotide GTR":0.001667312817567272,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "I", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "Y", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "V", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCG", "ATA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TAT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GTA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425915_Scotland_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426070_Idaho_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005492854871133442,
"Nucleotide GTR":0.0005549180042017729,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "Y", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "V", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "TAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GTT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426070_Idaho_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426082_Washington_20200325_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005490973031088697,
"Nucleotide GTR":0.0005547278905092838,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTT", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426082_Washington_20200325_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426120_Washington_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005494354144122311,
"Nucleotide GTR":0.0005550694688944056,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTT", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426120_Washington_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426299_New_York_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005488829634117282,
"Nucleotide GTR":0.0005545113529168125,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCG", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426299_New_York_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426444_Washington_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005488787793069271,
"Nucleotide GTR":0.0005545071259071063,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "F", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "TTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426444_Washington_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426482_Montevideo_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005489119913548845,
"Nucleotide GTR":0.0005545406785200916,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "TTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426482_Montevideo_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426502_Arizona_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "V", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GTT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426502_Arizona_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426649_Victoria_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005496194021899354,
"Nucleotide GTR":0.0005552553433309177,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "V", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "I", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GTT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATA", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426649_Victoria_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426674_Victoria_20200322_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005492873041611518,
"Nucleotide GTR":0.0005549198398820628,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTT", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426674_Victoria_20200322_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426697_Victoria_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005494902699016664,
"Nucleotide GTR":0.0005551248868863809,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCT", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426697_Victoria_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426712_Victoria_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0002247093683040838,
"Nucleotide GTR":0.0002270135969549338,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "V", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GTT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426712_Victoria_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426742_Victoria_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000123610194797731,
"Nucleotide GTR":0.0001248777260739733,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "V", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GTT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426742_Victoria_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426757_Victoria_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005491843976841777,
"Nucleotide GTR":0.0005548158781751528,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "T", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ACA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426757_Victoria_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426768_Victoria_20200323_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005492866775508005,
"Nucleotide GTR":0.0005549192068462855,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAT", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426768_Victoria_20200323_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426780_Victoria_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "GC", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "KGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426780_Victoria_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426784_Victoria_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005492257222840986,
"Nucleotide GTR":0.0005548576265283324,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACC", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426784_Victoria_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426788_Victoria_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "GV", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "L", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GKT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "TTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426788_Victoria_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426827_Victoria_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "GV", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "D", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GKT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAT", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426827_Victoria_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426869_Victoria_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005491827464327931,
"Nucleotide GTR":0.0005548142099914045,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "S", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "TCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426869_Victoria_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426952_Victoria_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "N", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "AAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426952_Victoria_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427004_Victoria_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005491186182621403,
"Nucleotide GTR":0.0005547494242337129,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "L", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "TTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427004_Victoria_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427061_Victoria_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0001225659086268219,
"Nucleotide GTR":0.0001238227315194626,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCT", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427061_Victoria_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427082_Victoria_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000549000628732334,
"Nucleotide GTR":0.0005546302248083991,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "S", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "L", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "TCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "TTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427082_Victoria_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427123_Victoria_20200405_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0005488829656078531,
"Nucleotide GTR":0.000554511355135457,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "G", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "GGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427123_Victoria_20200405_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427156_Victoria_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005492278832259287,
"Nucleotide GTR":0.0005548598096290255,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGC", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427156_Victoria_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427161_Connecticut_20200325_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005493357290545342,
"Nucleotide GTR":0.0005549687613369716,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "L", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TTA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427161_Connecticut_20200325_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427172_Idaho_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0001310585497172207,
"Nucleotide GTR":0.0001324024583734392,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCG", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427172_Idaho_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427204_Washington_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005491166318300334,
"Nucleotide GTR":0.0005547474174322109,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "L", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "TTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427204_Washington_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427209_Washington_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005494722500636508,
"Nucleotide GTR":0.000555106682268232,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAA", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427209_Washington_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427246_Washington_20200331_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGT", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427246_Washington_20200331_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427291_Ohio_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00567193296881004,
"Nucleotide GTR":0.005730094453358152,
"amino-acid": [
["-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "Y", "T", "P", "H", "T", "V", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TAC", "ACA", "CCG", "CAT", "ACA", "GTC", "TTA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTT", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1.5, 1, 1, 0, 2.166666666666667, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427291_Ohio_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0.5, 1, 0, 1, 0.8333333333333334, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427417_Doha_20200323_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "ND", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "RAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427417_Doha_20200323_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427601_New_York_20200316_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "D", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAT", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427601_New_York_20200316_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427641_New_York_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005493514312951052,
"Nucleotide GTR":0.0005549846245924251,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTA", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427641_New_York_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427690_New_South_Wales_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005488829657480193,
"Nucleotide GTR":0.0005545113552770609,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCG", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427690_New_South_Wales_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427724_New_South_Wales_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005490770573211489,
"Nucleotide GTR":0.000554707437115959,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAA", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427724_New_South_Wales_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427730_New_South_Wales_20200317_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005494511291457717,
"Nucleotide GTR":0.0005550853447709357,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "V", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GTC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427730_New_South_Wales_20200317_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428271_Wisconsin_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "I", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATT", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428271_Wisconsin_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428301_Wisconsin_20200325_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005488821782223851,
"Nucleotide GTR":0.0005545105596759329,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "A", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "GCT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428301_Wisconsin_20200325_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428347_Ile_De_France_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005491102805490609,
"Nucleotide GTR":0.0005547410010235415,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTT", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428347_Ile_De_France_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428405_Connecticut_20200411_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005492264087827268,
"Nucleotide GTR":0.0005548583200664972,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACC", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428405_Connecticut_20200411_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428456_Guangdong_20200122_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005491102805490609,
"Nucleotide GTR":0.0005547410010235415,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "S", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "TCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428456_Guangdong_20200122_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428461_Guangdong_20200124_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0005488829633782116,
"Nucleotide GTR":0.0005545113528829521,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "C", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TGT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428461_Guangdong_20200124_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428706_Madrid_20200321_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005491614296204689,
"Nucleotide GTR":0.0005547926745909097,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "C", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "TGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428706_Madrid_20200321_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428771_New_York_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005493854210767777,
"Nucleotide GTR":0.0005550189629142116,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTA", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428771_New_York_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428836_Singapore_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAR", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428836_Singapore_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428879_Sverdlovsk_Region_20200319_null_3":{
"Global MG94xREV":0.000549216409663443,
"Nucleotide GTR":0.0005548482184136282,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "I", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATT", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428879_Sverdlovsk_Region_20200319_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428923_Sverdlovsk_Region_20200327_null_3":{
"Global MG94xREV":0.000549288136488566,
"Nucleotide GTR":0.0005549206807443812,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "V", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GTC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428923_Sverdlovsk_Region_20200327_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429001_California_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005495555553342069,
"Nucleotide GTR":0.0005551908417728273,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "E", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAT", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAA", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429001_California_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429041_California_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005490284909614873,
"Nucleotide GTR":0.0005546583727441393,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "F", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "TTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429041_California_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429061_California_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005490443427704266,
"Nucleotide GTR":0.0005546743871016747,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "TTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429061_California_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429103_Guangzhou_20200209_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005488814794815784,
"Nucleotide GTR":0.0005545098537700549,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "G", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GGT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429103_Guangzhou_20200209_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429177_Bangkok_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "QL", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CWG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429177_Bangkok_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429206_Switzerland_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005492257222840986,
"Nucleotide GTR":0.0005548576265283324,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGC", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429206_Switzerland_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429233_Abruzzo_20200324_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATM", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429233_Abruzzo_20200324_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429328_Unknown_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005488821782223851,
"Nucleotide GTR":0.0005545105596759329,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "A", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "GCT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429328_Unknown_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429370_Unknown_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005492742727698205,
"Nucleotide GTR":0.0005549066748634358,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "I", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "ATA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429370_Unknown_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429636_Washington_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001099834126138808,
"Nucleotide GTR":0.001111112113005835,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "T", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "V", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "ACA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "GTG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429636_Washington_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429643_USA_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005492764730194908,
"Nucleotide GTR":0.0005549088976750424,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "V", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAT", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GTT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429643_USA_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429674_Minas_gerais_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000549688038135303,
"Nucleotide GTR":0.0005553246830872258,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "D", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GAC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429674_Minas_gerais_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429702_Minas_gerais_20200322_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0005493145717785428,
"Nucleotide GTR":0.000554947387108737,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAT", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429702_Minas_gerais_20200322_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429774_Luxembourg_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000549227095266033,
"Nucleotide GTR":0.0005548590135891824,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGC", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429774_Luxembourg_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430129_Washington_20200306_null_4":{
"Global MG94xREV":0.000549092121590038,
"Nucleotide GTR":0.0005547226558578025,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAT", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430129_Washington_20200306_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430137_Washington_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005489604581662681,
"Nucleotide GTR":0.0005545896423228392,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "N", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "AAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430137_Washington_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430152_Washington_20200305_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005490504929915777,
"Nucleotide GTR":0.000554680600388803,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "S", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "TCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430152_Washington_20200305_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430200_Washington_20200304_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005491913586292792,
"Nucleotide GTR":0.0005548229104996058,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCT", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430200_Washington_20200304_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430290_Washington_20200302_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005493572037118301,
"Nucleotide GTR":0.0005549904562010224,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACC", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430290_Washington_20200302_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430330_New_York_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005488821782223851,
"Nucleotide GTR":0.0005545105596759329,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "V", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "GTA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430330_New_York_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430340_New_York_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005492757264675247,
"Nucleotide GTR":0.000554908143467737,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "T", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "ACA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430340_New_York_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430357_New_York_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005492676173157898,
"Nucleotide GTR":0.0005548999511626386,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "S", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "L", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "TCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TTA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430357_New_York_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430379_New_York_20200407_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005492873043879282,
"Nucleotide GTR":0.0005549198401111658,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAT", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430379_New_York_20200407_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430401_Connecticut_20200410_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "I", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "ATT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430401_Connecticut_20200410_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430423_New_York_20200411_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0001225659083749743,
"Nucleotide GTR":0.0001238227312650325,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTT", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430423_New_York_20200411_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430443_Malaysia_20200128_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005492497504823769,
"Nucleotide GTR":0.0005548819011180426,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACC", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430443_Malaysia_20200128_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430467_West_Bengal_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005491761904928207,
"Nucleotide GTR":0.0005548075868251082,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "A", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GCA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430467_West_Bengal_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430475_Victoria_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAR", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430475_Victoria_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430477_Victoria_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGY", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430477_Victoria_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430478_Victoria_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "TI", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "AYA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430478_Victoria_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430479_Victoria_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "N", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "YTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "AAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430479_Victoria_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430492_Victoria_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "VF", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "KTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430492_Victoria_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430493_Victoria_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTY", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430493_Victoria_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430577_Victoria_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "IV", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "RTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430577_Victoria_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430588_Victoria_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001098545530774312,
"Nucleotide GTR":0.001109810304047351,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "L", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "S", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TTA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "TCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430588_Victoria_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430592_Victoria_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "LF", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTK", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430592_Victoria_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430601_Victoria_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005493050203015783,
"Nucleotide GTR":0.0005549377376884289,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "L", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CTT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430601_Victoria_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430606_Victoria_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "SL", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TYA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430606_Victoria_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430610_Victoria_20200408_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005494394863704211,
"Nucleotide GTR":0.0005550735826075209,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "H", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "CAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430610_Victoria_20200408_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430613_Victoria_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "PA", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "SCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430613_Victoria_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430665_Victoria_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "IF", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "WTT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430665_Victoria_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430671_Victoria_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "YC", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TRT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430671_Victoria_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430675_Victoria_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "YAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430675_Victoria_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430685_Victoria_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAY", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430685_Victoria_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430705_Victoria_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTY", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430705_Victoria_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430712_Victoria_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "LF", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "YTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430712_Victoria_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430793_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005493305107242218,
"Nucleotide GTR":0.0005549634894965353,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "F", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TTT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430793_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430805_Buenos_Aires_20200401_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005493305107242218,
"Nucleotide GTR":0.0005549634894965353,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAT", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430805_Buenos_Aires_20200401_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430815_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200418_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "HY", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "YAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430815_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200418_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430942_Idaho_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "Y", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "TAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430942_Idaho_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_431092_Connecticut_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005491103006078686,
"Nucleotide GTR":0.0005547410212880378,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "F", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTT", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_431092_Connecticut_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_431916_Wales_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTW", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_431916_Wales_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_431950_Wales_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "V", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GTT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGY", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_431950_Wales_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_431951_Wales_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "TM", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "AYG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_431951_Wales_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_431962_Wales_20200331_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0001148026582993524,
"Nucleotide GTR":0.0001159798747921207,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "L", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "TTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_431962_Wales_20200331_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_431970_Wales_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTR", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_431970_Wales_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_431974_Wales_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005494496750536015,
"Nucleotide GTR":0.0005550838757681237,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "Y", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "TAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_431974_Wales_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432000_Wales_20200330_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00013105857225593,
"Nucleotide GTR":0.0001324024811432664,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACG", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432000_Wales_20200330_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432013_Wales_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "PS", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "YCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432013_Wales_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432016_Wales_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005491506770216541,
"Nucleotide GTR":0.0005547818117321335,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "V", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GTT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTT", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432016_Wales_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432022_Wales_20200331_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005491643412081064,
"Nucleotide GTR":0.0005547956160347284,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432022_Wales_20200331_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432054_Wales_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005494395096962989,
"Nucleotide GTR":0.0005550736061725879,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "A", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432054_Wales_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432115_Wales_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTK", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432115_Wales_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432198_Wales_20200330_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "L", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TTA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432198_Wales_20200330_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432416_Wales_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0001048487614199983,
"Nucleotide GTR":0.0001059239080500365,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTA", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432416_Wales_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432448_Wales_20200401_null_7":{
"Global MG94xREV":0.0005494326760651745,
"Nucleotide GTR":0.0005550667024676222,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTC", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432448_Wales_20200401_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432548_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005490986110440669,
"Nucleotide GTR":0.0005547292118563912,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACG", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432548_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432899_Scotland_20200406_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTT", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432899_Scotland_20200406_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432999_England_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005493467437153807,
"Nucleotide GTR":0.0005549798889450324,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "V", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GTT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATC", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432999_England_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433191_Scotland_20200419_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005493053128010915,
"Nucleotide GTR":0.0005549380331873093,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "L", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "TTA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433191_Scotland_20200419_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433202_Scotland_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005490161564058239,
"Nucleotide GTR":0.0005546459117067158,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "A", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "GCT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433202_Scotland_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433232_Scotland_20200402_null_6":{
"Global MG94xREV":0.0005493054146453156,
"Nucleotide GTR":0.0005549381360758705,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "I", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ATT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433232_Scotland_20200402_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433275_Scotland_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005497728737099623,
"Nucleotide GTR":0.0005554103885880619,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTA", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433275_Scotland_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433279_Scotland_20200320_null_8":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "V", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "GTG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433279_Scotland_20200320_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433336_Scotland_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGW", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433336_Scotland_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433348_Scotland_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "H", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAT", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433348_Scotland_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433567_Scotland_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005493054145098896,
"Nucleotide GTR":0.000554938135939056,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "I", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ATT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433567_Scotland_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433580_Scotland_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001098989516234233,
"Nucleotide GTR":0.001110258842250333,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "S", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "A", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "TCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GCC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433580_Scotland_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433687_England_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005491102805490609,
"Nucleotide GTR":0.0005547410010235415,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "L", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "TTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433687_England_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433696_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005491590140399457,
"Nucleotide GTR":0.0005547902342403916,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "V", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "GTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433696_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433771_England_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0001148026249447755,
"Nucleotide GTR":0.0001159798410955172,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "F", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "TTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433771_England_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433866_England_20200408_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGC", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433866_England_20200408_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433904_England_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005492764922159105,
"Nucleotide GTR":0.0005549089170683077,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "V", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "M", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GTT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ATG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433904_England_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433908_England_20200411_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005496741497939694,
"Nucleotide GTR":0.0005553106523312062,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "V", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "V", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "M", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GTT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GTT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ATG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433908_England_20200411_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433922_England_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005492155699906806,
"Nucleotide GTR":0.0005548473701306412,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "V", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GTT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGT", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433922_England_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433981_England_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00054904368245531,
"Nucleotide GTR":0.0005546737200155145,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "I", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATT", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433981_England_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434007_England_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005491426710958573,
"Nucleotide GTR":0.0005547737237114787,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACG", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434007_England_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434084_Washington_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000548922057490412,
"Nucleotide GTR":0.0005545508478764069,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "R", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "F", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CGT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "TTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434084_Washington_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434085_Washington_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005490451693310021,
"Nucleotide GTR":0.0005546752221380184,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGT", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434085_Washington_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434119_Washington_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005490451693335119,
"Nucleotide GTR":0.0005546752221405543,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "S", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "TCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434119_Washington_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434170_Washington_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005489900329694272,
"Nucleotide GTR":0.0005546195203937676,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTC", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434170_Washington_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434181_Washington_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001098830614866471,
"Nucleotide GTR":0.001110098311466375,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "F", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "I", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "TTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "ATA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434181_Washington_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434299_Washington_20200323_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "S", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "TCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTC", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434299_Washington_20200323_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434322_Washington_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005491706683939803,
"Nucleotide GTR":0.0005548020081012217,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGT", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434322_Washington_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434544_Puerto_Rico_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005491102805490609,
"Nucleotide GTR":0.0005547410010235415,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "N", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAT", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434544_Puerto_Rico_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434547_Puerto_Rico_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005490642701486567,
"Nucleotide GTR":0.0005546945188204546,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTT", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434547_Puerto_Rico_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434556_Manila_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001101006728971758,
"Nucleotide GTR":0.001112296740015011,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "Q", "A", "A", "D", "D", "A", "L", "C", "D", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAA", "GCC", "GCT", "GAT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAT", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434556_Manila_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434591_Virginia_20200410_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005492164004982748,
"Nucleotide GTR":0.0005548482091544782,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAG", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434591_Virginia_20200410_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434657_Skane_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005491434333517676,
"Nucleotide GTR":0.0005547744937837609,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTG", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434657_Skane_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434683_Maryland_20200314_null_8":{
"Global MG94xREV":0.0001225659081714122,
"Nucleotide GTR":0.0001238227310593828,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "I", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ATT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434683_Maryland_20200314_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434711_Kinshasa_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005494341780988716,
"Nucleotide GTR":0.0005550682199035664,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAC", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434711_Kinshasa_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434772_Texas_20200318_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACT", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434772_Texas_20200318_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434878_Texas_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005491103007360891,
"Nucleotide GTR":0.0005547410214175729,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "L", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CTT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434878_Texas_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434946_Texas_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005491102805490609,
"Nucleotide GTR":0.0005547410010235415,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "I", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "ATA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434946_Texas_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435017_Texas_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005491185195668831,
"Nucleotide GTR":0.0005547493245264085,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGG", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435017_Texas_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435025_Texas_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005494081377078316,
"Nucleotide GTR":0.0005550419124875432,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAC", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435025_Texas_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435038_Louisiana_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005491185429612541,
"Nucleotide GTR":0.0005547493481606716,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "G", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GGT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435038_Louisiana_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435040_Louisiana_20200415_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005491177441713841,
"Nucleotide GTR":0.0005547485411798007,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "G", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "GGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435040_Louisiana_20200415_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435045_Nur_Sultan_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001099584668214139,
"Nucleotide GTR":0.001110860097074345,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "D", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACG", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GAT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435045_Nur_Sultan_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435059_EC_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001099784013154489,
"Nucleotide GTR":0.001111061486149866,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "V", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "N", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GTT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "AAT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435059_EC_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435082_Uttar_Pradesh_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCY", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435082_Uttar_Pradesh_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435108_Delhi_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "V", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGR", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "GTG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435108_Delhi_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435121_United_Arab_Emirates_20200225_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005494333564379523,
"Nucleotide GTR":0.0005550673898171209,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTC", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435121_United_Arab_Emirates_20200225_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435147_Abruzzo_20200408_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005495535453779488,
"Nucleotide GTR":0.0005551888112059516,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "D", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAT", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAT", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435147_Abruzzo_20200408_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435151_Abruzzo_20200408_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005495061402313075,
"Nucleotide GTR":0.0005551409199545346,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "K", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AAG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435151_Abruzzo_20200408_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435287_Israel_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "AG", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GSC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435287_Israel_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435416_Baranya_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00054922923261355,
"Nucleotide GTR":0.0005548611728536208,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACT", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "TTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435416_Baranya_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435467_Louisiana_20200331_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005492945409594017,
"Nucleotide GTR":0.0005549271508883362,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "K", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435467_Louisiana_20200331_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435474_California_20200429_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005494074419813766,
"Nucleotide GTR":0.0005550412096269274,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCC", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435474_California_20200429_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435482_New_York_20200330_null_2":{
"Global MG94xREV":0.000549303938115003,
"Nucleotide GTR":0.0005549366444048299,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTT", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435482_New_York_20200330_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435522_New_York_20200420_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005490161564058239,
"Nucleotide GTR":0.0005546459117067158,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAG", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435522_New_York_20200420_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435542_New_York_20200422_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001098980557073342,
"Nucleotide GTR":0.001110249791219863,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "T", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "G", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "ACT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "GGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435542_New_York_20200422_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435620_California_20200309_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005494089252437343,
"Nucleotide GTR":0.0005550427080990459,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "P", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "CCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435620_California_20200309_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435631_California_20200311_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCG", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435631_California_20200311_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435640_California_20200312_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCG", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435640_California_20200312_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435680_Singapore_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACY", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435680_Singapore_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435697_Singapore_20200318_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "D", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAT", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435697_Singapore_20200318_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436141_Karnataka_20200424_null_4":{
"Global MG94xREV":0.000549343054527838,
"Nucleotide GTR":0.0005549761619275953,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "T", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "ACA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436141_Karnataka_20200424_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436234_Comunitat_Valenciana_20200318_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "V", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GTT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436234_Comunitat_Valenciana_20200318_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436247_Comunitat_Valenciana_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005491177441713841,
"Nucleotide GTR":0.0005547485411798007,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTG", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436247_Comunitat_Valenciana_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436260_Comunitat_Valenciana_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "I", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ATA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436260_Comunitat_Valenciana_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436278_Comunitat_Valenciana_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "VF", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "KTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436278_Comunitat_Valenciana_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436304_Comunitat_Valenciana_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005491185195668831,
"Nucleotide GTR":0.0005547493245264085,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "A", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "GCA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436304_Comunitat_Valenciana_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436340_Comunitat_Valenciana_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "GV", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GKT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436340_Comunitat_Valenciana_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436346_Comunitat_Valenciana_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAY", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436346_Comunitat_Valenciana_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436389_Comunitat_Valenciana_20200317_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005491884287569232,
"Nucleotide GTR":0.0005548199505835722,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "Y", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "C", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "TAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "TGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436389_Comunitat_Valenciana_20200317_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436432_Delhi_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "TA", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "RCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436432_Delhi_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436435_Delhi_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTY", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436435_Delhi_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436436_Delhi_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "QH", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAK", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436436_Delhi_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436437_Delhi_20200408_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "QR", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CRA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436437_Delhi_20200408_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436445_Delhi_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "KAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436445_Delhi_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436449_Bihar_20200412_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005491434333517676,
"Nucleotide GTR":0.0005547744937837609,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "R", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AGA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436449_Bihar_20200412_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436450_Delhi_20200413_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0005491934092070912,
"Nucleotide GTR":0.0005548249821045789,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCT", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436450_Delhi_20200413_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436451_Delhi_20200413_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGR", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436451_Delhi_20200413_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436454_Delhi_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005494089253851628,
"Nucleotide GTR":0.0005550427082419239,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCC", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436454_Delhi_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436463_Madhya_Pradesh_20200416_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "GC", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "KGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436463_Madhya_Pradesh_20200416_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436553_Florida_20200417_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTT", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436553_Florida_20200417_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436648_California_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "LF", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "YTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436648_California_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436684_KZN_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005494089253826532,
"Nucleotide GTR":0.000555042708239389,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGC", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436684_KZN_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436689_Victoria_20200323_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "GV", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GKT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436689_Victoria_20200323_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436717_Moscow_20200414_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0001225658799184786,
"Nucleotide GTR":0.0001238227025167365,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAT", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436717_Moscow_20200414_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436719_Abruzzo_20200320_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTK", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436719_Abruzzo_20200320_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436887_Michigan_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACR", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436887_Michigan_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436961_LA_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005493054146453156,
"Nucleotide GTR":0.0005549381360758705,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "L", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TTA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436961_LA_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437056_California_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0001238845244995603,
"Nucleotide GTR":0.0001251548688243352,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "V", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GTT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437056_California_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437066_California_20200416_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGY", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437066_California_20200416_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437101_Michigan_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005494081377078316,
"Nucleotide GTR":0.0005550419124875432,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCC", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437101_Michigan_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437120_Michigan_20200318_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "PL", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CYT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437120_Michigan_20200318_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437123_Michigan_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005493467437153807,
"Nucleotide GTR":0.0005549798889450324,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "H", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTT", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "CAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437123_Michigan_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437128_Michigan_20200319_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005493054146453156,
"Nucleotide GTR":0.0005549381360758705,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "S", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "TCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437128_Michigan_20200319_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437151_Michigan_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005493045818956443,
"Nucleotide GTR":0.0005549372947869662,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGT", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437151_Michigan_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437155_Michigan_20200322_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "PL", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATT", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CYT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437155_Michigan_20200322_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437221_Bavaria_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0001225658920302484,
"Nucleotide GTR":0.0001238227147527035,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "S", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "TCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437221_Bavaria_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437359_Bavaria_20200314_null_7":{
"Global MG94xREV":0.0005491103007360891,
"Nucleotide GTR":0.0005547410214175729,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "S", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "TCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437359_Bavaria_20200314_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437374_Minnesota_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005494722500636508,
"Nucleotide GTR":0.000555106682268232,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACA", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437374_Minnesota_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437451_Gujarat_20200426_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005499850870915844,
"Nucleotide GTR":0.0005556247780612189,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAT", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACA", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437451_Gujarat_20200426_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437467_Makkah_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001098830614866471,
"Nucleotide GTR":0.001110098311466375,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "L", "M", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CTT", "ATG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437467_Makkah_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437547_Louisiana_20200331_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005491660246368269,
"Nucleotide GTR":0.0005547973167257672,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "S", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "TCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437547_Louisiana_20200331_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437563_California_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTC", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437563_California_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437566_California_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005494223940701513,
"Nucleotide GTR":0.0005550563150383327,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "V", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "F", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GTT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "TTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437566_California_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437574_California_20200407_null_7":{
"Global MG94xREV":0.0005494089253851628,
"Nucleotide GTR":0.0005550427082419239,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "H", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "CAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437574_California_20200407_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437641_Unknown_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000549119151781904,
"Nucleotide GTR":0.0005547499632243273,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCC", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437641_Unknown_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437715_Madinah_20200414_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "I", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ATT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437715_Madinah_20200414_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437805_Washington_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005494571905551813,
"Nucleotide GTR":0.0005550914683356236,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "S", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "TCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTT", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTC", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437805_Washington_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437812_Washington_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005490642701486567,
"Nucleotide GTR":0.0005546945188204546,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "F", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "TTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437812_Washington_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437861_Washington_20200404_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "S", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "A", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "TCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "GCT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437861_Washington_20200404_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437909_Athens_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005488745065933543,
"Nucleotide GTR":0.0005545028093800105,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "M", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATG", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437909_Athens_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437912_Dhaka_20200418_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005491102805490609,
"Nucleotide GTR":0.0005547410010235415,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "D", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAT", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437912_Dhaka_20200418_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437971_Innsbruck_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAY", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437971_Innsbruck_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438092_Vienna_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "RG", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "SGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438092_Vienna_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438110_Vienna_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGY", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438110_Vienna_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438141_Washington_20200402_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0005491622895805342,
"Nucleotide GTR":0.0005547935433692304,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTT", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438141_Washington_20200402_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438175_Washington_20200429_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001098715793476813,
"Nucleotide GTR":0.001109982312668149,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "S", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "TCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACC", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438175_Washington_20200429_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438204_Washington_20200420_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005493054145074337,
"Nucleotide GTR":0.0005549381359365748,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGT", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438204_Washington_20200420_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438211_Washington_20200421_null_10":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "F", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "TTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438211_Washington_20200421_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438217_Washington_20200422_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATT", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438217_Washington_20200422_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438219_Washington_20200422_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005489800147715897,
"Nucleotide GTR":0.0005546093994667088,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCG", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438219_Washington_20200422_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438220_Washington_20200421_null_8":{
"Global MG94xREV":0.0005492937496339359,
"Nucleotide GTR":0.0005549263514484124,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "I", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "ATA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438220_Washington_20200421_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438221_Washington_20200422_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005489800148039155,
"Nucleotide GTR":0.0005546093994993663,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCG", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438221_Washington_20200422_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438230_District_of_Columbia_20200311_null_13":{
"Global MG94xREV":0.0005493514312951052,
"Nucleotide GTR":0.0005549846245924251,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATA", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438230_District_of_Columbia_20200311_null_13",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438241_Maryland_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005492278855690275,
"Nucleotide GTR":0.0005548598119961516,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "T", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ACA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438241_Maryland_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438355_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCR", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438355_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438381_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "NS", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "ART", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438381_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438417_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005494089466324734,
"Nucleotide GTR":0.0005550427297071103,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTC", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438417_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438463_England_20200328_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0001310585724579902,
"Nucleotide GTR":0.0001324024813473987,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "V", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "GTG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438463_England_20200328_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438495_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGY", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438495_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438526_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "SL", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TYA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438526_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438534_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005491807877609755,
"Nucleotide GTR":0.0005548122312348535,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCC", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTT", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438534_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438599_England_20200422_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005491635269036612,
"Nucleotide GTR":0.0005547947933801927,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATT", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438599_England_20200422_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438608_England_20200420_null_9":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "V", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GTA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438608_England_20200420_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438610_England_20200421_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "V", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GTT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438610_England_20200421_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438620_England_20200421_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005493046282651087,
"Nucleotide GTR":0.0005549373416319148,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAT", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438620_England_20200421_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438648_England_20200423_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0005490970137130134,
"Nucleotide GTR":0.0005547275981458872,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "F", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "TTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGC", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438648_England_20200423_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438691_England_20200424_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000549176410491701,
"Nucleotide GTR":0.0005548078090799142,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "M", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "ATG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438691_England_20200424_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438715_England_20200425_null_7":{
"Global MG94xREV":0.0005491017412562294,
"Nucleotide GTR":0.0005547323741665676,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "S", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "TCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438715_England_20200425_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438732_England_20200426_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005489764078045561,
"Nucleotide GTR":0.0005546057555128916,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "S", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "S", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "TCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AGT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAG", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438732_England_20200426_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438788_Scotland_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "GV", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GKT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438788_Scotland_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438793_Scotland_20200331_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTY", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438793_Scotland_20200331_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438796_Scotland_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005494586525278804,
"Nucleotide GTR":0.0005550929452997726,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "E", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTT", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "GAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438796_Scotland_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438825_Scotland_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005491520415372105,
"Nucleotide GTR":0.0005547831902397894,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "L", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CTA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438825_Scotland_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438842_Scotland_20200404_null_9":{
"Global MG94xREV":0.000549178385232835,
"Nucleotide GTR":0.0005548098040705603,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCA", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438842_Scotland_20200404_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438905_Scotland_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005492381917613264,
"Nucleotide GTR":0.0005548702238708421,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAT", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACT", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438905_Scotland_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438909_Scotland_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005492070563130152,
"Nucleotide GTR":0.000554838769151498,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "V", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "V", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GTT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GTA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438909_Scotland_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438961_Kanto_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005491419473376836,
"Nucleotide GTR":0.0005547729925316994,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "D", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "GAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438961_Kanto_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438998_Scotland_20200422_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005493097639050838,
"Nucleotide GTR":0.0005549425299340854,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "L", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CTT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "TTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438998_Scotland_20200422_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439001_Scotland_20200422_null_15":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "Y", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "TAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439001_Scotland_20200422_null_15",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439007_Scotland_20200424_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005494333566907969,
"Nucleotide GTR":0.0005550673900725581,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "P", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "CCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439007_Scotland_20200424_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439019_Scotland_20200423_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005491103007360891,
"Nucleotide GTR":0.0005547410214175729,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "I", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "ATT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439019_Scotland_20200423_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439037_Scotland_20200424_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "A", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "GCA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439037_Scotland_20200424_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439042_Scotland_20200425_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "M", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATG", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439042_Scotland_20200425_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439100_Scotland_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005491434333517676,
"Nucleotide GTR":0.0005547744937837609,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "E", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "GAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439100_Scotland_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439102_Scotland_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000549432685310787,
"Nucleotide GTR":0.0005550667118080419,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "A", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GCA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439102_Scotland_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439142_Scotland_20200329_null_9":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "L", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "TTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439142_Scotland_20200329_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439146_Scotland_20200407_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001099625188396615,
"Nucleotide GTR":0.001110901032761373,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "V", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "F", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "I", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GTT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "TTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ATA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439146_Scotland_20200407_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439152_Scotland_20200419_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005490451391099616,
"Nucleotide GTR":0.0005546751916070844,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "D", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAT", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "CTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439152_Scotland_20200419_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439185_Scotland_20200422_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005494764419443095,
"Nucleotide GTR":0.0005551109171335319,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "S", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439185_Scotland_20200422_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439209_Scotland_20200422_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005491614296204689,
"Nucleotide GTR":0.0005547926745909097,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGC", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439209_Scotland_20200422_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439235_Scotland_20200424_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005493305107266698,
"Nucleotide GTR":0.0005549634894990087,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "I", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ATA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439235_Scotland_20200424_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439327_Scotland_20200430_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005493045812689763,
"Nucleotide GTR":0.0005549372941538713,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "I", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ATT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439327_Scotland_20200430_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439380_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "HR", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CRC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439380_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439441_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "V", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGR", "AAT", "GTG", "GTA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439441_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439462_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "YC", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TRT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439462_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439466_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005492158036088612,
"Nucleotide GTR":0.0005548476061444038,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "Y", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "TAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439466_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439490_England_20200331_null_8":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "PL", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CYA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439490_England_20200331_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439510_England_20200331_null_8":{
"Global MG94xREV":0.0005491765733982098,
"Nucleotide GTR":0.0005548079736569092,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "L", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CTG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439510_England_20200331_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439548_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGY", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439548_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439562_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005494476531734034,
"Nucleotide GTR":0.0005550818331550378,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAA", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439562_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439580_England_20200323_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005493045812689763,
"Nucleotide GTR":0.0005549372941538713,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "V", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GTA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439580_England_20200323_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439600_England_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005494341780988716,
"Nucleotide GTR":0.0005550682199035664,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTC", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439600_England_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439652_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "TI", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "AYT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439652_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439669_Scotland_20200430_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005491434099985507,
"Nucleotide GTR":0.0005547744701910734,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTG", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439669_Scotland_20200430_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439685_England_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005496866030338302,
"Nucleotide GTR":0.0005553232332698467,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTA", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439685_England_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439728_England_20200408_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "L", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TTA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439728_England_20200408_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439729_England_20200408_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005490908621346096,
"Nucleotide GTR":0.0005547213834875881,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "V", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GTT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439729_England_20200408_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439738_England_20200408_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005493219748210231,
"Nucleotide GTR":0.0005549548660639516,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "V", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GTT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439738_England_20200408_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439831_England_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005489995471804611,
"Nucleotide GTR":0.0005546291321660105,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "S", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AGT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTC", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439831_England_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439856_England_20200417_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCG", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439856_England_20200417_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439889_England_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005494341780988716,
"Nucleotide GTR":0.0005550682199035664,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTC", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439889_England_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439896_England_20200329_null_8":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAT", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439896_England_20200329_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439912_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "AV", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GYT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439912_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439945_England_20200323_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005491102805490609,
"Nucleotide GTR":0.0005547410010235415,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "F", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTT", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439945_England_20200323_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440003_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005493405777646927,
"Nucleotide GTR":0.0005549736597670727,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "I", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ATA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAT", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440003_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440056_England_20200321_null_6":{
"Global MG94xREV":0.00013105857225593,
"Nucleotide GTR":0.0001324024811432664,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "G", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "GGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440056_England_20200321_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440084_England_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "TI", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "AYT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440084_England_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440085_England_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "YTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440085_England_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440152_England_20200321_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "L", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CTT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440152_England_20200321_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440178_England_20200309_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAY", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440178_England_20200309_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440216_England_20200311_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "V", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "GTA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440216_England_20200311_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440278_England_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTY", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440278_England_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440309_England_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACR", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440309_England_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440354_England_20200319_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0001228230442241173,
"Nucleotide GTR":0.0001240825038524441,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "I", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATT", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440354_England_20200319_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440366_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTK", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440366_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440382_England_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "GV", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GKT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAT", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440382_England_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440390_England_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "AV", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GYT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440390_England_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440504_England_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005494341780988716,
"Nucleotide GTR":0.0005550682199035664,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "A", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GCT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440504_England_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440511_England_20200312_null_15":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTT", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440511_England_20200312_null_15",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440515_England_20200311_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "F", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "TTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440515_England_20200311_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440612_England_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005491434333517676,
"Nucleotide GTR":0.0005547744937837609,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCG", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440612_England_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440617_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005493305315157852,
"Nucleotide GTR":0.0005549635105013002,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAT", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440617_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440680_England_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005490153647562467,
"Nucleotide GTR":0.000554645111939357,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGG", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440680_England_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440722_England_20200405_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "PS", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "YCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440722_England_20200405_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440740_England_20200405_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "PL", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CYT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440740_England_20200405_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440816_England_20200403_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440816_England_20200403_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440824_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005494099089679847,
"Nucleotide GTR":0.0005550437019106624,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "L", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "SG", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "L", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TTA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "RGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "TTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440824_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440860_England_20200416_null_14":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "L", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "TTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440860_England_20200416_null_14",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440875_England_20200423_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "I", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ATT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440875_England_20200423_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440891_England_20200421_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005491426235331997,
"Nucleotide GTR":0.0005547736756611014,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "C", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TGT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440891_England_20200421_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440916_England_20200420_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005493305107242218,
"Nucleotide GTR":0.0005549634894965353,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "I", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ATA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440916_England_20200420_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440930_England_20200424_null_24":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "I", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ATT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440930_England_20200424_null_24",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441021_England_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005491434333517676,
"Nucleotide GTR":0.0005547744937837609,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "R", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AGA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441021_England_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441060_England_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "RC", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "YGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTC", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441060_England_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441068_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACR", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441068_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441129_England_20200402_null_2":{
"Global MG94xREV":0.000549216409663443,
"Nucleotide GTR":0.0005548482184136282,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "S", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "TCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441129_England_20200402_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441130_England_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005491434333517676,
"Nucleotide GTR":0.0005547744937837609,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACG", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441130_England_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441135_England_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005490989452348172,
"Nucleotide GTR":0.0005547295494740201,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAA", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441135_England_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441136_England_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005493367902298013,
"Nucleotide GTR":0.0005549698333938074,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAA", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441136_England_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441146_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0001225659082798717,
"Nucleotide GTR":0.0001238227311689546,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "I", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ATT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441146_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441209_England_20200403_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005492778315190094,
"Nucleotide GTR":0.0005549102701049701,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGA", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441209_England_20200403_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441246_England_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005493028087602894,
"Nucleotide GTR":0.0005549355034694171,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "V", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "I", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GTT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "ATT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441246_England_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441273_England_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "AS", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "KCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441273_England_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441325_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "DG", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GRC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441325_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441385_Northern_Ireland_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTY", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441385_Northern_Ireland_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441431_Northern_Ireland_20200317_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005495365135707466,
"Nucleotide GTR":0.0005551716047501424,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAA", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441431_Northern_Ireland_20200317_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441449_England_20200409_null_6":{
"Global MG94xREV":0.0001225658920050809,
"Nucleotide GTR":0.000123822714727278,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "Y", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "TAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441449_England_20200409_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441462_England_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005494320042066365,
"Nucleotide GTR":0.0005550660237196721,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "A", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GCT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441462_England_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441548_England_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "KGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441548_England_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441559_England_20200406_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005493305107266698,
"Nucleotide GTR":0.0005549634894990087,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAT", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441559_England_20200406_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441640_England_20200405_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005493305107242218,
"Nucleotide GTR":0.0005549634894965353,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "L", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CTA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441640_England_20200405_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441693_Northern_Ireland_20200406_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005490019354683432,
"Nucleotide GTR":0.0005546315449440211,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "A", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "GCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441693_Northern_Ireland_20200406_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441707_England_20200406_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0005491434333517676,
"Nucleotide GTR":0.0005547744937837609,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "V", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "GTT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441707_England_20200406_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441798_England_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "PS", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "YCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441798_England_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441810_England_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "V", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "TI", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GTT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "AYT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441810_England_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441861_England_20200420_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0001148027944814535,
"Nucleotide GTR":0.0001159800123706687,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTT", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441861_England_20200420_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441871_England_20200429_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005491017412562294,
"Nucleotide GTR":0.0005547323741665676,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "D", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAT", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441871_England_20200429_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441881_England_20200430_null_10":{
"Global MG94xREV":0.0005491706660396035,
"Nucleotide GTR":0.0005548020057227028,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "L", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TTA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441881_England_20200430_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441893_England_20200430_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005491677704734089,
"Nucleotide GTR":0.0005547990804646138,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTT", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441893_England_20200430_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441944_England_20200419_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005493305315157852,
"Nucleotide GTR":0.0005549635105013002,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAT", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441944_England_20200419_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441974_England_20200408_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005491434333517676,
"Nucleotide GTR":0.0005547744937837609,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCG", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441974_England_20200408_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442000_England_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005491416544113354,
"Nucleotide GTR":0.0005547726966016076,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "I", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATT", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442000_England_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442060_England_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "VF", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "KTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442060_England_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442065_England_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "S", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "LF", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "TCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "YTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442065_England_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442103_England_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005494341780988716,
"Nucleotide GTR":0.0005550682199035664,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAC", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442103_England_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442108_England_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "TI", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "AYA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCT", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442108_England_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442149_England_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAY", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442149_England_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442163_England_20200404_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAT", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442163_England_20200404_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442180_England_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "AS", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "KCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442180_England_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442189_England_20200406_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005492745581426901,
"Nucleotide GTR":0.0005549069631625944,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "V", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "I", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GTT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ATT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442189_England_20200406_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442196_England_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005493711815965722,
"Nucleotide GTR":0.0005550045774186509,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "AGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442196_England_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442198_England_20200404_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0001148026261414984,
"Nucleotide GTR":0.0001159798423045116,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTT", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442198_England_20200404_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442199_England_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "HP", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CMT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442199_England_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442202_England_20200406_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "AV", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GYA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442202_England_20200406_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442215_England_20200405_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "LF", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "YTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442215_England_20200405_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442226_England_20200406_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "L", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CTA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442226_England_20200406_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442234_England_20200406_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "V", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "AV", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GTT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GYA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442234_England_20200406_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442248_England_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005494341780988716,
"Nucleotide GTR":0.0005550682199035664,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAC", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442248_England_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442260_England_20200405_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "GC", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "KGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442260_England_20200405_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442261_England_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005493297125913557,
"Nucleotide GTR":0.0005549626831794056,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "I", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ATA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442261_England_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442330_England_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005493376828319591,
"Nucleotide GTR":0.0005549707351489413,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "L", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "I", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CTG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ATT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442330_England_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442351_England_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005495981856084814,
"Nucleotide GTR":0.0005552339091890867,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "L", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAT", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CTT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442351_England_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442393_England_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005491434333517676,
"Nucleotide GTR":0.0005547744937837609,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAG", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442393_England_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442517_England_20200409_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005493359949661652,
"Nucleotide GTR":0.0005549690299753306,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "T", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "ACA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442517_England_20200409_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442524_England_20200412_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "VL", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "KTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442524_England_20200412_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442533_England_20200407_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "L", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TTA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442533_England_20200407_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442564_England_20200411_null_72":{
"Global MG94xREV":0.0005490828994594478,
"Nucleotide GTR":0.000554713339161073,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "C", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "TGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442564_England_20200411_null_72",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442581_England_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "MI", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATK", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442581_England_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442587_England_20200411_null_8":{
"Global MG94xREV":0.0005492860453500883,
"Nucleotide GTR":0.0005549185681628228,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTT", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442587_England_20200411_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442593_England_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "V", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "IV", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GTT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "RTT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442593_England_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442601_England_20200407_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0005493305315157852,
"Nucleotide GTR":0.0005549635105013002,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "F", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "TTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442601_England_20200407_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442605_England_20200411_null_9":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTT", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442605_England_20200411_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442614_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005490287711752248,
"Nucleotide GTR":0.0005546586558312621,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "A", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "S", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "GCA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "TCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442614_England_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442654_England_20200407_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "TI", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "AYT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442654_England_20200407_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442663_England_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACK", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442663_England_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442694_England_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005493305107242218,
"Nucleotide GTR":0.0005549634894965353,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "L", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CTT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442694_England_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442715_England_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "YTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442715_England_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442731_England_20200406_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005494496750536015,
"Nucleotide GTR":0.0005550838757681237,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "H", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAT", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442731_England_20200406_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442739_England_20200405_null_14":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "V", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GTA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442739_England_20200405_null_14",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442773_England_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "TI", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "AYA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442773_England_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442794_England_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGR", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442794_England_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442797_England_20200407_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005493290458029838,
"Nucleotide GTR":0.0005549620095536118,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "V", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GTT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442797_England_20200407_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442841_England_20200408_null_21":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAT", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442841_England_20200408_null_21",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442886_England_20200410_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCT", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442886_England_20200410_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442926_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "DY", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "KAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442926_England_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442934_England_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCR", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442934_England_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442948_England_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005496866030338302,
"Nucleotide GTR":0.0005553232332698467,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCA", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442948_England_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442967_England_20200408_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "S", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "TCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442967_England_20200408_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442978_England_20200407_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "AV", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GYT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442978_England_20200407_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442980_England_20200412_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "S", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "HR", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "TCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CRT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442980_England_20200412_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442991_England_20200410_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "S", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AGT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAG", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442991_England_20200410_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443096_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "IV", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "RTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443096_England_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443107_England_20200411_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "GV", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GKT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443107_England_20200411_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443181_Jeddah_20200401_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0005491950926397218,
"Nucleotide GTR":0.0005548266827995683,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "TTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443181_Jeddah_20200401_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443203_Singapore_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "TM", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "AYG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443203_Singapore_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443225_Singapore_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAR", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443225_Singapore_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443228_Singapore_20200318_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATY", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443228_Singapore_20200318_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443246_Singapore_20200408_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0005492328348465609,
"Nucleotide GTR":0.000554864812024871,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "I", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ATT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443246_Singapore_20200408_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443256_Minnesota_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001099499569065007,
"Nucleotide GTR":0.001110774125296274,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "R", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACN", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "AGG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAG", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443256_Minnesota_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443260_Ile_de_France_20200402_null_40":{
"Global MG94xREV":0.0005493305107242218,
"Nucleotide GTR":0.0005549634894965353,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "L", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TTA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443260_Ile_de_France_20200402_null_40",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443266_Bretagne_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005491706660396035,
"Nucleotide GTR":0.0005548020057227028,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "L", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CTC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443266_Bretagne_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443267_Bretagne_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0001312000842657538,
"Nucleotide GTR":0.0001325454442542612,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGC", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443267_Bretagne_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443299_Ile_de_France_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005493305107242218,
"Nucleotide GTR":0.0005549634894965353,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "V", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GTT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443299_Ile_de_France_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443310_Grand_Est_20200320_null_4":{
"Global MG94xREV":0.000549014205208681,
"Nucleotide GTR":0.0005546439405014865,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "F", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "TTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443310_Grand_Est_20200320_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443381_England_20200412_null_10":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCK", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443381_England_20200412_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443389_England_20200414_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0001225658919535026,
"Nucleotide GTR":0.0001238227146751708,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGT", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443389_England_20200414_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443398_England_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005491434333517676,
"Nucleotide GTR":0.0005547744937837609,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGG", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443398_England_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443435_England_20200415_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGY", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443435_England_20200415_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443441_England_20200417_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "TI", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "AYA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443441_England_20200417_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443442_England_20200417_null_8":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "F", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "TTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443442_England_20200417_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443444_England_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001098978025678459,
"Nucleotide GTR":0.001110247233867394,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "F", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "F", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "TTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "TTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443444_England_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443445_England_20200416_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005492296701490498,
"Nucleotide GTR":0.000554861614875724,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "L", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TTA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443445_England_20200416_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443450_England_20200414_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "IM", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATR", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443450_England_20200414_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443475_England_20200413_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAY", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443475_England_20200413_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443494_England_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005489678981349635,
"Nucleotide GTR":0.00055459715858292,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCT", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443494_England_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443508_England_20200413_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0005492158036135505,
"Nucleotide GTR":0.0005548476061491418,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "S", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "TCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443508_England_20200413_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443524_England_20200413_null_13":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "I", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ATA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443524_England_20200413_null_13",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443554_England_20200417_null_12":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGY", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443554_England_20200417_null_12",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443582_England_20200414_null_25":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTC", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443582_England_20200414_null_25",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443606_England_20200414_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "V", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "V", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GTT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GTT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443606_England_20200414_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443607_England_20200414_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "PL", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CYT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443607_England_20200414_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443615_England_20200414_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "S", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "TCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443615_England_20200414_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443618_England_20200414_null_11":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATT", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443618_England_20200414_null_11",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443674_England_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "LF", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "I", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "YTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ATA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443674_England_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443702_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005491919513245922,
"Nucleotide GTR":0.0005548235092725721,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "F", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "TTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443702_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443729_England_20200326_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005491102805513995,
"Nucleotide GTR":0.0005547410010259045,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "S", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "TCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443729_England_20200326_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443764_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCW", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443764_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443769_England_20200325_null_28":{
"Global MG94xREV":0.0005489602610524177,
"Nucleotide GTR":0.0005545894431877318,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTG", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443769_England_20200325_null_28",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443773_England_20200326_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0001148035283704973,
"Nucleotide GTR":0.0001159807537852028,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "F", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "TTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443773_England_20200326_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443787_England_20200326_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005493305107242218,
"Nucleotide GTR":0.0005549634894965353,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "L", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CTA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443787_England_20200326_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443802_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "AS", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "KCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443802_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443824_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "YAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443824_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443851_England_20200330_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0001203167625217542,
"Nucleotide GTR":0.000121550522081814,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTT", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443851_England_20200330_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443876_England_20200330_null_23":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "L", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TTA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443876_England_20200330_null_23",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443895_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAY", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443895_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443935_England_20200329_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005491890834700079,
"Nucleotide GTR":0.0005548206120102564,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "S", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "TCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443935_England_20200329_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443957_England_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005491103007360891,
"Nucleotide GTR":0.0005547410214175729,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "F", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTT", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443957_England_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443969_England_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGT", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443969_England_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443971_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "V", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "PS", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GTT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "YCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443971_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443990_England_20200326_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005496866030338302,
"Nucleotide GTR":0.0005553232332698467,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "H", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CAC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443990_England_20200326_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444058_California_20200428_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005490450765847255,
"Nucleotide GTR":0.0005546751284406974,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCC", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444058_California_20200428_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444068_California_20200430_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005491017412562294,
"Nucleotide GTR":0.0005547323741665676,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "H", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAT", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444068_California_20200430_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444085_England_20200404_null_49":{
"Global MG94xREV":0.0005492083481923393,
"Nucleotide GTR":0.0005548400742780905,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "P", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CCC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444085_England_20200404_null_49",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444096_England_20200406_null_7":{
"Global MG94xREV":0.0005493305315157852,
"Nucleotide GTR":0.0005549635105013002,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "V", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GTA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444096_England_20200406_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444117_England_20200406_null_17":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "C", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "TGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444117_England_20200406_null_17",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444129_England_20200408_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "L", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGT", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "TTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444129_England_20200408_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444132_England_20200408_null_10":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTT", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444132_England_20200408_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444142_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005494840858245293,
"Nucleotide GTR":0.0005551186393960997,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "S", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "AGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444142_England_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444177_England_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005493418403834649,
"Nucleotide GTR":0.0005549749353330687,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "L", "G", "I", "L", "C", "I", "I", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGT", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "TTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATA", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444177_England_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444193_England_20200414_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0001148026583389116,
"Nucleotide GTR":0.0001159798748320856,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTT", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444193_England_20200414_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444197_England_20200413_null_9":{
"Global MG94xREV":0.0005491411659253042,
"Nucleotide GTR":0.0005547722031065134,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "I", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATA", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444197_England_20200413_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444206_England_20200415_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005493367900979669,
"Nucleotide GTR":0.0005549698332606223,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "T", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "ACA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444206_England_20200415_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444230_England_20200416_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005492164096805414,
"Nucleotide GTR":0.0005548482184309022,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "I", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATT", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444230_England_20200416_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444235_England_20200416_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005493367900979669,
"Nucleotide GTR":0.0005549698332606223,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTA", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444235_England_20200416_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444240_England_20200418_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0005493305107242218,
"Nucleotide GTR":0.0005549634894965353,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATT", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444240_England_20200418_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444255_England_20200419_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000549392579203478,
"Nucleotide GTR":0.0005550261944422159,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "Y", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "TAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTC", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444255_England_20200419_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444273_Guangdong_20200205_null_23":{
"Global MG94xREV":0.0005493305107242218,
"Nucleotide GTR":0.0005549634894965353,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCT", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444273_Guangdong_20200205_null_23",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444331_England_20200428_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0001225682756983896,
"Nucleotide GTR":0.0001238251228636014,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "S", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "TCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444331_England_20200428_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444366_England_20200427_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005491434333517676,
"Nucleotide GTR":0.0005547744937837609,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "R", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AGG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444366_England_20200427_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444395_England_20200410_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "S", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "TCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444395_England_20200410_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444403_England_20200418_null_6":{
"Global MG94xREV":0.0005491434333517676,
"Nucleotide GTR":0.0005547744937837609,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "S", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AGC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444403_England_20200418_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444424_England_20200419_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005491434310566539,
"Nucleotide GTR":0.0005547744914651119,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "V", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "GTA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444424_England_20200419_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444435_England_20200418_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "S", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "TCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444435_England_20200418_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444437_England_20200418_null_22":{
"Global MG94xREV":0.0005491698709265187,
"Nucleotide GTR":0.0005548012024563209,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAT", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444437_England_20200418_null_22",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444451_England_20200415_null_246":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "V", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GTT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444451_England_20200415_null_246",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444467_Gujarat_20200429_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005496866030338302,
"Nucleotide GTR":0.0005553232332698467,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCA", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444467_Gujarat_20200429_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444480_Gujarat_20200430_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0001225682757611674,
"Nucleotide GTR":0.0001238251229270229,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTT", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444480_Gujarat_20200430_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444491_Stockholm_20200301_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0005492164096805414,
"Nucleotide GTR":0.0005548482184309022,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGT", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444491_Stockholm_20200301_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444493_Montevideo_20200313_null_39":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "TTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444493_Montevideo_20200313_null_39",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444525_Illinois_20200315_null_23":{
"Global MG94xREV":0.0005491103007360891,
"Nucleotide GTR":0.0005547410214175729,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "L", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "TTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444525_Illinois_20200315_null_23",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444532_Illinois_20200315_null_21":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444532_Illinois_20200315_null_21",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444541_Illinois_20200316_null_10":{
"Global MG94xREV":0.000122565879453675,
"Nucleotide GTR":0.0001238227020471667,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "S", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "TCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444541_Illinois_20200316_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444549_Illinois_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0001048489196640941,
"Nucleotide GTR":0.0001059240679168085,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATA", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444549_Illinois_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444593_Illinois_20200320_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005490530536156841,
"Nucleotide GTR":0.0005546831872702187,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "C", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "TGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444593_Illinois_20200320_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444606_Illinois_20200320_null_21":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "I", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "ATT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACC", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444606_Illinois_20200320_null_21",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444653_New_York_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005495061402313075,
"Nucleotide GTR":0.0005551409199545346,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "I", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "ATT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444653_New_York_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444679_New_York_20200330_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00054920779803432,
"Nucleotide GTR":0.0005548395184786073,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "D", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAT", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444679_New_York_20200330_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444687_New_York_20200330_null_12":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "M", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ATG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444687_New_York_20200330_null_12",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444711_New_York_20200402_null_8":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "I", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATT", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444711_New_York_20200402_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444745_New_York_20200402_null_13":{
"Global MG94xREV":0.0005492632872834764,
"Nucleotide GTR":0.0005548955767290413,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGT", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444745_New_York_20200402_null_13",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444753_New_York_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005491761879477162,
"Nucleotide GTR":0.0005548075842539056,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "H", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAC", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444753_New_York_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444768_New_York_20200406_null_38":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGT", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444768_New_York_20200406_null_38",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444781_New_York_20200318_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAT", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444781_New_York_20200318_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444786_New_York_20200317_null_671":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGC", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444786_New_York_20200317_null_671",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444794_Queensland_20200326_null_21":{
"Global MG94xREV":0.0005492929362907341,
"Nucleotide GTR":0.0005549255297649762,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "Y", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "TAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444794_Queensland_20200326_null_21",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444831_Unknown_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005490345960752635,
"Nucleotide GTR":0.0005546645404613495,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "N", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAC", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444831_Unknown_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444848_Unknown_20200331_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0005491950925765576,
"Nucleotide GTR":0.0005548266827357571,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAT", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444848_Unknown_20200331_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444914_Unknown_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005493305107242218,
"Nucleotide GTR":0.0005549634894965353,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "Y", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "TAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444914_Unknown_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444917_Unknown_20200328_null_75":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAT", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444917_Unknown_20200328_null_75",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444988_Catalonia_20200328_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0005491103007360891,
"Nucleotide GTR":0.0005547410214175729,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "F", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTT", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444988_Catalonia_20200328_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445011_Florida_20200417_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "V", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GTT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445011_Florida_20200417_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445024_Florida_20200430_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005494341780988716,
"Nucleotide GTR":0.0005550682199035664,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "A", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GCG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445024_Florida_20200430_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445037_Florida_20200428_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005493305107242218,
"Nucleotide GTR":0.0005549634894965353,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "L", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CTA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445037_Florida_20200428_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445038_Florida_20200428_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0001368389807821548,
"Nucleotide GTR":0.0001382421634907843,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "V", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GTT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445038_Florida_20200428_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445058_Luxembourg_20200422_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005493305106905306,
"Nucleotide GTR":0.0005549634894624986,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "V", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445058_Luxembourg_20200422_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445075_Luxembourg_20200508_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0005494722500636508,
"Nucleotide GTR":0.000555106682268232,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAA", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445075_Luxembourg_20200508_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445076_Luxembourg_20200422_null_27":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "Y", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "TAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445076_Luxembourg_20200422_null_27",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445078_Texas_20200320_null_21":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "N", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAT", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445078_Texas_20200320_null_21",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445105_California_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000223148902794866,
"Nucleotide GTR":0.0002254371300241368,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGT", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445105_California_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445113_California_20200328_null_7":{
"Global MG94xREV":0.0005491434333517676,
"Nucleotide GTR":0.0005547744937837609,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "R", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AGG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445113_California_20200328_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445158_Louisiana_20200408_null_8":{
"Global MG94xREV":0.0005493145717785428,
"Nucleotide GTR":0.000554947387108737,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "S", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "TCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445158_Louisiana_20200408_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445164_California_20200321_null_21":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "F", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "TTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445164_California_20200321_null_21",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445170_California_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005494109740710318,
"Nucleotide GTR":0.000555044777935554,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTT", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445170_California_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445171_California_20200327_null_19114":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445171_California_20200327_null_19114",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445172_California_20200325_null_1144":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "V", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "L", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "C", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "GTG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CTT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TGT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445172_California_20200325_null_1144",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445180_California_20200330_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005493367902298013,
"Nucleotide GTR":0.0005549698333938074,
"amino-acid": [
["A", "V", "G", "A", "C", "V", "L", "C", "N", "S", "Q", "T", "S", "L", "R", "C", "G", "A", "C", "I", "R", "R", "P", "F", "L", "C", "C", "K", "C", "C", "Y", "D", "H", "V", "I", "S", "T", "S", "H", "K", "L", "V", "L", "S", "V", "N", "P", "Y", "V", "C", "N", "A", "P", "G", "C", "D", "V", "T", "D", "V", "T", "Q", "L", "Y", "L", "G", "G", "M", "S", "Y", "Y", "C", "K", "S", "H", "K", "P", "P", "I", "S", "F", "P", "L", "C", "A", "N", "G", "Q", "V", "F", "G", "L", "Y", "K", "N", "T", "C", "V", "G", "S", "D", "N", "V", "T", "D", "F", "N", "A", "I", "A", "T", "C", "D", "W", "T", "N", "A", "G", "D", "Y", "I", "L", "A", "N", "T", "C", "T", "E", "R", "L", "K", "L", "F", "A", "A", "E", "T", "L", "K", "A", "T", "E", "E", "T", "F", "K", "L", "S", "Y", "G", "I", "A", "T", "V", "R", "E", "V", "L", "S", "D", "R", "E", "L", "H", "L", "S", "W", "E", "V", "G", "K", "P", "R", "P", "P", "L", "N", "R", "N", "Y", "V", "F", "T", "G", "Y", "R", "V", "T", "K", "N", "S", "K", "V", "Q", "I", "G", "E", "Y", "T", "F", "E", "K", "G", "D", "Y", "G", "D", "A", "V", "V", "Y", "R", "G", "T", "T", "T", "Y", "K", "L", "N", "V", "G", "D", "Y", "F", "V", "L", "T", "S", "H", "T", "V", "M", "P", "L", "S", "A", "P", "T", "L", "V", "P", "Q", "E", "H", "Y", "V", "R", "I", "T", "G", "L", "Y", "P", "T", "L", "N", "I", "S", "D", "E", "F", "S", "S", "N", "V", "A", "N", "Y", "Q", "K", "V", "G", "M", "Q", "K", "Y", "S", "T", "L", "Q", "G", "P", "P", "G", "T", "G", "K", "S", "H", "F", "A", "I", "G", "L", "A", "L", "Y", "Y", "P", "S", "A", "R", "I", "M", "Y", "T", "A", "C", "S", "H", "A", "A", "V", "D", "A", "L", "C", "E", "K", "A", "L", "K", "Y", "L", "P", "I", "D", "K", "C", "S", "R", "I", "I", "P", "A", "R", "A", "R", "V", "E", "C", "F", "D", "K", "F", "K", "V", "N", "S", "T", "L", "E", "Q", "Y", "V", "F", "C", "T", "V", "N", "A", "L", "P", "E", "T", "T", "A", "D", "I", "V", "V", "F", "D", "E", "I", "S", "M", "A", "T", "N", "Y", "D", "L", "S", "V", "V", "N", "A", "R", "L", "R", "A", "K", "H", "Y", "V", "Y", "I", "G", "D", "P", "A", "Q", "L", "P", "A", "P", "R", "T", "L", "L", "T", "K", "G", "T", "L", "E", "P", "E", "Y", "F", "N", "S", "V", "C", "R", "L", "M", "K", "T", "I", "G", "P", "D", "M", "F", "L", "G", "T", "C", "R", "R", "C", "P", "A", "E", "I", "V", "D", "T", "V", "S", "A", "L", "V", "Y", "D", "N", "K", "L", "K", "A", "H", "K", "D", "K", "S", "A", "Q", "C", "F", "K", "M", "F", "Y", "K", "G", "V", "I", "T", "H", "D", "V", "S", "S", "A", "I", "N", "R", "P", "Q", "I", "G", "V", "V", "R", "E", "F", "L", "T", "R", "N", "P", "A", "W", "R", "K", "A", "V", "F", "I", "S", "P", "Y", "N", "S", "Q", "N", "A", "V", "A", "S", "K", "I", "L", "G", "L", "P", "T", "Q", "T", "V", "D", "S", "S", "Q", "G", "S", "E", "Y", "D", "Y", "V", "I", "F", "T", "Q", "T", "T", "E", "T", "A", "H", "S", "C", "N", "V", "N", "R", "F", "N", "V", "A", "I", "T", "R", "A", "K", "V", "G", "I", "L", "C", "I", "M", "S", "D", "R", "D", "L", "Y", "D", "K", "L", "Q", "F", "T", "S", "L", "E", "I", "P", "R", "R", "N", "V", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GTT", "GGG", "GCT", "TGT", "GTT", "CTT", "TGC", "AAT", "TCA", "CAG", "ACT", "TCA", "TTA", "AGA", "TGT", "GGT", "GCT", "TGC", "ATA", "CGT", "AGA", "CCA", "TTC", "TTA", "TGT", "TGT", "AAA", "TGC", "TGT", "TAC", "GAC", "CAT", "GTC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCA", "CAT", "AAA", "TTA", "GTC", "TTG", "TCT", "GTT", "AAT", "CCG", "TAT", "GTT", "TGC", "AAT", "GCT", "CCA", "GGT", "TGT", "GAT", "GTC", "ACA", "GAT", "GTG", "ACT", "CAA", "CTT", "TAC", "TTA", "GGA", "GGT", "ATG", "AGC", "TAT", "TAT", "TGT", "AAA", "TCA", "CAT", "AAA", "CCA", "CCC", "ATT", "AGT", "TTT", "CCA", "TTG", "TGT", "GCT", "AAT", "GGA", "CAA", "GTT", "TTT", "GGT", "TTA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACA", "TGT", "GTT", "GGT", "AGC", "GAT", "AAT", "GTT", "ACT", "GAC", "TTT", "AAT", "GCA", "ATT", "GCA", "ACA", "TGT", "GAC", "TGG", "ACA", "AAT", "GCT", "GGT", "GAT", "TAC", "ATT", "TTA", "GCT", "AAC", "ACC", "TGT", "ACT", "GAA", "AGA", "CTC", "AAG", "CTT", "TTT", "GCA", "GCA", "GAA", "ACG", "CTC", "AAA", "GCT", "ACT", "GAG", "GAG", "ACA", "TTT", "AAA", "CTG", "TCT", "TAT", "GGT", "ATT", "GCT", "ACT", "GTA", "CGT", "GAA", "GTG", "CTG", "TCT", "GAC", "AGA", "GAA", "TTA", "CAT", "CTT", "TCA", "TGG", "GAA", "GTT", "GGT", "AAA", "CCT", "AGA", "CCA", "CCA", "CTT", "AAC", "CGA", "AAT", "TAT", "GTC", "TTT", "ACT", "GGT", "TAT", "CGT", "GTA", "ACT", "AAA", "AAC", "AGT", "AAA", "GTA", "CAA", "ATA", "GGA", "GAG", "TAC", "ACC", "TTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GAC", "TAT", "GGT", "GAT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "CGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ACT", "TAC", "AAA", "TTA", "AAT", "GTT", "GGT", "GAT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTG", "ACA", "TCA", "CAT", "ACA", "GTA", "ATG", "CCA", "TTA", "AGT", "GCA", "CCT", "ACA", "CTA", "GTG", "CCA", "CAA", "GAG", "CAC", "TAT", "GTT", "AGA", "ATT", "ACT", "GGC", "TTA", "TAC", "CCA", "ACA", "CTC", "AAT", "ATC", "TCA", "GAT", "GAG", "TTT", "TCT", "AGC", "AAT", "GTT", "GCA", "AAT", "TAT", "CAA", "AAG", "GTT", "GGT", "ATG", "CAA", "AAG", "TAT", "TCT", "ACA", "CTC", "CAG", "GGA", "CCA", "CCT", "GGT", "ACT", "GGT", "AAG", "AGT", "CAT", "TTT", "GCT", "ATT", "GGC", "CTA", "GCT", "CTC", "TAC", "TAC", "CCT", "TCT", "GCT", "CGC", "ATA", "ATG", "TAT", "ACA", "GCT", "TGC", "TCT", "CAT", "GCC", "GCT", "GTT", "GAT", "GCA", "CTA", "TGT", "GAG", "AAG", "GCA", "TTA", "AAA", "TAT", "TTG", "CCT", "ATA", "GAT", "AAA", "TGT", "AGT", "AGA", "ATT", "ATA", "CCT", "GCA", "CGT", "GCT", "CGT", "GTA", "GAG", "TGT", "TTT", "GAT", "AAA", "TTC", "AAA", "GTG", "AAT", "TCA", "ACA", "TTA", "GAA", "CAG", "TAT", "GTC", "TTT", "TGT", "ACT", "GTA", "AAT", "GCA", "TTG", "CCT", "GAG", "ACG", "ACA", "GCA", "GAT", "ATA", "GTT", "GTC", "TTT", "GAT", "GAA", "ATT", "TCA", "ATG", "GCC", "ACA", "AAT", "TAT", "GAT", "TTG", "AGT", "GTT", "GTC", "AAT", "GCC", "AGA", "TTA", "CGT", "GCT", "AAG", "CAC", "TAT", "GTG", "TAC", "ATT", "GGC", "GAC", "CCT", "GCT", "CAA", "TTA", "CCT", "GCA", "CCA", "CGC", "ACA", "TTG", "CTA", "ACT", "AAG", "GGC", "ACA", "CTA", "GAA", "CCA", "GAA", "TAT", "TTC", "AAT", "TCA", "GTG", "TGT", "AGA", "CTT", "ATG", "AAA", "ACT", "ATA", "GGT", "CCA", "GAC", "ATG", "TTC", "CTC", "GGA", "ACT", "TGT", "CGG", "CGT", "TGT", "CCT", "GCT", "GAA", "ATT", "GTT", "GAC", "ACT", "GTG", "AGT", "GCT", "TTG", "GTT", "TAT", "GAT", "AAT", "AAG", "CTT", "AAA", "GCA", "CAT", "AAA", "GAC", "AAA", "TCA", "GCT", "CAA", "TGC", "TTT", "AAA", "ATG", "TTT", "TAT", "AAG", "GGT", "GTT", "ATC", "ACG", "CAT", "GAT", "GTT", "TCA", "TCT", "GCA", "ATT", "AAC", "AGG", "CCA", "CAA", "ATA", "GGC", "GTG", "GTA", "AGA", "GAA", "TTC", "CTT", "ACA", "CGT", "AAC", "CCT", "GCT", "TGG", "AGA", "AAA", "GCT", "GTC", "TTT", "ATT", "TCA", "CCT", "TAT", "AAT", "TCA", "CAG", "AAT", "GCT", "GTA", "GCC", "TCA", "AAG", "ATT", "TTG", "GGA", "CTA", "CCA", "ACT", "CAA", "ACT", "GTT", "GAT", "TCA", "TCA", "CAG", "GGC", "TCA", "GAA", "TAT", "GAC", "TAT", "GTC", "ATA", "TTC", "ACT", "CAA", "ACC", "ACT", "GAA", "ACA", "GCT", "CAC", "TCT", "TGT", "AAT", "GTA", "AAC", "AGA", "TTT", "AAT", "GTT", "GCT", "ATT", "ACC", "AGA", "GCA", "AAA", "GTA", "GGC", "ATA", "CTT", "TGC", "ATA", "ATG", "TCT", "GAT", "AGA", "GAC", "CTT", "TAT", "GAC", "AAG", "TTG", "CAA", "TTT", "ACA", "AGT", "CTT", "GAA", "ATT", "CCA", "CGT", "AGG", "AAT", "GTG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445180_California_20200330_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
}
},
"attributes":{
"Global MG94xREV":{
"attribute type":"branch length",
"display order":1
},
"Nucleotide GTR":{
"attribute type":"branch length",
"display order":0
},
"amino-acid":{
"attribute type":"node label",
"display order":1
},
"codon":{
"attribute type":"node label",
"display order":0
},
"nonsynonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":1
},
"original name":{
"attribute type":"node label",
"display order":-1
},
"synonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":0
}
}
},
"data partitions":{
"0":{
"coverage": [
[0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208, 209, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 216, 217, 218, 219, 220, 221, 222, 223, 224, 225, 226, 227, 228, 229, 230, 231, 232, 233, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 242, 243, 244, 245, 246, 247, 248, 249, 250, 251, 252, 253, 254, 255, 256, 257, 258, 259, 260, 261, 262, 263, 264, 265, 266, 267, 268, 269, 270, 271, 272, 273, 274, 275, 276, 277, 278, 279, 280, 281, 282, 283, 284, 285, 286, 287, 288, 289, 290, 291, 292, 293, 294, 295, 296, 297, 298, 299, 300, 301, 302, 303, 304, 305, 306, 307, 308, 309, 310, 311, 312, 313, 314, 315, 316, 317, 318, 319, 320, 321, 322, 323, 324, 325, 326, 327, 328, 329, 330, 331, 332, 333, 334, 335, 336, 337, 338, 339, 340, 341, 342, 343, 344, 345, 346, 347, 348, 349, 350, 351, 352, 353, 354, 355, 356, 357, 358, 359, 360, 361, 362, 363, 364, 365, 366, 367, 368, 369, 370, 371, 372, 373, 374, 375, 376, 377, 378, 379, 380, 381, 382, 383, 384, 385, 386, 387, 388, 389, 390, 391, 392, 393, 394, 395, 396, 397, 398, 399, 400, 401, 402, 403, 404, 405, 406, 407, 408, 409, 410, 411, 412, 413, 414, 415, 416, 417, 418, 419, 420, 421, 422, 423, 424, 425, 426, 427, 428, 429, 430, 431, 432, 433, 434, 435, 436, 437, 438, 439, 440, 441, 442, 443, 444, 445, 446, 447, 448, 449, 450, 451, 452, 453, 454, 455, 456, 457, 458, 459, 460, 461, 462, 463, 464, 465, 466, 467, 468, 469, 470, 471, 472, 473, 474, 475, 476, 477, 478, 479, 480, 481, 482, 483, 484, 485, 486, 487, 488, 489, 490, 491, 492, 493, 494, 495, 496, 497, 498, 499, 500, 501, 502, 503, 504, 505, 506, 507, 508, 509, 510, 511, 512, 513, 514, 515, 516, 517, 518, 519, 520, 521, 522, 523, 524, 525, 526, 527, 528, 529, 530, 531, 532, 533, 534, 535, 536, 537, 538, 539, 540, 541, 542, 543, 544, 545, 546, 547, 548, 549, 550, 551, 552, 553, 554, 555, 556, 557, 558, 559, 560, 561, 562, 563, 564, 565, 566, 567, 568, 569, 570, 571, 572, 573, 574, 575, 576, 577, 578, 579, 580, 581, 582, 583, 584, 585, 586, 587, 588, 589, 590, 591, 592, 593, 594, 595, 596, 597, 598, 599, 600]
],
"name":"slac.filter.default"
}
},
"fits":{
"Global MG94xREV":{
"AIC-c":16188.02781060304,
"Equilibrium frequencies": [
[0.03289907882823232],
[0.0122972615867072],
[0.01087366552243206],
[0.03957454579442019],
[0.02471824281302147],
[0.00923936805107812],
[0.008169769921351233],
[0.0297337575094067],
[0.01801983379613616],
[0.006735587069079641],
[0.005955839872964911],
[0.02167619164950789],
[0.02623682267874191],
[0.00980699409150833],
[0.008671684568115555],
[0.03156046848670208],
[0.01846498398750077],
[0.006901978607796093],
[0.006102969046806449],
[0.02221166611447789],
[0.01387339627728177],
[0.005185700913041351],
[0.004585376738568746],
[0.01668841122166233],
[0.01011383766215188],
[0.003780425221822402],
[0.003342783196471788],
[0.01216601029493526],
[0.01472571658237815],
[0.005504287515485607],
[0.004867082070319316],
[0.01771367363468179],
[0.03380589966595281],
[0.01263621980228363],
[0.01117338414159542],
[0.04066536730213084],
[0.02539956941707968],
[0.009494039360260694],
[0.008394959132354487],
[0.03055333033191747],
[0.01851652736205369],
[0.006921244872461073],
[0.006120004946738845],
[0.02227366802180463],
[0.02696000698566067],
[0.01007731128318453],
[0.00891070841147491],
[0.03243039225026359],
[0.01223920164546971],
[0.03938769965903277],
[0.02460153880415747],
[0.009195745561442134],
[0.008131197401915671],
[0.02959337339204906],
[0.006703785859788178],
[0.005927720139916537],
[0.02157385029452009],
[0.02611294889007397],
[0.009760691628422984],
[0.008630742323136474],
[0.03141145978807065]
],
"Log Likelihood":-7221.242832904398,
"Rate Distributions":{
"non-synonymous/synonymous rate ratio for *background*": [
[0.5567011749237551, 1]
],
"non-synonymous/synonymous rate ratio for *test*": [
[0.6039030829475647, 1]
]
},
"display order":1,
"estimated parameters":871
},
"Nucleotide GTR":{
"AIC-c":17572.67508371161,
"Equilibrium frequencies": [
[0.3033165014770866],
[0.186730231555037],
[0.1946633654609999],
[0.3152899015068765]
],
"Log Likelihood":-7349.737289003646,
"Rate Distributions":{
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide C":0.1938364519373141,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide G":1,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide T":0.1460001440898387,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide G":0,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide T":2.35729199548889,
"Substitution rate from nucleotide G to nucleotide T":0.8547457697768237
},
"display order":0,
"estimated parameters":1435
}
},
"input":{
"file name":"/data/shares/veg/SARS-CoV-2/SARS-CoV-2/data/fasta/2020-05-15/sequences.helicase.compressed.fas",
"number of sequences":715,
"number of sites":601,
"partition count":1,
"trees":{
"0":"(epi_isl_438175_Washington_20200429_null_2,(epi_isl_421955_England_20200330_null_1,epi_isl_439728_England_20200408_null_5)Node1425,epi_isl_433232_Scotland_20200402_null_6,(epi_isl_444831_Unknown_20200311_null_1,epi_isl_441431_Northern_Ireland_20200317_null_2,epi_isl_445078_Texas_20200320_null_21)Node1418,epi_isl_420006_Victoria_20200324_null_1,epi_isl_437101_Michigan_20200312_null_1,epi_isl_440680_England_20200405_null_1,(epi_isl_422571_Friesland_20200328_null_1,epi_isl_436648_California_20200402_null_1)Node423,epi_isl_416386_Shanghai_20200131_null_1,epi_isl_435038_Louisiana_20200413_null_1,(epi_isl_423312_England_20200325_null_1,epi_isl_431962_Wales_20200331_null_4)Node1411,epi_isl_421510_Hauts_de_France_20200323_null_1,epi_isl_435017_Texas_20200402_null_1,(epi_isl_431916_Wales_20200331_null_1,epi_isl_432416_Wales_20200331_null_1)Node1404,epi_isl_421665_India_20200310_null_1,epi_isl_433567_Scotland_20200401_null_1,(epi_isl_436719_Abruzzo_20200320_null_2,epi_isl_444193_England_20200414_null_4)Node1397,epi_isl_441881_England_20200430_null_10,epi_isl_435620_California_20200309_null_3,(epi_isl_432115_Wales_20200407_null_1,epi_isl_442198_England_20200404_null_2)Node437,epi_isl_421178_Madrid_20200327_null_1,epi_isl_441130_England_20200403_null_1,((epi_isl_418731_England_20200313_null_2,epi_isl_438534_England_20200331_null_1,epi_isl_442605_England_20200411_null_9)Node455,epi_isl_423875_England_20200318_null_2)Node454,(epi_isl_444255_England_20200419_null_1,epi_isl_441060_England_20200402_null_1,epi_isl_439831_England_20200414_null_1,epi_isl_443582_England_20200414_null_25)Node446,epi_isl_444794_Queensland_20200326_null_21,epi_isl_444142_England_20200408_null_1,(epi_isl_436389_Comunitat_Valenciana_20200317_null_3,epi_isl_445076_Luxembourg_20200422_null_27)Node463,epi_isl_442564_England_20200411_null_72,epi_isl_435025_Texas_20200403_null_1,(epi_isl_419466_Wales_20200319_null_1,epi_isl_444549_Illinois_20200315_null_1)Node471,epi_isl_434322_Washington_20200324_null_2,epi_isl_436454_Delhi_20200413_null_1,epi_isl_422908_Zuid_Holland_20200317_null_4,epi_isl_427641_New_York_20200406_null_1,epi_isl_441385_Northern_Ireland_20200321_null_1,epi_isl_436247_Comunitat_Valenciana_20200319_null_1,epi_isl_420932_Wales_20200321_null_3,epi_isl_422372_Wales_20200328_null_1,epi_isl_430601_Victoria_20200408_null_1,epi_isl_430793_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200301_null_1,epi_isl_423147_England_20200323_null_1,(epi_isl_426712_Victoria_20200326_null_1,epi_isl_436689_Victoria_20200323_null_3)Node1378,(epi_isl_426827_Victoria_20200325_null_1,epi_isl_427601_New_York_20200316_null_5,epi_isl_434556_Manila_20200326_null_1)Node1381,epi_isl_435467_Louisiana_20200331_null_3,(epi_isl_433771_England_20200405_null_1,epi_isl_436278_Comunitat_Valenciana_20200324_null_1)Node1355,epi_isl_419473_Wales_20200320_null_1,epi_isl_440617_England_20200401_null_1,(epi_isl_442980_England_20200412_null_1,epi_isl_443615_England_20200414_null_5)Node1362,epi_isl_419923_Victoria_20200320_null_2,epi_isl_438220_Washington_20200421_null_8,(epi_isl_418099_Wales_20200313_null_1,epi_isl_441861_England_20200420_null_1)Node1347,epi_isl_419801_Victoria_20200315_null_1,epi_isl_435040_Louisiana_20200415_null_2,epi_isl_433580_Scotland_20200402_null_1,epi_isl_443702_England_20200327_null_1,epi_isl_436432_Delhi_20200405_null_1,epi_isl_422578_Netherlands_20200330_null_1,epi_isl_436141_Karnataka_20200424_null_4,epi_isl_436304_Comunitat_Valenciana_20200326_null_1,(epi_isl_423570_England_20200401_null_1,epi_isl_443773_England_20200326_null_2)Node1329,epi_isl_444437_England_20200418_null_22,epi_isl_443787_England_20200326_null_3,((epi_isl_420026_Virginia_20200327_null_3,epi_isl_439142_Scotland_20200329_null_9)Node1319,epi_isl_442524_England_20200412_null_1)Node1318,epi_isl_435542_New_York_20200422_null_1,epi_isl_439185_Scotland_20200422_null_1,epi_isl_439327_Scotland_20200430_null_2,epi_isl_423659_England_20200323_null_1,(epi_isl_435697_Singapore_20200318_null_4,epi_isl_439152_Scotland_20200419_null_1)Node1310,epi_isl_427724_New_South_Wales_20200319_null_1,(epi_isl_440354_England_20200319_null_2,epi_isl_442581_England_20200411_null_1)Node1293,(epi_isl_420789_Illinois_20200301_null_1,epi_isl_437056_California_20200407_null_1)Node1290,epi_isl_443181_Jeddah_20200401_null_4,((epi_isl_438909_Scotland_20200319_null_1,epi_isl_439441_England_20200331_null_1,epi_isl_442739_England_20200405_null_14)Node1266,epi_isl_442202_England_20200406_null_2)Node1265,((epi_isl_437715_Madinah_20200414_null_4,epi_isl_442189_England_20200406_null_2)Node1261,epi_isl_439652_England_20200329_null_1)Node1260,((epi_isl_432016_Wales_20200401_null_1,epi_isl_444132_England_20200408_null_10)Node1256,epi_isl_436435_Delhi_20200409_null_1)Node1255,(epi_isl_442978_England_20200407_null_3,epi_isl_422148_Wales_20200327_null_1,epi_isl_426649_Victoria_20200320_null_1,epi_isl_443971_England_20200327_null_1,epi_isl_431950_Wales_20200326_null_1,epi_isl_444451_England_20200415_null_246,epi_isl_421866_England_20200327_null_1,epi_isl_442593_England_20200409_null_1,epi_isl_442234_England_20200406_null_2,epi_isl_432999_England_20200402_null_1,epi_isl_441246_England_20200401_null_2,(epi_isl_433908_England_20200411_null_2,epi_isl_443606_England_20200414_null_2)Node1238,epi_isl_433904_England_20200410_null_1)Node1216,(epi_isl_433922_England_20200411_null_1,epi_isl_443969_England_20200327_null_2)Node1243,(epi_isl_419820_Victoria_20200317_null_1,epi_isl_439146_Scotland_20200407_null_3)Node1252,(epi_isl_433866_England_20200408_null_3,epi_isl_438648_England_20200423_null_4)Node1248,epi_isl_443310_Grand_Est_20200320_null_4,(epi_isl_422884_Noord_Brabant_20200101_null_1,epi_isl_427246_Washington_20200331_null_3)Node1286,epi_isl_420784_Arizona_20200302_null_1,(epi_isl_437566_California_20200324_null_1,epi_isl_423385_England_20200328_null_1,epi_isl_415519_Noord_Brabant_20200101_null_2,epi_isl_445164_California_20200321_null_21)Node1275,(epi_isl_422675_Netherlands_20200310_null_4,epi_isl_440875_England_20200423_null_2)Node1282,epi_isl_437547_Louisiana_20200331_null_2,epi_isl_417530_Luxembourg_20200318_null_1,(epi_isl_442330_England_20200405_null_1,epi_isl_423569_England_20200331_null_1,epi_isl_440930_England_20200424_null_24)Node1299,epi_isl_439510_England_20200331_null_8,(epi_isl_430493_Victoria_20200401_null_1,epi_isl_443851_England_20200330_null_5)Node1200,epi_isl_444745_New_York_20200402_null_13,epi_isl_426757_Victoria_20200326_null_1,epi_isl_414379_Singapore_20200218_null_1,epi_isl_439738_England_20200408_null_2,epi_isl_418217_Mbour_20200313_null_1,epi_isl_432548_England_20200329_null_1,(epi_isl_418503_Hangzhou_20200122_null_1,epi_isl_445038_Florida_20200428_null_5)Node1188,epi_isl_433275_Scotland_20200319_null_1,epi_isl_441209_England_20200403_null_3,(epi_isl_432899_Scotland_20200406_null_4,epi_isl_413695_China_20200101_null_1,epi_isl_427291_Ohio_20200331_null_1)Node1180,epi_isl_428771_New_York_20200405_null_1,epi_isl_430443_Malaysia_20200128_null_1,epi_isl_435045_Nur_Sultan_20200322_null_1,epi_isl_437641_Unknown_20200402_null_1,epi_isl_443381_England_20200412_null_10,epi_isl_430588_Victoria_20200407_null_1,epi_isl_436450_Delhi_20200413_null_5,(epi_isl_436436_Delhi_20200406_null_1,epi_isl_433348_Scotland_20200327_null_1)Node1163,epi_isl_430475_Victoria_20200331_null_1,(epi_isl_420103_Singapore_20200305_null_1,epi_isl_437221_Bavaria_20200406_null_1)Node1152,(epi_isl_422149_Wales_20200325_null_1,epi_isl_432000_Wales_20200330_null_2)Node1155,(epi_isl_438110_Vienna_20200326_null_1,epi_isl_443267_Bretagne_20200318_null_1)Node1145,(epi_isl_440084_England_20200322_null_1,epi_isl_441146_England_20200401_null_1)Node1148,(epi_isl_423145_England_20200324_null_1,epi_isl_440056_England_20200321_null_6)Node1138,(epi_isl_423282_England_20200326_null_1,epi_isl_438463_England_20200328_null_2)Node1141,(epi_isl_436346_Comunitat_Valenciana_20200327_null_1,epi_isl_436717_Moscow_20200414_null_3)Node1131,(epi_isl_437066_California_20200416_null_1,epi_isl_443389_England_20200414_null_5)Node1134,(epi_isl_427172_Idaho_20200329_null_1,epi_isl_442934_England_20200410_null_1)Node1124,epi_isl_428706_Madrid_20200321_null_2,epi_isl_438092_Vienna_20200323_null_1,(epi_isl_438793_Scotland_20200331_null_2,epi_isl_444480_Gujarat_20200430_null_3)Node1120,(epi_isl_434683_Maryland_20200314_null_8,epi_isl_442654_England_20200407_null_3)Node1117,(epi_isl_418697_England_20200316_null_1,epi_isl_439380_England_20200331_null_1)Node1114,(epi_isl_437451_Gujarat_20200426_null_1,epi_isl_439896_England_20200329_null_8)Node1110,epi_isl_420528_England_20200327_null_1,(epi_isl_422312_Wales_20200328_null_1,epi_isl_427061_Victoria_20200330_null_1)Node515,(epi_isl_432013_Wales_20200331_null_1,epi_isl_444541_Illinois_20200316_null_10)Node512,(epi_isl_423112_England_20200324_null_2,epi_isl_430423_New_York_20200411_null_3)Node506,(epi_isl_442663_England_20200406_null_1,epi_isl_434772_Texas_20200318_null_2,epi_isl_435416_Baranya_20200327_null_1)Node500,epi_isl_440309_England_20200319_null_1,epi_isl_441944_England_20200419_null_2,epi_isl_426674_Victoria_20200322_null_2,epi_isl_437912_Dhaka_20200418_null_2,epi_isl_442393_England_20200409_null_1,epi_isl_426299_New_York_20200328_null_1,epi_isl_444988_Catalonia_20200328_null_4,epi_isl_433336_Scotland_20200326_null_1,epi_isl_439209_Scotland_20200422_null_1,(epi_isl_430815_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200418_null_1,epi_isl_441449_England_20200409_null_6)Node734,(epi_isl_441798_England_20200403_null_1,epi_isl_444331_England_20200428_null_4)Node731,(epi_isl_413523_Kerala_20200131_null_1,epi_isl_417261_England_20200306_null_1)Node728,(epi_isl_423958_England_20200319_null_1,epi_isl_430478_Victoria_20200331_null_1)Node725,epi_isl_438495_England_20200329_null_1,epi_isl_416414_Victoria_20200306_null_1,epi_isl_443824_England_20200327_null_1,epi_isl_443450_England_20200414_null_2,epi_isl_443225_Singapore_20200320_null_1,epi_isl_443203_Singapore_20200318_null_1,epi_isl_443096_England_20200408_null_1,epi_isl_442926_England_20200408_null_1,epi_isl_442773_England_20200403_null_1,epi_isl_442715_England_20200406_null_1,epi_isl_442199_England_20200405_null_1,epi_isl_442149_England_20200407_null_1,epi_isl_441548_England_20200406_null_1,epi_isl_441325_England_20200401_null_1,epi_isl_441068_England_20200401_null_1,epi_isl_440390_England_20200317_null_1,epi_isl_440085_England_20200321_null_1,epi_isl_438355_England_20200329_null_1,epi_isl_436887_Michigan_20200326_null_1,epi_isl_436463_Madhya_Pradesh_20200416_null_1,epi_isl_436445_Delhi_20200409_null_1,epi_isl_436437_Delhi_20200408_null_2,epi_isl_435680_Singapore_20200401_null_1,epi_isl_435287_Israel_20200301_null_1,epi_isl_431970_Wales_20200301_null_1,epi_isl_430712_Victoria_20200409_null_1,epi_isl_430705_Victoria_20200410_null_1,epi_isl_430685_Victoria_20200404_null_1,epi_isl_430671_Victoria_20200404_null_1,epi_isl_430665_Victoria_20200402_null_1,epi_isl_430613_Victoria_20200410_null_1,epi_isl_430592_Victoria_20200408_null_1,epi_isl_430577_Victoria_20200407_null_1,epi_isl_430492_Victoria_20200401_null_1,epi_isl_429233_Abruzzo_20200324_null_3,epi_isl_429177_Bangkok_20200328_null_1,epi_isl_428836_Singapore_20200408_null_1,epi_isl_427417_Doha_20200323_null_5,epi_isl_426780_Victoria_20200323_null_1,epi_isl_424154_England_20200320_null_1,epi_isl_424142_England_20200321_null_1,epi_isl_424131_England_20200321_null_1,epi_isl_424026_England_20200319_null_1,epi_isl_423967_England_20200320_null_1,epi_isl_423814_England_20200323_null_1,epi_isl_423593_England_20200402_null_1,epi_isl_423549_England_20200331_null_1,epi_isl_423531_England_20200326_null_1,epi_isl_423247_England_20200325_null_1,epi_isl_422465_Wisconsin_20200328_null_1,epi_isl_422384_Greater_Accra_20200324_null_1,epi_isl_422304_Wales_20200324_null_1,epi_isl_422265_Wales_20200328_null_1,epi_isl_422119_Wales_20200327_null_1,epi_isl_422043_Wales_20200329_null_1,epi_isl_421892_England_20200327_null_1,epi_isl_421860_England_20200327_null_1,epi_isl_420634_England_20200320_null_1,epi_isl_413898_Guangdong_20200228_null_1,epi_isl_417242_England_20200303_null_1,epi_isl_419578_Luxembourg_20200308_null_1,epi_isl_437971_Innsbruck_20200318_null_1,(epi_isl_433279_Scotland_20200320_null_8,epi_isl_435108_Delhi_20200315_null_1)Node595,epi_isl_436451_Delhi_20200413_null_2,epi_isl_441559_England_20200406_null_2,epi_isl_427156_Victoria_20200330_null_1,epi_isl_441129_England_20200402_null_2,epi_isl_441640_England_20200405_null_3,epi_isl_427123_Victoria_20200405_null_5,epi_isl_434946_Texas_20200329_null_1,epi_isl_430675_Victoria_20200411_null_1,epi_isl_421915_England_20200327_null_2,epi_isl_442794_England_20200406_null_1,epi_isl_420916_Wales_20200314_null_1,epi_isl_420542_England_20200322_null_1,epi_isl_439462_England_20200401_null_1,epi_isl_443764_England_20200326_null_1,epi_isl_443256_Minnesota_20200403_null_1,epi_isl_443435_England_20200415_null_1,((epi_isl_442108_England_20200406_null_1,epi_isl_442886_England_20200410_null_5)Node619,epi_isl_435082_Uttar_Pradesh_20200329_null_1)Node618,epi_isl_418732_England_20200313_null_1,((epi_isl_443524_England_20200413_null_13,epi_isl_443674_England_20200413_null_1)Node626,epi_isl_443441_England_20200417_null_5)Node625,epi_isl_442215_England_20200405_null_4,epi_isl_420917_Wales_20200315_null_1,epi_isl_443107_England_20200411_null_3,epi_isl_443475_England_20200413_null_2,(epi_isl_440382_England_20200316_null_1,epi_isl_442841_England_20200408_null_21)Node636,(epi_isl_436260_Comunitat_Valenciana_20200319_null_1,epi_isl_440003_England_20200323_null_1)Node639,epi_isl_421827_England_20200324_null_2,epi_isl_419416_Wales_20200317_null_1,(epi_isl_430477_Victoria_20200331_null_1,epi_isl_445105_California_20200324_null_1)Node648,(epi_isl_423656_England_20200322_null_1,epi_isl_439001_Scotland_20200422_null_15)Node651,epi_isl_420980_Wales_20200323_null_1,((epi_isl_425721_Scotland_20200317_null_2,epi_isl_440511_England_20200312_null_15)Node659,epi_isl_440278_England_20200321_null_1)Node658,epi_isl_443895_England_20200325_null_1,epi_isl_441136_England_20200403_null_1,epi_isl_428405_Connecticut_20200411_null_2,epi_isl_441693_Northern_Ireland_20200406_null_2,epi_isl_434007_England_20200101_null_1,epi_isl_424942_New_York_20200401_null_1,epi_isl_444230_England_20200416_null_3,epi_isl_429636_Washington_20200407_null_1,epi_isl_443802_England_20200328_null_1,(epi_isl_406036_California_20200122_null_1,epi_isl_424146_England_20200321_null_1)Node1103,(epi_isl_423687_England_20200323_null_1,epi_isl_424088_England_20200313_null_6)Node1100,epi_isl_442060_England_20200404_null_1,epi_isl_443444_England_20200414_null_1,(epi_isl_426742_Victoria_20200327_null_1,epi_isl_436340_Comunitat_Valenciana_20200329_null_1)Node1094,epi_isl_444848_Unknown_20200331_null_4,(epi_isl_440178_England_20200309_null_3,epi_isl_423779_England_20200323_null_1,epi_isl_429001_California_20200325_null_1,epi_isl_438905_Scotland_20200414_null_1,epi_isl_444917_Unknown_20200328_null_75)Node746,(epi_isl_425163_Wisconsin_20200330_null_1,epi_isl_442163_England_20200404_null_2)Node755,epi_isl_421931_England_20200331_null_1,(epi_isl_429643_USA_20200408_null_1,epi_isl_438610_England_20200421_null_4)Node760,(epi_isl_426070_Idaho_20200328_null_1,epi_isl_430942_Idaho_20200331_null_1)Node763,(epi_isl_426952_Victoria_20200328_null_1,epi_isl_430479_Victoria_20200331_null_1)Node779,(epi_isl_440740_England_20200405_null_3,epi_isl_442351_England_20200410_null_1,epi_isl_416396_Shanghai_20200210_null_1,epi_isl_440152_England_20200321_null_3)Node769,(epi_isl_438998_Scotland_20200422_null_1,epi_isl_444493_Montevideo_20200313_null_39)Node776,(epi_isl_422177_Wales_20200327_null_1,epi_isl_423426_England_20200330_null_1)Node1091,(epi_isl_439490_England_20200331_null_8,epi_isl_438825_Scotland_20200402_null_1,epi_isl_442226_England_20200406_null_5)Node1085,epi_isl_421906_England_20200327_null_1,(((epi_isl_423870_England_20200318_null_1,epi_isl_423888_England_20200318_null_2)Node1078,epi_isl_444687_New_York_20200330_null_12)Node1077,epi_isl_431951_Wales_20200405_null_1)Node1076,(epi_isl_438526_England_20200330_null_1,epi_isl_430357_New_York_20200403_null_1,epi_isl_442533_England_20200407_null_3)Node1070,epi_isl_445158_Louisiana_20200408_null_8,((epi_isl_444129_England_20200408_null_4,epi_isl_444177_England_20200411_null_1)Node797,epi_isl_444768_New_York_20200406_null_38)Node796,(epi_isl_427082_Victoria_20200328_null_1,epi_isl_426788_Victoria_20200323_null_1,epi_isl_440860_England_20200416_null_14)Node790,epi_isl_423339_England_20200327_null_1,epi_isl_440916_England_20200420_null_2,epi_isl_428461_Guangdong_20200124_null_4,epi_isl_444467_Gujarat_20200429_null_1,epi_isl_442261_England_20200407_null_1,epi_isl_426768_Victoria_20200323_null_2,epi_isl_437359_Bavaria_20200314_null_7,(epi_isl_433981_England_20200413_null_1,epi_isl_444711_New_York_20200402_null_8)Node802,epi_isl_444197_England_20200413_null_9,((epi_isl_442967_England_20200408_null_3,epi_isl_443935_England_20200329_null_2)Node808,epi_isl_440722_England_20200405_null_2)Node807,(epi_isl_438732_England_20200426_null_1,epi_isl_442991_England_20200410_null_3)Node813,epi_isl_438381_England_20200331_null_1,((epi_isl_424606_Reykjavik_20200328_null_1,epi_isl_444117_England_20200406_null_17)Node1064,epi_isl_442260_England_20200405_null_2)Node1063,(epi_isl_422606_Netherlands_20200401_null_2,epi_isl_440515_England_20200311_null_2)Node1059,epi_isl_420756_England_20200327_null_2,((epi_isl_422114_Wales_20200325_null_1,epi_isl_425134_Duesseldorf_20200311_null_1)Node1054,epi_isl_415149_England_20200301_null_1)Node1053,(epi_isl_421221_Hangzhou_20200315_null_1,epi_isl_442065_England_20200404_null_1,epi_isl_444395_England_20200410_null_7)Node1047,epi_isl_423709_England_20200323_null_1,(epi_isl_438599_England_20200422_null_3,epi_isl_443618_England_20200414_null_11)Node1043,epi_isl_438230_District_of_Columbia_20200311_null_13,epi_isl_443228_Singapore_20200318_null_3,((epi_isl_432022_Wales_20200331_null_2,epi_isl_440816_England_20200403_null_2)Node1035,epi_isl_443607_England_20200414_null_3)Node1034,(epi_isl_443445_England_20200416_null_1,epi_isl_432198_Wales_20200330_null_2,epi_isl_440824_England_20200401_null_1)Node1029,(epi_isl_419848_Victoria_20200317_null_1,epi_isl_444532_Illinois_20200315_null_21,epi_isl_437120_Michigan_20200318_null_6,((epi_isl_437155_Michigan_20200322_null_2,epi_isl_438217_Washington_20200422_null_5)Node1018,((epi_isl_418830_British_Columbia_20200309_null_1,epi_isl_434299_Washington_20200323_null_3,epi_isl_437805_Washington_20200328_null_1)Node1011,epi_isl_437563_California_20200327_null_1)Node1010,epi_isl_426869_Victoria_20200326_null_1,epi_isl_430129_Washington_20200306_null_4,epi_isl_438141_Washington_20200402_null_5,epi_isl_434119_Washington_20200325_null_1,epi_isl_426482_Montevideo_20200317_null_1,epi_isl_417368_USA_20200313_null_2,epi_isl_416682_USA_20200309_null_1,(epi_isl_417107_Washington_20200305_null_2,epi_isl_424863_Georgia_20200301_null_1)Node1000,epi_isl_418333_Ontario_20200310_null_1,epi_isl_437812_Washington_20200328_null_1,epi_isl_426082_Washington_20200325_null_2,epi_isl_415592_Washington_20200309_null_1,epi_isl_430137_Washington_20200321_null_1,epi_isl_429061_California_20200408_null_1,epi_isl_426120_Washington_20200325_null_1,epi_isl_418883_Washington_20200314_null_1,epi_isl_429041_California_20200328_null_1,epi_isl_430152_Washington_20200305_null_1,epi_isl_430200_Washington_20200304_null_2,epi_isl_434547_Puerto_Rico_20200324_null_1,epi_isl_444593_Illinois_20200320_null_2,(epi_isl_417577_Reykjavik_20200317_null_1,epi_isl_424462_Reykjavik_20200320_null_9)Node984,epi_isl_434085_Washington_20200403_null_1,epi_isl_445170_California_20200327_null_1,epi_isl_421317_Wisconsin_20200324_null_1,epi_isl_418890_Washington_20200316_null_1,epi_isl_427204_Washington_20200327_null_1,(epi_isl_417149_Washington_20200228_null_2,epi_isl_417150_Washington_20200228_null_1)Node976,epi_isl_418342_Ontario_20200311_null_1,epi_isl_445172_California_20200325_null_1144,epi_isl_415593_Washington_20200310_null_1,epi_isl_418939_Washington_20200317_null_1,(epi_isl_434084_Washington_20200401_null_1,epi_isl_438211_Washington_20200421_null_10)Node971,epi_isl_423017_Washington_20200319_null_1,epi_isl_424852_District_of_Columbia_20200306_null_1,epi_isl_426444_Washington_20200319_null_1,(epi_isl_424298_Washington_20200323_null_1,epi_isl_437861_Washington_20200404_null_7)Node939,epi_isl_427004_Victoria_20200327_null_1,epi_isl_416679_Washington_20200311_null_1,epi_isl_424199_Washington_20200320_null_1,epi_isl_424848_Arizona_20200309_null_1,epi_isl_417324_California_20200304_null_1,epi_isl_438221_Washington_20200422_null_1,epi_isl_438219_Washington_20200422_null_1,epi_isl_434170_Washington_20200329_null_1,epi_isl_424213_Washington_20200320_null_1,epi_isl_444058_California_20200428_null_1,epi_isl_416670_Washington_20200312_null_1,epi_isl_430290_Washington_20200302_null_1,epi_isl_416689_Washington_20200314_null_2,epi_isl_417117_Washington_20200303_null_1)Node898,((epi_isl_413931_California_20200305_null_2,epi_isl_435631_California_20200311_null_6)Node1022,epi_isl_435640_California_20200312_null_2)Node1021)Node894,(epi_isl_419253_Hong_Kong_20200226_null_1,epi_isl_423121_England_20200324_null_1)Node891,(epi_isl_437909_Athens_20200327_null_1,epi_isl_439042_Scotland_20200425_null_1)Node885,(epi_isl_427161_Connecticut_20200325_null_2,epi_isl_443876_England_20200330_null_23)Node882,(epi_isl_436234_Comunitat_Valenciana_20200318_null_2,epi_isl_439729_England_20200408_null_2)Node879,(epi_isl_425821_Scotland_20200311_null_2,epi_isl_443769_England_20200325_null_28)Node876,(epi_isl_438842_Scotland_20200404_null_9,epi_isl_423061_England_20200323_null_1,epi_isl_439912_England_20200323_null_1,epi_isl_423091_England_20200324_null_1,epi_isl_439548_England_20200327_null_1,epi_isl_441273_England_20200403_null_1,epi_isl_444786_New_York_20200317_null_671,epi_isl_422260_Wales_20200327_null_1,epi_isl_438788_Scotland_20200331_null_1,epi_isl_422003_England_20200331_null_1,epi_isl_423743_England_20200323_null_1,epi_isl_423062_England_20200323_null_1,epi_isl_442180_England_20200404_null_1,epi_isl_440366_England_20200320_null_1,epi_isl_430606_Victoria_20200408_null_1,epi_isl_425255_England_20200331_null_1,epi_isl_441135_England_20200402_null_1,(epi_isl_424480_Reykjavik_20200320_null_7,epi_isl_424548_Reykjavik_20200301_null_2)Node850,epi_isl_421939_England_20200401_null_2)Node832,((epi_isl_426502_Arizona_20200317_null_1,epi_isl_441810_England_20200402_null_1)Node872,epi_isl_445011_Florida_20200417_null_2)Node871,epi_isl_420195_England_20200328_null_2,epi_isl_443554_England_20200417_null_12,epi_isl_436961_LA_20200406_null_1,epi_isl_433202_Scotland_20200401_null_1,epi_isl_435059_EC_20200320_null_1,epi_isl_443246_Singapore_20200408_null_4,epi_isl_432448_Wales_20200401_null_7,epi_isl_424661_Li_ge_20200405_null_2,epi_isl_427209_Washington_20200327_null_1,epi_isl_444424_England_20200419_null_1,epi_isl_429328_Unknown_20200315_null_1,epi_isl_444525_Illinois_20200315_null_23,epi_isl_437151_Michigan_20200320_null_1,epi_isl_430610_Victoria_20200408_null_2,(epi_isl_435147_Abruzzo_20200408_null_2,epi_isl_444781_New_York_20200318_null_2)Node328,epi_isl_444679_New_York_20200330_null_2,epi_isl_434657_Skane_20200401_null_1,epi_isl_422178_Wales_20200330_null_2,epi_isl_424148_England_20200320_null_1,epi_isl_445180_California_20200330_null_2,epi_isl_429103_Guangzhou_20200209_null_1,epi_isl_431092_Connecticut_20200413_null_1,epi_isl_445058_Luxembourg_20200422_null_1,epi_isl_417556_Reykjavik_20200317_null_1,epi_isl_430467_West_Bengal_20200403_null_1,epi_isl_445113_California_20200328_null_7,epi_isl_443260_Ile_de_France_20200402_null_40,epi_isl_414567_Hong_Kong_20200210_null_1,epi_isl_439466_England_20200401_null_1,epi_isl_439600_England_20200321_null_1,epi_isl_420090_New_York_20200318_null_1,epi_isl_434878_Texas_20200324_null_1,epi_isl_418101_Wales_20200315_null_1,epi_isl_433687_England_20200101_null_1,epi_isl_444206_England_20200415_null_3,epi_isl_430340_New_York_20200330_null_1,epi_isl_443508_England_20200413_null_5,epi_isl_440891_England_20200421_null_1,epi_isl_428923_Sverdlovsk_Region_20200327_null_3,epi_isl_444753_New_York_20200402_null_1,epi_isl_441707_England_20200406_null_5,epi_isl_426784_Victoria_20200323_null_1,epi_isl_434544_Puerto_Rico_20200323_null_1,epi_isl_439669_Scotland_20200430_null_1,epi_isl_416349_Shanghai_20200130_null_1,epi_isl_427730_New_South_Wales_20200317_null_2,epi_isl_438620_England_20200421_null_1,(epi_isl_417238_England_20200303_null_1,epi_isl_419692_Belarus_20200301_null_1)Node51,epi_isl_432054_Wales_20200331_null_1,epi_isl_435121_United_Arab_Emirates_20200225_null_1,epi_isl_441871_England_20200429_null_1,epi_isl_445075_Luxembourg_20200508_null_4,epi_isl_443299_Ile_de_France_20200325_null_1,epi_isl_419252_Hong_Kong_20200226_null_2,epi_isl_430379_New_York_20200407_null_2,epi_isl_445037_Florida_20200428_null_3,epi_isl_417826_Reykjavik_20200316_null_3,epi_isl_444491_Stockholm_20200301_null_4,epi_isl_444914_Unknown_20200329_null_1,epi_isl_416348_Shanghai_20200206_null_4,epi_isl_423598_England_20200321_null_1,epi_isl_442797_England_20200407_null_3,epi_isl_416347_Shanghai_20200206_null_1,epi_isl_428879_Sverdlovsk_Region_20200319_null_3,epi_isl_435474_California_20200429_null_1,epi_isl_442000_England_20200409_null_1,((epi_isl_425173_Wisconsin_20200330_null_3,epi_isl_444606_Illinois_20200320_null_21)Node294,epi_isl_430401_Connecticut_20200410_null_6)Node293,epi_isl_429702_Minas_gerais_20200322_null_4,epi_isl_442103_England_20200405_null_1,epi_isl_424375_Reykjavik_20200301_null_1,epi_isl_424408_Reykjavik_20200319_null_1,epi_isl_440612_England_20200402_null_1,epi_isl_429206_Switzerland_20200407_null_1,epi_isl_442731_England_20200406_null_3,epi_isl_444240_England_20200418_null_5,epi_isl_417518_Taoyuan_20200204_null_1,epi_isl_439945_England_20200323_null_3,epi_isl_443398_England_20200414_null_1,epi_isl_438241_Maryland_20200330_null_1,epi_isl_443957_England_20200327_null_2,(epi_isl_425915_Scotland_20200323_null_1,epi_isl_438608_England_20200420_null_9)Node268,epi_isl_445171_California_20200327_null_19114,epi_isl_442517_England_20200409_null_3,epi_isl_422369_Wales_20200326_null_1,epi_isl_422751_Netherlands_20200326_null_1,epi_isl_441462_England_20200414_null_1,epi_isl_421245_Jiangxi_20200125_null_1,epi_isl_421864_England_20200327_null_1,epi_isl_444366_England_20200427_null_1,epi_isl_418368_Ontario_20200312_null_1,epi_isl_422080_Wales_20200329_null_1,epi_isl_439580_England_20200323_null_2,epi_isl_433696_England_20200401_null_1,(epi_isl_425190_Comunitat_Valenciana_20200316_null_2,epi_isl_444435_England_20200418_null_6)Node242,epi_isl_444085_England_20200404_null_49,epi_isl_442601_England_20200407_null_4,epi_isl_427690_New_South_Wales_20200321_null_1,epi_isl_429674_Minas_gerais_20200311_null_1,epi_isl_444235_England_20200416_null_1,epi_isl_419249_Hong_Kong_20200225_null_1,epi_isl_421175_Madrid_20200329_null_1,epi_isl_437128_Michigan_20200319_null_2,epi_isl_443266_Bretagne_20200316_null_1,epi_isl_435151_Abruzzo_20200408_null_2,epi_isl_437467_Makkah_20200323_null_1,epi_isl_439100_Scotland_20200326_null_1,epi_isl_439562_England_20200323_null_1,epi_isl_444068_California_20200430_null_1,epi_isl_439889_England_20200324_null_2,epi_isl_430330_New_York_20200330_null_1,epi_isl_442948_England_20200411_null_1,epi_isl_440504_England_20200303_null_1,epi_isl_442587_England_20200411_null_8,epi_isl_443990_England_20200326_null_2,epi_isl_437574_California_20200407_null_7,(epi_isl_420540_Estonia_20200301_null_1,epi_isl_428271_Wisconsin_20200320_null_1)Node192,epi_isl_435522_New_York_20200420_null_1,epi_isl_439235_Scotland_20200424_null_1,epi_isl_424144_England_20200321_null_1,epi_isl_434591_Virginia_20200410_null_2,epi_isl_442248_England_20200404_null_1,epi_isl_423399_England_20200329_null_3,epi_isl_423758_England_20200322_null_1,epi_isl_444273_Guangdong_20200205_null_23,epi_isl_418421_ARA_20200317_null_1,epi_isl_428456_Guangdong_20200122_null_1,epi_isl_438417_England_20200330_null_1,(epi_isl_436553_Florida_20200417_null_3,epi_isl_437123_Michigan_20200318_null_1,epi_isl_438796_Scotland_20200401_null_1)Node165,epi_isl_424343_Rome_20200323_null_7,(epi_isl_433191_Scotland_20200419_null_1,epi_isl_440216_England_20200311_null_2)Node173,epi_isl_439102_Scotland_20200326_null_1,epi_isl_441974_England_20200408_null_2,epi_isl_425682_Scotland_20200316_null_1,epi_isl_443729_England_20200326_null_2,epi_isl_444403_England_20200418_null_6,epi_isl_418116_Wales_20200313_null_1,epi_isl_431974_Wales_20200404_null_1,epi_isl_438204_Washington_20200420_null_2,(epi_isl_418974_New_York_20200317_null_1,epi_isl_443442_England_20200417_null_8)Node140,epi_isl_441893_England_20200430_null_1,(epi_isl_439856_England_20200417_null_1,epi_isl_443494_England_20200414_null_1)Node146,epi_isl_438961_Kanto_20200325_null_1,epi_isl_434711_Kinshasa_20200408_null_1,epi_isl_429774_Luxembourg_20200323_null_1,epi_isl_439685_England_20200407_null_1,epi_isl_445024_Florida_20200430_null_1,epi_isl_417955_Kinshasa_20200321_null_2,epi_isl_442196_England_20200406_null_1,epi_isl_435482_New_York_20200330_null_2,(epi_isl_439037_Scotland_20200424_null_1,epi_isl_442614_England_20200408_null_1)Node115,epi_isl_426697_Victoria_20200324_null_1,epi_isl_439007_Scotland_20200424_null_1,epi_isl_424594_Reykjavik_20200301_null_3,epi_isl_437374_Minnesota_20200410_null_1,epi_isl_444096_England_20200406_null_7,epi_isl_429370_Unknown_20200309_null_1,epi_isl_439019_Scotland_20200423_null_2,epi_isl_436449_Bihar_20200412_null_2,epi_isl_411951_Sweden_20200207_null_1,epi_isl_425505_England_20200318_null_1,epi_isl_442694_England_20200403_null_1,epi_isl_413749_China_20200201_null_1,epi_isl_419887_Victoria_20200319_null_1,epi_isl_441021_England_20200406_null_1,epi_isl_428301_Wisconsin_20200325_null_2,epi_isl_428347_Ile_De_France_20200323_null_1,epi_isl_436684_KZN_20200331_null_1,epi_isl_438691_England_20200424_null_1,epi_isl_434181_Washington_20200330_null_1,epi_isl_444653_New_York_20200330_null_1,epi_isl_430805_Buenos_Aires_20200401_null_3,epi_isl_413485_Anhui_20200124_null_2,epi_isl_438715_England_20200425_null_7)"
}
},
"tested":{
"0":{
"Node1000":"test",
"Node1010":"test",
"Node1011":"test",
"Node1018":"test",
"Node1021":"test",
"Node1022":"test",
"Node1029":"test",
"Node1034":"test",
"Node1035":"test",
"Node1043":"test",
"Node1047":"test",
"Node1053":"test",
"Node1054":"test",
"Node1059":"test",
"Node1063":"test",
"Node1064":"test",
"Node1070":"test",
"Node1076":"test",
"Node1077":"test",
"Node1078":"test",
"Node1085":"test",
"Node1091":"test",
"Node1094":"test",
"Node1100":"test",
"Node1103":"test",
"Node1110":"test",
"Node1114":"test",
"Node1117":"test",
"Node1120":"test",
"Node1124":"test",
"Node1131":"test",
"Node1134":"test",
"Node1138":"test",
"Node1141":"test",
"Node1145":"test",
"Node1148":"test",
"Node115":"test",
"Node1152":"test",
"Node1155":"test",
"Node1163":"test",
"Node1180":"test",
"Node1188":"test",
"Node1200":"test",
"Node1216":"test",
"Node1238":"test",
"Node1243":"test",
"Node1248":"test",
"Node1252":"test",
"Node1255":"test",
"Node1256":"test",
"Node1260":"test",
"Node1261":"test",
"Node1265":"test",
"Node1266":"test",
"Node1275":"test",
"Node1282":"test",
"Node1286":"test",
"Node1290":"test",
"Node1293":"test",
"Node1299":"test",
"Node1310":"test",
"Node1318":"test",
"Node1319":"test",
"Node1329":"test",
"Node1347":"test",
"Node1355":"test",
"Node1362":"test",
"Node1378":"test",
"Node1381":"test",
"Node1397":"test",
"Node140":"test",
"Node1404":"test",
"Node1411":"test",
"Node1418":"test",
"Node1425":"test",
"Node146":"test",
"Node165":"test",
"Node173":"test",
"Node192":"test",
"Node242":"test",
"Node268":"test",
"Node293":"test",
"Node294":"test",
"Node328":"test",
"Node423":"test",
"Node437":"test",
"Node446":"test",
"Node454":"test",
"Node455":"test",
"Node463":"test",
"Node471":"test",
"Node500":"test",
"Node506":"test",
"Node51":"test",
"Node512":"test",
"Node515":"test",
"Node595":"test",
"Node618":"test",
"Node619":"test",
"Node625":"test",
"Node626":"test",
"Node636":"test",
"Node639":"test",
"Node648":"test",
"Node651":"test",
"Node658":"test",
"Node659":"test",
"Node725":"test",
"Node728":"test",
"Node731":"test",
"Node734":"test",
"Node746":"test",
"Node755":"test",
"Node760":"test",
"Node763":"test",
"Node769":"test",
"Node776":"test",
"Node779":"test",
"Node790":"test",
"Node796":"test",
"Node797":"test",
"Node802":"test",
"Node807":"test",
"Node808":"test",
"Node813":"test",
"Node832":"test",
"Node850":"test",
"Node871":"test",
"Node872":"test",
"Node876":"test",
"Node879":"test",
"Node882":"test",
"Node885":"test",
"Node891":"test",
"Node894":"test",
"Node898":"test",
"Node939":"test",
"Node971":"test",
"Node976":"test",
"Node984":"test",
"epi_isl_406036_California_20200122_null_1":"background",
"epi_isl_411951_Sweden_20200207_null_1":"background",
"epi_isl_413485_Anhui_20200124_null_2":"background",
"epi_isl_413523_Kerala_20200131_null_1":"background",
"epi_isl_413695_China_20200101_null_1":"background",
"epi_isl_413749_China_20200201_null_1":"background",
"epi_isl_413898_Guangdong_20200228_null_1":"background",
"epi_isl_413931_California_20200305_null_2":"background",
"epi_isl_414379_Singapore_20200218_null_1":"background",
"epi_isl_414567_Hong_Kong_20200210_null_1":"background",
"epi_isl_415149_England_20200301_null_1":"background",
"epi_isl_415519_Noord_Brabant_20200101_null_2":"background",
"epi_isl_415592_Washington_20200309_null_1":"background",
"epi_isl_415593_Washington_20200310_null_1":"background",
"epi_isl_416347_Shanghai_20200206_null_1":"background",
"epi_isl_416348_Shanghai_20200206_null_4":"background",
"epi_isl_416349_Shanghai_20200130_null_1":"background",
"epi_isl_416386_Shanghai_20200131_null_1":"background",
"epi_isl_416396_Shanghai_20200210_null_1":"background",
"epi_isl_416414_Victoria_20200306_null_1":"background",
"epi_isl_416670_Washington_20200312_null_1":"background",
"epi_isl_416679_Washington_20200311_null_1":"background",
"epi_isl_416682_USA_20200309_null_1":"background",
"epi_isl_416689_Washington_20200314_null_2":"background",
"epi_isl_417107_Washington_20200305_null_2":"background",
"epi_isl_417117_Washington_20200303_null_1":"background",
"epi_isl_417149_Washington_20200228_null_2":"background",
"epi_isl_417150_Washington_20200228_null_1":"background",
"epi_isl_417238_England_20200303_null_1":"background",
"epi_isl_417242_England_20200303_null_1":"background",
"epi_isl_417261_England_20200306_null_1":"background",
"epi_isl_417324_California_20200304_null_1":"background",
"epi_isl_417368_USA_20200313_null_2":"background",
"epi_isl_417518_Taoyuan_20200204_null_1":"background",
"epi_isl_417530_Luxembourg_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_417556_Reykjavik_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_417577_Reykjavik_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_417826_Reykjavik_20200316_null_3":"background",
"epi_isl_417955_Kinshasa_20200321_null_2":"background",
"epi_isl_418099_Wales_20200313_null_1":"background",
"epi_isl_418101_Wales_20200315_null_1":"background",
"epi_isl_418116_Wales_20200313_null_1":"background",
"epi_isl_418217_Mbour_20200313_null_1":"background",
"epi_isl_418333_Ontario_20200310_null_1":"background",
"epi_isl_418342_Ontario_20200311_null_1":"background",
"epi_isl_418368_Ontario_20200312_null_1":"background",
"epi_isl_418421_ARA_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_418503_Hangzhou_20200122_null_1":"background",
"epi_isl_418697_England_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_418731_England_20200313_null_2":"background",
"epi_isl_418732_England_20200313_null_1":"background",
"epi_isl_418830_British_Columbia_20200309_null_1":"background",
"epi_isl_418883_Washington_20200314_null_1":"background",
"epi_isl_418890_Washington_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_418939_Washington_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_418974_New_York_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_419249_Hong_Kong_20200225_null_1":"background",
"epi_isl_419252_Hong_Kong_20200226_null_2":"background",
"epi_isl_419253_Hong_Kong_20200226_null_1":"background",
"epi_isl_419416_Wales_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_419466_Wales_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_419473_Wales_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_419578_Luxembourg_20200308_null_1":"background",
"epi_isl_419692_Belarus_20200301_null_1":"background",
"epi_isl_419801_Victoria_20200315_null_1":"background",
"epi_isl_419820_Victoria_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_419848_Victoria_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_419887_Victoria_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_419923_Victoria_20200320_null_2":"background",
"epi_isl_420006_Victoria_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_420026_Virginia_20200327_null_3":"background",
"epi_isl_420090_New_York_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_420103_Singapore_20200305_null_1":"background",
"epi_isl_420195_England_20200328_null_2":"background",
"epi_isl_420528_England_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_420540_Estonia_20200301_null_1":"background",
"epi_isl_420542_England_20200322_null_1":"background",
"epi_isl_420634_England_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_420756_England_20200327_null_2":"background",
"epi_isl_420784_Arizona_20200302_null_1":"background",
"epi_isl_420789_Illinois_20200301_null_1":"background",
"epi_isl_420916_Wales_20200314_null_1":"background",
"epi_isl_420917_Wales_20200315_null_1":"background",
"epi_isl_420932_Wales_20200321_null_3":"background",
"epi_isl_420980_Wales_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_421175_Madrid_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_421178_Madrid_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_421221_Hangzhou_20200315_null_1":"background",
"epi_isl_421245_Jiangxi_20200125_null_1":"background",
"epi_isl_421317_Wisconsin_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_421510_Hauts_de_France_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_421665_India_20200310_null_1":"background",
"epi_isl_421827_England_20200324_null_2":"background",
"epi_isl_421860_England_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_421864_England_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_421866_England_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_421892_England_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_421906_England_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_421915_England_20200327_null_2":"background",
"epi_isl_421931_England_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_421939_England_20200401_null_2":"background",
"epi_isl_421955_England_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_422003_England_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_422043_Wales_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_422080_Wales_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_422114_Wales_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_422119_Wales_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_422148_Wales_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_422149_Wales_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_422177_Wales_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_422178_Wales_20200330_null_2":"background",
"epi_isl_422260_Wales_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_422265_Wales_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_422304_Wales_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_422312_Wales_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_422369_Wales_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_422372_Wales_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_422384_Greater_Accra_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_422465_Wisconsin_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_422571_Friesland_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_422578_Netherlands_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_422606_Netherlands_20200401_null_2":"background",
"epi_isl_422675_Netherlands_20200310_null_4":"background",
"epi_isl_422751_Netherlands_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_422884_Noord_Brabant_20200101_null_1":"background",
"epi_isl_422908_Zuid_Holland_20200317_null_4":"background",
"epi_isl_423017_Washington_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_423061_England_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_423062_England_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_423091_England_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_423112_England_20200324_null_2":"background",
"epi_isl_423121_England_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_423145_England_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_423147_England_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_423247_England_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_423282_England_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_423312_England_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_423339_England_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_423385_England_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_423399_England_20200329_null_3":"background",
"epi_isl_423426_England_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_423531_England_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_423549_England_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_423569_England_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_423570_England_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_423593_England_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_423598_England_20200321_null_1":"background",
"epi_isl_423656_England_20200322_null_1":"background",
"epi_isl_423659_England_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_423687_England_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_423709_England_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_423743_England_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_423758_England_20200322_null_1":"background",
"epi_isl_423779_England_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_423814_England_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_423870_England_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_423875_England_20200318_null_2":"background",
"epi_isl_423888_England_20200318_null_2":"background",
"epi_isl_423958_England_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_423967_England_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_424026_England_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_424088_England_20200313_null_6":"background",
"epi_isl_424131_England_20200321_null_1":"background",
"epi_isl_424142_England_20200321_null_1":"background",
"epi_isl_424144_England_20200321_null_1":"background",
"epi_isl_424146_England_20200321_null_1":"background",
"epi_isl_424148_England_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_424154_England_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_424199_Washington_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_424213_Washington_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_424298_Washington_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_424343_Rome_20200323_null_7":"background",
"epi_isl_424375_Reykjavik_20200301_null_1":"background",
"epi_isl_424408_Reykjavik_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_424462_Reykjavik_20200320_null_9":"background",
"epi_isl_424480_Reykjavik_20200320_null_7":"background",
"epi_isl_424548_Reykjavik_20200301_null_2":"background",
"epi_isl_424594_Reykjavik_20200301_null_3":"background",
"epi_isl_424606_Reykjavik_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_424661_Li_ge_20200405_null_2":"background",
"epi_isl_424848_Arizona_20200309_null_1":"background",
"epi_isl_424852_District_of_Columbia_20200306_null_1":"background",
"epi_isl_424863_Georgia_20200301_null_1":"background",
"epi_isl_424942_New_York_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_425134_Duesseldorf_20200311_null_1":"background",
"epi_isl_425163_Wisconsin_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_425173_Wisconsin_20200330_null_3":"background",
"epi_isl_425190_Comunitat_Valenciana_20200316_null_2":"background",
"epi_isl_425255_England_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_425505_England_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_425682_Scotland_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_425721_Scotland_20200317_null_2":"background",
"epi_isl_425821_Scotland_20200311_null_2":"background",
"epi_isl_425915_Scotland_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_426070_Idaho_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_426082_Washington_20200325_null_2":"background",
"epi_isl_426120_Washington_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_426299_New_York_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_426444_Washington_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_426482_Montevideo_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_426502_Arizona_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_426649_Victoria_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_426674_Victoria_20200322_null_2":"background",
"epi_isl_426697_Victoria_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_426712_Victoria_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_426742_Victoria_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_426757_Victoria_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_426768_Victoria_20200323_null_2":"background",
"epi_isl_426780_Victoria_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_426784_Victoria_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_426788_Victoria_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_426827_Victoria_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_426869_Victoria_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_426952_Victoria_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_427004_Victoria_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_427061_Victoria_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_427082_Victoria_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_427123_Victoria_20200405_null_5":"background",
"epi_isl_427156_Victoria_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_427161_Connecticut_20200325_null_2":"background",
"epi_isl_427172_Idaho_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_427204_Washington_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_427209_Washington_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_427246_Washington_20200331_null_3":"background",
"epi_isl_427291_Ohio_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_427417_Doha_20200323_null_5":"background",
"epi_isl_427601_New_York_20200316_null_5":"background",
"epi_isl_427641_New_York_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_427690_New_South_Wales_20200321_null_1":"background",
"epi_isl_427724_New_South_Wales_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_427730_New_South_Wales_20200317_null_2":"background",
"epi_isl_428271_Wisconsin_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_428301_Wisconsin_20200325_null_2":"background",
"epi_isl_428347_Ile_De_France_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_428405_Connecticut_20200411_null_2":"background",
"epi_isl_428456_Guangdong_20200122_null_1":"background",
"epi_isl_428461_Guangdong_20200124_null_4":"background",
"epi_isl_428706_Madrid_20200321_null_2":"background",
"epi_isl_428771_New_York_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_428836_Singapore_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_428879_Sverdlovsk_Region_20200319_null_3":"background",
"epi_isl_428923_Sverdlovsk_Region_20200327_null_3":"background",
"epi_isl_429001_California_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_429041_California_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_429061_California_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_429103_Guangzhou_20200209_null_1":"background",
"epi_isl_429177_Bangkok_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_429206_Switzerland_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_429233_Abruzzo_20200324_null_3":"background",
"epi_isl_429328_Unknown_20200315_null_1":"background",
"epi_isl_429370_Unknown_20200309_null_1":"background",
"epi_isl_429636_Washington_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_429643_USA_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_429674_Minas_gerais_20200311_null_1":"background",
"epi_isl_429702_Minas_gerais_20200322_null_4":"background",
"epi_isl_429774_Luxembourg_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_430129_Washington_20200306_null_4":"background",
"epi_isl_430137_Washington_20200321_null_1":"background",
"epi_isl_430152_Washington_20200305_null_1":"background",
"epi_isl_430200_Washington_20200304_null_2":"background",
"epi_isl_430290_Washington_20200302_null_1":"background",
"epi_isl_430330_New_York_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_430340_New_York_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_430357_New_York_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_430379_New_York_20200407_null_2":"background",
"epi_isl_430401_Connecticut_20200410_null_6":"background",
"epi_isl_430423_New_York_20200411_null_3":"background",
"epi_isl_430443_Malaysia_20200128_null_1":"background",
"epi_isl_430467_West_Bengal_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_430475_Victoria_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_430477_Victoria_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_430478_Victoria_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_430479_Victoria_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_430492_Victoria_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_430493_Victoria_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_430577_Victoria_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_430588_Victoria_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_430592_Victoria_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_430601_Victoria_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_430606_Victoria_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_430610_Victoria_20200408_null_2":"background",
"epi_isl_430613_Victoria_20200410_null_1":"background",
"epi_isl_430665_Victoria_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_430671_Victoria_20200404_null_1":"background",
"epi_isl_430675_Victoria_20200411_null_1":"background",
"epi_isl_430685_Victoria_20200404_null_1":"background",
"epi_isl_430705_Victoria_20200410_null_1":"background",
"epi_isl_430712_Victoria_20200409_null_1":"background",
"epi_isl_430793_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200301_null_1":"background",
"epi_isl_430805_Buenos_Aires_20200401_null_3":"background",
"epi_isl_430815_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200418_null_1":"background",
"epi_isl_430942_Idaho_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_431092_Connecticut_20200413_null_1":"background",
"epi_isl_431916_Wales_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_431950_Wales_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_431951_Wales_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_431962_Wales_20200331_null_4":"background",
"epi_isl_431970_Wales_20200301_null_1":"background",
"epi_isl_431974_Wales_20200404_null_1":"background",
"epi_isl_432000_Wales_20200330_null_2":"background",
"epi_isl_432013_Wales_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_432016_Wales_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_432022_Wales_20200331_null_2":"background",
"epi_isl_432054_Wales_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_432115_Wales_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_432198_Wales_20200330_null_2":"background",
"epi_isl_432416_Wales_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_432448_Wales_20200401_null_7":"background",
"epi_isl_432548_England_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_432899_Scotland_20200406_null_4":"background",
"epi_isl_432999_England_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_433191_Scotland_20200419_null_1":"background",
"epi_isl_433202_Scotland_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_433232_Scotland_20200402_null_6":"background",
"epi_isl_433275_Scotland_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_433279_Scotland_20200320_null_8":"background",
"epi_isl_433336_Scotland_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_433348_Scotland_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_433567_Scotland_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_433580_Scotland_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_433687_England_20200101_null_1":"background",
"epi_isl_433696_England_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_433771_England_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_433866_England_20200408_null_3":"background",
"epi_isl_433904_England_20200410_null_1":"background",
"epi_isl_433908_England_20200411_null_2":"background",
"epi_isl_433922_England_20200411_null_1":"background",
"epi_isl_433981_England_20200413_null_1":"background",
"epi_isl_434007_England_20200101_null_1":"background",
"epi_isl_434084_Washington_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_434085_Washington_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_434119_Washington_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_434170_Washington_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_434181_Washington_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_434299_Washington_20200323_null_3":"background",
"epi_isl_434322_Washington_20200324_null_2":"background",
"epi_isl_434544_Puerto_Rico_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_434547_Puerto_Rico_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_434556_Manila_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_434591_Virginia_20200410_null_2":"background",
"epi_isl_434657_Skane_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_434683_Maryland_20200314_null_8":"background",
"epi_isl_434711_Kinshasa_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_434772_Texas_20200318_null_2":"background",
"epi_isl_434878_Texas_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_434946_Texas_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_435017_Texas_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_435025_Texas_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_435038_Louisiana_20200413_null_1":"background",
"epi_isl_435040_Louisiana_20200415_null_2":"background",
"epi_isl_435045_Nur_Sultan_20200322_null_1":"background",
"epi_isl_435059_EC_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_435082_Uttar_Pradesh_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_435108_Delhi_20200315_null_1":"background",
"epi_isl_435121_United_Arab_Emirates_20200225_null_1":"background",
"epi_isl_435147_Abruzzo_20200408_null_2":"background",
"epi_isl_435151_Abruzzo_20200408_null_2":"background",
"epi_isl_435287_Israel_20200301_null_1":"background",
"epi_isl_435416_Baranya_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_435467_Louisiana_20200331_null_3":"background",
"epi_isl_435474_California_20200429_null_1":"background",
"epi_isl_435482_New_York_20200330_null_2":"background",
"epi_isl_435522_New_York_20200420_null_1":"background",
"epi_isl_435542_New_York_20200422_null_1":"background",
"epi_isl_435620_California_20200309_null_3":"background",
"epi_isl_435631_California_20200311_null_6":"background",
"epi_isl_435640_California_20200312_null_2":"background",
"epi_isl_435680_Singapore_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_435697_Singapore_20200318_null_4":"background",
"epi_isl_436141_Karnataka_20200424_null_4":"background",
"epi_isl_436234_Comunitat_Valenciana_20200318_null_2":"background",
"epi_isl_436247_Comunitat_Valenciana_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_436260_Comunitat_Valenciana_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_436278_Comunitat_Valenciana_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_436304_Comunitat_Valenciana_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_436340_Comunitat_Valenciana_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_436346_Comunitat_Valenciana_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_436389_Comunitat_Valenciana_20200317_null_3":"background",
"epi_isl_436432_Delhi_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_436435_Delhi_20200409_null_1":"background",
"epi_isl_436436_Delhi_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_436437_Delhi_20200408_null_2":"background",
"epi_isl_436445_Delhi_20200409_null_1":"background",
"epi_isl_436449_Bihar_20200412_null_2":"background",
"epi_isl_436450_Delhi_20200413_null_5":"background",
"epi_isl_436451_Delhi_20200413_null_2":"background",
"epi_isl_436454_Delhi_20200413_null_1":"background",
"epi_isl_436463_Madhya_Pradesh_20200416_null_1":"background",
"epi_isl_436553_Florida_20200417_null_3":"background",
"epi_isl_436648_California_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_436684_KZN_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_436689_Victoria_20200323_null_3":"background",
"epi_isl_436717_Moscow_20200414_null_3":"background",
"epi_isl_436719_Abruzzo_20200320_null_2":"background",
"epi_isl_436887_Michigan_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_436961_LA_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_437056_California_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_437066_California_20200416_null_1":"background",
"epi_isl_437101_Michigan_20200312_null_1":"background",
"epi_isl_437120_Michigan_20200318_null_6":"background",
"epi_isl_437123_Michigan_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_437128_Michigan_20200319_null_2":"background",
"epi_isl_437151_Michigan_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_437155_Michigan_20200322_null_2":"background",
"epi_isl_437221_Bavaria_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_437359_Bavaria_20200314_null_7":"background",
"epi_isl_437374_Minnesota_20200410_null_1":"background",
"epi_isl_437451_Gujarat_20200426_null_1":"background",
"epi_isl_437467_Makkah_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_437547_Louisiana_20200331_null_2":"background",
"epi_isl_437563_California_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_437566_California_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_437574_California_20200407_null_7":"background",
"epi_isl_437641_Unknown_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_437715_Madinah_20200414_null_4":"background",
"epi_isl_437805_Washington_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_437812_Washington_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_437861_Washington_20200404_null_7":"background",
"epi_isl_437909_Athens_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_437912_Dhaka_20200418_null_2":"background",
"epi_isl_437971_Innsbruck_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_438092_Vienna_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_438110_Vienna_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_438141_Washington_20200402_null_5":"background",
"epi_isl_438175_Washington_20200429_null_2":"background",
"epi_isl_438204_Washington_20200420_null_2":"background",
"epi_isl_438211_Washington_20200421_null_10":"background",
"epi_isl_438217_Washington_20200422_null_5":"background",
"epi_isl_438219_Washington_20200422_null_1":"background",
"epi_isl_438220_Washington_20200421_null_8":"background",
"epi_isl_438221_Washington_20200422_null_1":"background",
"epi_isl_438230_District_of_Columbia_20200311_null_13":"background",
"epi_isl_438241_Maryland_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_438355_England_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_438381_England_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_438417_England_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_438463_England_20200328_null_2":"background",
"epi_isl_438495_England_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_438526_England_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_438534_England_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_438599_England_20200422_null_3":"background",
"epi_isl_438608_England_20200420_null_9":"background",
"epi_isl_438610_England_20200421_null_4":"background",
"epi_isl_438620_England_20200421_null_1":"background",
"epi_isl_438648_England_20200423_null_4":"background",
"epi_isl_438691_England_20200424_null_1":"background",
"epi_isl_438715_England_20200425_null_7":"background",
"epi_isl_438732_England_20200426_null_1":"background",
"epi_isl_438788_Scotland_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_438793_Scotland_20200331_null_2":"background",
"epi_isl_438796_Scotland_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_438825_Scotland_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_438842_Scotland_20200404_null_9":"background",
"epi_isl_438905_Scotland_20200414_null_1":"background",
"epi_isl_438909_Scotland_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_438961_Kanto_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_438998_Scotland_20200422_null_1":"background",
"epi_isl_439001_Scotland_20200422_null_15":"background",
"epi_isl_439007_Scotland_20200424_null_1":"background",
"epi_isl_439019_Scotland_20200423_null_2":"background",
"epi_isl_439037_Scotland_20200424_null_1":"background",
"epi_isl_439042_Scotland_20200425_null_1":"background",
"epi_isl_439100_Scotland_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_439102_Scotland_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_439142_Scotland_20200329_null_9":"background",
"epi_isl_439146_Scotland_20200407_null_3":"background",
"epi_isl_439152_Scotland_20200419_null_1":"background",
"epi_isl_439185_Scotland_20200422_null_1":"background",
"epi_isl_439209_Scotland_20200422_null_1":"background",
"epi_isl_439235_Scotland_20200424_null_1":"background",
"epi_isl_439327_Scotland_20200430_null_2":"background",
"epi_isl_439380_England_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_439441_England_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_439462_England_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_439466_England_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_439490_England_20200331_null_8":"background",
"epi_isl_439510_England_20200331_null_8":"background",
"epi_isl_439548_England_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_439562_England_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_439580_England_20200323_null_2":"background",
"epi_isl_439600_England_20200321_null_1":"background",
"epi_isl_439652_England_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_439669_Scotland_20200430_null_1":"background",
"epi_isl_439685_England_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_439728_England_20200408_null_5":"background",
"epi_isl_439729_England_20200408_null_2":"background",
"epi_isl_439738_England_20200408_null_2":"background",
"epi_isl_439831_England_20200414_null_1":"background",
"epi_isl_439856_England_20200417_null_1":"background",
"epi_isl_439889_England_20200324_null_2":"background",
"epi_isl_439896_England_20200329_null_8":"background",
"epi_isl_439912_England_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_439945_England_20200323_null_3":"background",
"epi_isl_440003_England_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_440056_England_20200321_null_6":"background",
"epi_isl_440084_England_20200322_null_1":"background",
"epi_isl_440085_England_20200321_null_1":"background",
"epi_isl_440152_England_20200321_null_3":"background",
"epi_isl_440178_England_20200309_null_3":"background",
"epi_isl_440216_England_20200311_null_2":"background",
"epi_isl_440278_England_20200321_null_1":"background",
"epi_isl_440309_England_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_440354_England_20200319_null_2":"background",
"epi_isl_440366_England_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_440382_England_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_440390_England_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_440504_England_20200303_null_1":"background",
"epi_isl_440511_England_20200312_null_15":"background",
"epi_isl_440515_England_20200311_null_2":"background",
"epi_isl_440612_England_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_440617_England_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_440680_England_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_440722_England_20200405_null_2":"background",
"epi_isl_440740_England_20200405_null_3":"background",
"epi_isl_440816_England_20200403_null_2":"background",
"epi_isl_440824_England_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_440860_England_20200416_null_14":"background",
"epi_isl_440875_England_20200423_null_2":"background",
"epi_isl_440891_England_20200421_null_1":"background",
"epi_isl_440916_England_20200420_null_2":"background",
"epi_isl_440930_England_20200424_null_24":"background",
"epi_isl_441021_England_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_441060_England_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_441068_England_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_441129_England_20200402_null_2":"background",
"epi_isl_441130_England_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_441135_England_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_441136_England_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_441146_England_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_441209_England_20200403_null_3":"background",
"epi_isl_441246_England_20200401_null_2":"background",
"epi_isl_441273_England_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_441325_England_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_441385_Northern_Ireland_20200321_null_1":"background",
"epi_isl_441431_Northern_Ireland_20200317_null_2":"background",
"epi_isl_441449_England_20200409_null_6":"background",
"epi_isl_441462_England_20200414_null_1":"background",
"epi_isl_441548_England_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_441559_England_20200406_null_2":"background",
"epi_isl_441640_England_20200405_null_3":"background",
"epi_isl_441693_Northern_Ireland_20200406_null_2":"background",
"epi_isl_441707_England_20200406_null_5":"background",
"epi_isl_441798_England_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_441810_England_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_441861_England_20200420_null_1":"background",
"epi_isl_441871_England_20200429_null_1":"background",
"epi_isl_441881_England_20200430_null_10":"background",
"epi_isl_441893_England_20200430_null_1":"background",
"epi_isl_441944_England_20200419_null_2":"background",
"epi_isl_441974_England_20200408_null_2":"background",
"epi_isl_442000_England_20200409_null_1":"background",
"epi_isl_442060_England_20200404_null_1":"background",
"epi_isl_442065_England_20200404_null_1":"background",
"epi_isl_442103_England_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_442108_England_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_442149_England_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_442163_England_20200404_null_2":"background",
"epi_isl_442180_England_20200404_null_1":"background",
"epi_isl_442189_England_20200406_null_2":"background",
"epi_isl_442196_England_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_442198_England_20200404_null_2":"background",
"epi_isl_442199_England_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_442202_England_20200406_null_2":"background",
"epi_isl_442215_England_20200405_null_4":"background",
"epi_isl_442226_England_20200406_null_5":"background",
"epi_isl_442234_England_20200406_null_2":"background",
"epi_isl_442248_England_20200404_null_1":"background",
"epi_isl_442260_England_20200405_null_2":"background",
"epi_isl_442261_England_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_442330_England_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_442351_England_20200410_null_1":"background",
"epi_isl_442393_England_20200409_null_1":"background",
"epi_isl_442517_England_20200409_null_3":"background",
"epi_isl_442524_England_20200412_null_1":"background",
"epi_isl_442533_England_20200407_null_3":"background",
"epi_isl_442564_England_20200411_null_72":"background",
"epi_isl_442581_England_20200411_null_1":"background",
"epi_isl_442587_England_20200411_null_8":"background",
"epi_isl_442593_England_20200409_null_1":"background",
"epi_isl_442601_England_20200407_null_4":"background",
"epi_isl_442605_England_20200411_null_9":"background",
"epi_isl_442614_England_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_442654_England_20200407_null_3":"background",
"epi_isl_442663_England_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_442694_England_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_442715_England_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_442731_England_20200406_null_3":"background",
"epi_isl_442739_England_20200405_null_14":"background",
"epi_isl_442773_England_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_442794_England_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_442797_England_20200407_null_3":"background",
"epi_isl_442841_England_20200408_null_21":"background",
"epi_isl_442886_England_20200410_null_5":"background",
"epi_isl_442926_England_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_442934_England_20200410_null_1":"background",
"epi_isl_442948_England_20200411_null_1":"background",
"epi_isl_442967_England_20200408_null_3":"background",
"epi_isl_442978_England_20200407_null_3":"background",
"epi_isl_442980_England_20200412_null_1":"background",
"epi_isl_442991_England_20200410_null_3":"background",
"epi_isl_443096_England_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_443107_England_20200411_null_3":"background",
"epi_isl_443181_Jeddah_20200401_null_4":"background",
"epi_isl_443203_Singapore_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_443225_Singapore_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_443228_Singapore_20200318_null_3":"background",
"epi_isl_443246_Singapore_20200408_null_4":"background",
"epi_isl_443256_Minnesota_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_443260_Ile_de_France_20200402_null_40":"background",
"epi_isl_443266_Bretagne_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_443267_Bretagne_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_443299_Ile_de_France_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_443310_Grand_Est_20200320_null_4":"background",
"epi_isl_443381_England_20200412_null_10":"background",
"epi_isl_443389_England_20200414_null_5":"background",
"epi_isl_443398_England_20200414_null_1":"background",
"epi_isl_443435_England_20200415_null_1":"background",
"epi_isl_443441_England_20200417_null_5":"background",
"epi_isl_443442_England_20200417_null_8":"background",
"epi_isl_443444_England_20200414_null_1":"background",
"epi_isl_443445_England_20200416_null_1":"background",
"epi_isl_443450_England_20200414_null_2":"background",
"epi_isl_443475_England_20200413_null_2":"background",
"epi_isl_443494_England_20200414_null_1":"background",
"epi_isl_443508_England_20200413_null_5":"background",
"epi_isl_443524_England_20200413_null_13":"background",
"epi_isl_443554_England_20200417_null_12":"background",
"epi_isl_443582_England_20200414_null_25":"background",
"epi_isl_443606_England_20200414_null_2":"background",
"epi_isl_443607_England_20200414_null_3":"background",
"epi_isl_443615_England_20200414_null_5":"background",
"epi_isl_443618_England_20200414_null_11":"background",
"epi_isl_443674_England_20200413_null_1":"background",
"epi_isl_443702_England_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_443729_England_20200326_null_2":"background",
"epi_isl_443764_England_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_443769_England_20200325_null_28":"background",
"epi_isl_443773_England_20200326_null_2":"background",
"epi_isl_443787_England_20200326_null_3":"background",
"epi_isl_443802_England_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_443824_England_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_443851_England_20200330_null_5":"background",
"epi_isl_443876_England_20200330_null_23":"background",
"epi_isl_443895_England_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_443935_England_20200329_null_2":"background",
"epi_isl_443957_England_20200327_null_2":"background",
"epi_isl_443969_England_20200327_null_2":"background",
"epi_isl_443971_England_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_443990_England_20200326_null_2":"background",
"epi_isl_444058_California_20200428_null_1":"background",
"epi_isl_444068_California_20200430_null_1":"background",
"epi_isl_444085_England_20200404_null_49":"background",
"epi_isl_444096_England_20200406_null_7":"background",
"epi_isl_444117_England_20200406_null_17":"background",
"epi_isl_444129_England_20200408_null_4":"background",
"epi_isl_444132_England_20200408_null_10":"background",
"epi_isl_444142_England_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_444177_England_20200411_null_1":"background",
"epi_isl_444193_England_20200414_null_4":"background",
"epi_isl_444197_England_20200413_null_9":"background",
"epi_isl_444206_England_20200415_null_3":"background",
"epi_isl_444230_England_20200416_null_3":"background",
"epi_isl_444235_England_20200416_null_1":"background",
"epi_isl_444240_England_20200418_null_5":"background",
"epi_isl_444255_England_20200419_null_1":"background",
"epi_isl_444273_Guangdong_20200205_null_23":"background",
"epi_isl_444331_England_20200428_null_4":"background",
"epi_isl_444366_England_20200427_null_1":"background",
"epi_isl_444395_England_20200410_null_7":"background",
"epi_isl_444403_England_20200418_null_6":"background",
"epi_isl_444424_England_20200419_null_1":"background",
"epi_isl_444435_England_20200418_null_6":"background",
"epi_isl_444437_England_20200418_null_22":"background",
"epi_isl_444451_England_20200415_null_246":"background",
"epi_isl_444467_Gujarat_20200429_null_1":"background",
"epi_isl_444480_Gujarat_20200430_null_3":"background",
"epi_isl_444491_Stockholm_20200301_null_4":"background",
"epi_isl_444493_Montevideo_20200313_null_39":"background",
"epi_isl_444525_Illinois_20200315_null_23":"background",
"epi_isl_444532_Illinois_20200315_null_21":"background",
"epi_isl_444541_Illinois_20200316_null_10":"background",
"epi_isl_444549_Illinois_20200315_null_1":"background",
"epi_isl_444593_Illinois_20200320_null_2":"background",
"epi_isl_444606_Illinois_20200320_null_21":"background",
"epi_isl_444653_New_York_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_444679_New_York_20200330_null_2":"background",
"epi_isl_444687_New_York_20200330_null_12":"background",
"epi_isl_444711_New_York_20200402_null_8":"background",
"epi_isl_444745_New_York_20200402_null_13":"background",
"epi_isl_444753_New_York_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_444768_New_York_20200406_null_38":"background",
"epi_isl_444781_New_York_20200318_null_2":"background",
"epi_isl_444786_New_York_20200317_null_671":"background",
"epi_isl_444794_Queensland_20200326_null_21":"background",
"epi_isl_444831_Unknown_20200311_null_1":"background",
"epi_isl_444848_Unknown_20200331_null_4":"background",
"epi_isl_444914_Unknown_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_444917_Unknown_20200328_null_75":"background",
"epi_isl_444988_Catalonia_20200328_null_4":"background",
"epi_isl_445011_Florida_20200417_null_2":"background",
"epi_isl_445024_Florida_20200430_null_1":"background",
"epi_isl_445037_Florida_20200428_null_3":"background",
"epi_isl_445038_Florida_20200428_null_5":"background",
"epi_isl_445058_Luxembourg_20200422_null_1":"background",
"epi_isl_445075_Luxembourg_20200508_null_4":"background",
"epi_isl_445076_Luxembourg_20200422_null_27":"background",
"epi_isl_445078_Texas_20200320_null_21":"background",
"epi_isl_445105_California_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_445113_California_20200328_null_7":"background",
"epi_isl_445158_Louisiana_20200408_null_8":"background",
"epi_isl_445164_California_20200321_null_21":"background",
"epi_isl_445170_California_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_445171_California_20200327_null_19114":"background",
"epi_isl_445172_California_20200325_null_1144":"background",
"epi_isl_445180_California_20200330_null_2":"background"
}
},
"timers":{
"Model fitting":{
"order":1,
"timer":23
},
"Primary SLAC analysis":{
"order":2,
"timer":15
},
"Total time":{
"order":0,
"timer":40
}
}
}